More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1265 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010320  Teth514_0416  aconitate hydratase  58.31 
 
 		 639 aa  732    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2445  aconitate hydratase  81.71 
 
 		 645 aa  1119    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.430041  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0585  aconitate hydratase  56.39 
 
 		 645 aa  724    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.674704  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1612  aconitate hydratase  77.55 
 
 		 646 aa  1054    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3767  aconitate hydratase  54.91 
 
 		 640 aa  727    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1966  aconitate hydratase  77.85 
 
 		 648 aa  1056    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2707  aconitate hydratase  55.9 
 
 		 660 aa  734    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0524  aconitate hydratase  56.32 
 
 		 643 aa  736    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000206753  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2450  aconitate hydratase  67.86 
 
 		 644 aa  924    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4768  aconitate hydratase  52.64 
 
 		 674 aa  677    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.682164  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2176  aconitate hydratase  53.2 
 
 		 642 aa  703    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0828952  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2763  aconitate hydratase  80.9 
 
 		 648 aa  1107    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1406  aconitate hydratase  52.89 
 
 		 643 aa  660    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.258962  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2258  aconitate hydratase  78.32 
 
 		 648 aa  1056    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1882  aconitate hydratase  55.69 
 
 		 641 aa  685    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.111034  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4932  aconitate hydratase  52.56 
 
 		 652 aa  672    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.450299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0020  aconitate hydratase  55.59 
 
 		 644 aa  705    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2774  aconitate hydratase  53.78 
 
 		 661 aa  701    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1336  aconitate hydratase  50.39 
 
 		 656 aa  637    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23930  aconitate hydratase  52.41 
 
 		 649 aa  712    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.161871  normal  0.0821905 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3193  aconitate hydratase  52.49 
 
 		 640 aa  635    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.249489  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0606  aconitate hydratase  55.5 
 
 		 655 aa  722    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3640  aconitate hydratase  53.69 
 
 		 656 aa  708    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.506746  normal  0.0138117 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2824  aconitate hydratase  53.18 
 
 		 660 aa  659    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0285  aconitate hydratase  51.71 
 
 		 646 aa  659    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4177  aconitate hydratase  55.28 
 
 		 647 aa  719    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.13774  normal  0.304204 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2106  aconitate hydratase  69.16 
 
 		 645 aa  938    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.12781  normal  0.0131142 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05770  aconitate hydratase  52.94 
 
 		 647 aa  672    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.295611  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2153  aconitate hydratase  50.86 
 
 		 644 aa  663    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1803  aconitate hydratase  50.16 
 
 		 657 aa  637    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0423  aconitate hydratase  56.39 
 
 		 645 aa  724    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.82263  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0908  aconitate hydratase  54.63 
 
 		 668 aa  716    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.410888  normal  0.460369 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1930  aconitate hydratase  52.26 
 
 		 642 aa  658    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.221002  normal  0.0834672 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3383  aconitate hydratase  49.85 
 
 		 657 aa  638    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3158  aconitate hydratase  55.61 
 
 		 642 aa  731    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000107146  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5705  aconitate hydratase  55.49 
 
 		 659 aa  719    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.762683  hitchhiker  0.0051974 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1265  aconitate hydratase  100 
 
 		 644 aa  1321    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3021  aconitate hydratase  52.42 
 
 		 641 aa  627  1e-178  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1102  aconitate hydratase  48.75 
 
 		 642 aa  615  1e-175  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0597  aconitate hydratase  49.38 
 
 		 658 aa  614  9.999999999999999e-175  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.977117 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1771  aconitate hydratase  50.39 
 
 		 641 aa  611  1e-173  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0098  aconitate hydratase  48.32 
 
 		 661 aa  597  1e-169  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0971  aconitate hydratase  34.75 
 
 		 760 aa  345  1e-93  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1408  aconitate hydratase  34.76 
 
 		 755 aa  341  2e-92  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2025  aconitate hydratase  35.88 
 
 		 755 aa  342  2e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1208  aconitate hydratase  34.7 
 
 		 756 aa  334  2e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.2348  normal  0.0471939 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1482  aconitate hydratase  33.58 
 
 		 754 aa  334  3e-90  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03894  aconitate hydratase, mitochondrial, putative (Eurofung)  34.64 
 
 		 796 aa  330  5.0000000000000004e-89  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.26439  normal  0.611037 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2223  aconitate hydratase  33.93 
 
 		 755 aa  330  6e-89  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.274844  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01590  aconitate hydratase, putative  33.38 
 
 		 770 aa  326  9e-88  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00945  aconitate hydratase  35.24 
 
 		 755 aa  323  8e-87  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.181334  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0660  aconitate hydratase  33.11 
 
 		 758 aa  322  1.9999999999999998e-86  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2016  aconitate hydratase  34.44 
 
 		 757 aa  320  7.999999999999999e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00964954 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90724  aconitate hydratase  33.15 
 
 		 800 aa  317  3e-85  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.319181 
 
 
-
 
NC_006686  CND02620  aconitase, putative  33.99 
 
 		 792 aa  317  4e-85  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2702  aconitate hydratase  34.76 
 
 		 751 aa  316  9e-85  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1952  aconitate hydratase  32.7 
 
 		 765 aa  310  5e-83  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05300  aconitate hydratase, putative (Eurofung)  32.44 
 
 		 798 aa  309  1.0000000000000001e-82  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.29403  normal  1 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01770  aconitate hydratase, putative  32.97 
 
 		 787 aa  308  2.0000000000000002e-82  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.00912812  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85181  Aconitase, mitochondrial  33.28 
 
 		 780 aa  304  3.0000000000000004e-81  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.154992  normal  0.331758 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05525  Aconitase Fragment [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8J267]  34.2 
 
 		 783 aa  303  6.000000000000001e-81  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.842678 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0646  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  36.52 
 
 		 418 aa  261  2e-68  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00455068  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0621  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  36.52 
 
 		 418 aa  260  5.0000000000000005e-68  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0188797  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1100  3-isopropylmalate dehydratase  36.12 
 
 		 418 aa  246  9.999999999999999e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0448  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  36.67 
 
 		 417 aa  242  1e-62  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0425  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  37.14 
 
 		 431 aa  241  2.9999999999999997e-62  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_390  aconitase/homoaconitase/3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  36.67 
 
 		 417 aa  239  9e-62  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0402  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  33.41 
 
 		 418 aa  239  1e-61  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.344506 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2965  homoaconitase  30.1 
 
 		 655 aa  239  2e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.556593  normal  0.646893 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1630  3-isopropylmalate dehydratase  34.84 
 
 		 418 aa  237  6e-61  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2220  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  36.3 
 
 		 415 aa  236  9e-61  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1466  homoaconitate hydratase family protein  32.06 
 
 		 429 aa  226  8e-58  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0167474  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1588  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  34.37 
 
 		 419 aa  226  1e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2458  hypothetical protein  26.83 
 
 		 763 aa  223  7e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0160078  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88705  homoaconitase  27.86 
 
 		 677 aa  219  2e-55  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.933626  normal  0.508507 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2871  aconitate hydratase domain protein  26.82 
 
 		 753 aa  217  5e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0794  hypothetical protein  26.82 
 
 		 753 aa  217  5e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2891  hypothetical protein  26.96 
 
 		 753 aa  217  5e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0493763 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1704  homoaconitate hydratase family protein  32.21 
 
 		 419 aa  217  7e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0596  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  33.41 
 
 		 420 aa  217  7e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000659262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0825  hypothetical protein  27.06 
 
 		 761 aa  217  7e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.125653  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1036  homoaconitate hydratase family protein  34.36 
 
 		 418 aa  217  7e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0798  hypothetical protein  26.92 
 
 		 761 aa  216  9.999999999999999e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0978109  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1693  homoaconitate hydratase family protein  34.75 
 
 		 424 aa  216  9.999999999999999e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.27842  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0875  hypothetical protein  26.82 
 
 		 753 aa  214  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2728  3-isopropylmalate dehydratase  37.64 
 
 		 416 aa  214  4.9999999999999996e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1610  homoaconitate hydratase family protein  34.36 
 
 		 417 aa  213  9e-54  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2254  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  33.97 
 
 		 421 aa  212  2e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0442  3-isopropylmalate dehydratase  37.36 
 
 		 423 aa  211  2e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0357426 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2068  aconitate hydratase 1  28.29 
 
 		 855 aa  210  7e-53  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.461258  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1742  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  35.76 
 
 		 420 aa  209  1e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.482523  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0356  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  34.28 
 
 		 420 aa  208  2e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.928431  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1133  hypothetical protein  25.68 
 
 		 783 aa  208  3e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000753668  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1030  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  33.02 
 
 		 431 aa  207  4e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000620705 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1191  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  33.57 
 
 		 424 aa  207  5e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2485  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  33.1 
 
 		 424 aa  206  7e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.836058  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0289  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  31.76 
 
 		 425 aa  206  8e-52  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2075  3-isopropylmalate dehydratase  31.59 
 
 		 416 aa  206  8e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2361  homoaconitate hydratase family protein  33.18 
 
 		 417 aa  206  8e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.859627 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1792  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  35.24 
 
 		 418 aa  206  1e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.602442 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>