96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_5048 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_5048  protein of unknown function DUF81  100 
 
 
244 aa  440  1e-123  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05889  hypothetical protein  28.81 
 
 
240 aa  73.2  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1263  membrane protein  27.57 
 
 
242 aa  72.4  0.000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1803  hypothetical protein  28.57 
 
 
242 aa  71.6  0.00000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.426487  normal  0.0717892 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0558  hypothetical protein  27.08 
 
 
243 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3856  hypothetical protein  27.78 
 
 
241 aa  70.5  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.497532  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000279  hypothetical protein  29.1 
 
 
240 aa  69.3  0.00000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3173  hypothetical protein  28.33 
 
 
245 aa  68.6  0.00000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0676  hypothetical protein  33.75 
 
 
236 aa  65.9  0.0000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119238  normal  0.11063 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1919  hypothetical protein  37.4 
 
 
268 aa  65.5  0.0000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.28526  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22430  protein of unknown function DUF81  35.25 
 
 
238 aa  65.5  0.0000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.745875  normal  0.877077 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1706  hypothetical protein  32 
 
 
243 aa  64.3  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0821668  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0189  hypothetical protein  27.73 
 
 
240 aa  64.3  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2961  protein of unknown function DUF81  27.49 
 
 
248 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.6614 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0689  hypothetical protein  35.39 
 
 
253 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.309902  normal  0.362532 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1995  hypothetical protein  35.12 
 
 
255 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.204412  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0354  protein of unknown function DUF81  27.73 
 
 
239 aa  62.8  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4367  protein of unknown function DUF81  34.83 
 
 
253 aa  62  0.000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.688319 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3658  hypothetical protein  23.98 
 
 
241 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4058  hypothetical protein  25.43 
 
 
247 aa  60.8  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6207  hypothetical protein  34.13 
 
 
253 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.449503  normal  0.698789 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1149  protein of unknown function DUF81  33.6 
 
 
297 aa  60.1  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.702872 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0416  hypothetical protein  30.08 
 
 
242 aa  60.1  0.00000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  unclonable  0.0000000286057  normal  0.0207815 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0614  hypothetical protein  25.75 
 
 
247 aa  59.3  0.00000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1019  hypothetical protein  33.33 
 
 
240 aa  59.3  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.132736  normal  0.524557 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3553  hypothetical protein  25.64 
 
 
246 aa  58.9  0.00000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.767129  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1687  hypothetical protein  23.98 
 
 
241 aa  58.9  0.00000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1591  protein of unknown function DUF81  30.22 
 
 
247 aa  58.2  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0129546  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3616  hypothetical protein  26.18 
 
 
247 aa  58.2  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.632032  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0534  hypothetical protein  25.43 
 
 
247 aa  58.2  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0518  hypothetical protein  25.21 
 
 
246 aa  58.2  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0562  protein of unknown function DUF81  25.43 
 
 
247 aa  58.5  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3778  hypothetical protein  25.43 
 
 
247 aa  58.5  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4043  hypothetical protein  24.89 
 
 
244 aa  57.4  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3441  hypothetical protein  26.18 
 
 
247 aa  57.4  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0558  hypothetical protein  25 
 
 
247 aa  57.8  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4204  hypothetical protein  36.53 
 
 
174 aa  57  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4518  hypothetical protein  33.71 
 
 
255 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.535232 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0510  hypothetical protein  25.75 
 
 
247 aa  55.8  0.0000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3844  hypothetical protein  35.16 
 
 
235 aa  55.8  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2849  protein of unknown function DUF81  37.08 
 
 
261 aa  54.7  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5325  hypothetical membrane protein  29.06 
 
 
291 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.483179 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0440  hypothetical protein  33.2 
 
 
239 aa  54.3  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.871963  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1175  protein of unknown function DUF81  26.16 
 
 
257 aa  53.9  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.358804  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3303  hypothetical protein  30.36 
 
 
257 aa  54.3  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4529  hypothetical protein  31.36 
 
 
235 aa  53.9  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0620  hypothetical protein  27.42 
 
 
244 aa  53.1  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1485  hypothetical protein  31.82 
 
 
255 aa  52.8  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0160  hypothetical protein  34.52 
 
 
250 aa  52.4  0.000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0054  protein of unknown function DUF81  32.48 
 
 
255 aa  52.4  0.000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0506  hypothetical protein  36.78 
 
 
244 aa  51.6  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0953317  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3491  hypothetical protein  31.55 
 
 
242 aa  50.8  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.401485 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2748  hypothetical protein  22.9 
 
 
272 aa  50.4  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0652  hypothetical protein  28.89 
 
 
250 aa  51.2  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3771  hypothetical protein  32.14 
 
 
256 aa  50.8  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.777137  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0033  protein of unknown function DUF81  27.83 
 
 
241 aa  50.4  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.37483 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4163  hypothetical protein  25.75 
 
 
246 aa  50.4  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4296  hypothetical protein  28.21 
 
 
291 aa  49.7  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4342  hypothetical protein  28.21 
 
 
291 aa  49.7  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4251  putative domain of unknown function  28.21 
 
 
291 aa  49.7  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1794  hypothetical protein  21.34 
 
 
241 aa  48.9  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2275  hypothetical protein  32.23 
 
 
235 aa  48.9  0.00007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.188651 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2375  protein of unknown function DUF81  31.28 
 
 
251 aa  48.5  0.00009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4254  hypothetical protein  28.9 
 
 
245 aa  48.1  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.600925 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1898  protein of unknown function DUF81  25.2 
 
 
247 aa  48.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1737  hypothetical protein  21.14 
 
 
241 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.593381  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0613  hypothetical protein  24.55 
 
 
244 aa  47.4  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3342  hypothetical protein  31.93 
 
 
255 aa  46.6  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.321446  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0115  protein of unknown function DUF81  31.25 
 
 
262 aa  46.6  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.117057  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4756  hypothetical protein  31.31 
 
 
251 aa  45.8  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2380  hypothetical protein  31.45 
 
 
240 aa  45.8  0.0006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.333988 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0128  hypothetical protein  29.19 
 
 
258 aa  45.8  0.0006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1535  hypothetical protein  22.18 
 
 
241 aa  45.4  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.671723  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1943  hypothetical protein  26.32 
 
 
247 aa  45.4  0.0007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1504  membrane protein  21.95 
 
 
241 aa  45.4  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000123127  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2832  hypothetical protein  26.53 
 
 
246 aa  44.7  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0136  hypothetical protein  29.8 
 
 
262 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13510  protein of unknown function DUF81  27.93 
 
 
237 aa  45.1  0.001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0846  protein of unknown function DUF81  31.79 
 
 
261 aa  45.1  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22320  protein of unknown function DUF81  32.24 
 
 
255 aa  45.1  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1986  protein of unknown function DUF81  24.43 
 
 
251 aa  43.9  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.368291  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1751  protein of unknown function DUF81  36.71 
 
 
240 aa  44.3  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.138812  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2351  hypothetical protein  25.14 
 
 
253 aa  43.9  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2931  hypothetical protein  26.05 
 
 
240 aa  43.5  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1716  hypothetical protein  21.14 
 
 
241 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2505  hypothetical protein  28.05 
 
 
245 aa  43.1  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00117063  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0179  hypothetical protein  27.63 
 
 
240 aa  43.1  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1495  membrane protein  21.31 
 
 
241 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0530  hypothetical protein  24.59 
 
 
261 aa  42.7  0.005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5062  hypothetical protein  28.02 
 
 
241 aa  42.7  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.254511  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0127  protein of unknown function DUF81  22.92 
 
 
252 aa  42.4  0.007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000037107  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0977  hypothetical protein  29.26 
 
 
244 aa  42  0.008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000649549 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1828  hypothetical protein  32.57 
 
 
247 aa  42  0.008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.501819  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1649  hypothetical protein  21.14 
 
 
241 aa  42  0.009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7709  hypothetical protein  31.21 
 
 
260 aa  42  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.858783  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1530  hypothetical protein  21.14 
 
 
241 aa  42  0.009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>