188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3566 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3566  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  100 
 
 		 235 aa  471  1e-132  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.488896  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27510  Mn-dependent transcriptional regulator  64 
 
 		 231 aa  269  2.9999999999999997e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1465  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  69.79 
 
 		 230 aa  264  7e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00556833  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0837  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  62.11 
 
 		 232 aa  264  8.999999999999999e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0779  iron dependent repressor  62.88 
 
 		 228 aa  263  2e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2235  iron dependent repressor  61.95 
 
 		 227 aa  260  1e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0647911  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1008  DtxR family iron dependent repressor  59.91 
 
 		 234 aa  253  1.0000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.540653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8780  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  61.8 
 
 		 238 aa  253  1.0000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.706534 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4167  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  61.06 
 
 		 233 aa  251  6e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.309563  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0772  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  58.08 
 
 		 229 aa  251  9.000000000000001e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0523  DtxR family iron (metal) dependent repressor  57.83 
 
 		 234 aa  250  1e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0199964 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3790  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  67.19 
 
 		 229 aa  249  2e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00906262  normal  0.458013 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0794  DtxR family iron dependent repressor  58.95 
 
 		 231 aa  249  3e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.681199  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1456  iron dependent repressor  59.11 
 
 		 232 aa  247  1e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.534251 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0882  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  56.83 
 
 		 236 aa  245  4e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.201089 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1831  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  62.62 
 
 		 227 aa  245  4.9999999999999997e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.403988  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2176  DtxR family iron dependent repressor  64.06 
 
 		 230 aa  245  4.9999999999999997e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2222  iron dependent repressor  64.06 
 
 		 230 aa  245  4.9999999999999997e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.735096  normal  0.661172 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2165  iron dependent repressor  64.06 
 
 		 230 aa  245  4.9999999999999997e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.248278  hitchhiker  0.0016948 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0911  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  58.52 
 
 		 231 aa  243  1.9999999999999999e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.537022 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12725  iron-dependent repressor and activator ideR  61.39 
 
 		 230 aa  243  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1414  DtxR family iron dependent repressor  59.11 
 
 		 232 aa  243  1.9999999999999999e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.254441  hitchhiker  0.0000129939 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0249  iron dependent repressor  58.37 
 
 		 236 aa  243  3e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.612567  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0191  DtxR family iron dependent repressor  59.13 
 
 		 255 aa  241  5e-63  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.131259 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2450  iron dependent repressor  62.5 
 
 		 229 aa  239  2e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.442083 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3949  iron dependent repressor  62.69 
 
 		 229 aa  238  6.999999999999999e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1989  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  57.69 
 
 		 234 aa  236  2e-61  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4546  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  59.39 
 
 		 228 aa  234  7e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.229344  normal  0.851702 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30780  Mn-dependent transcriptional regulator  55.51 
 
 		 236 aa  233  2.0000000000000002e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.449157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3553  iron dependent repressor  58.41 
 
 		 244 aa  233  3e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0827525  normal  0.67078 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2845  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  52.72 
 
 		 240 aa  229  4e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09110  Mn-dependent transcriptional regulator  54.43 
 
 		 239 aa  226  2e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.357041  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24030  Mn-dependent transcriptional regulator  54.08 
 
 		 241 aa  226  3e-58  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04190  Mn-dependent transcriptional regulator  52.92 
 
 		 240 aa  216  2.9999999999999998e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0424  iron dependent repressor  51.24 
 
 		 254 aa  188  5.999999999999999e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6206  DtxR family iron dependent repressor  50.8 
 
 		 246 aa  180  1e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.693213  normal  0.0477636 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2086  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  41.85 
 
 		 224 aa  119  3.9999999999999996e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0101  DtxR family iron dependent repressor  38.67 
 
 		 237 aa  118  6e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4549  iron dependent repressor  38.89 
 
 		 236 aa  117  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2267  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.19 
 
 		 226 aa  110  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0348  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.07 
 
 		 247 aa  106  4e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0657  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.59 
 
 		 214 aa  102  6e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.886666  normal  0.0828906 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0302  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.9 
 
 		 225 aa  100  1e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.298992  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2026  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.76 
 
 		 232 aa  100  2e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.461162  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4418  DtxR family iron dependent repressor  35.79 
 
 		 224 aa  99.4  4e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33150  Mn-dependent transcriptional regulator  34.36 
 
 		 227 aa  97.1  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.011235  normal  0.509126 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3587  DtxR family iron dependent repressor  37.75 
 
 		 222 aa  95.1  8e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0941537 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1907  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.91 
 
 		 237 aa  94.4  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000908776  normal  0.33378 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3322  DtxR family iron dependent repressor  30.37 
 
 		 230 aa  94.7  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.116911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3986  FeoA family protein  31.41 
 
 		 237 aa  94  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.990793 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4031  DtxR family iron dependent repressor  32.22 
 
 		 223 aa  92.8  4e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000355382  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6584  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.57 
 
 		 221 aa  92.8  5e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.221693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1565  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.33 
 
 		 241 aa  92  6e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0576  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.98 
 
 		 239 aa  91.7  9e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.168469  normal  0.566228 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1664  iron dependent repressor  34.41 
 
 		 229 aa  91.3  1e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.25936  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1570  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.97 
 
 		 229 aa  90.5  2e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.567097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2694  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.96 
 
 		 227 aa  90.9  2e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0485756 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2016  FeoA family protein  30.36 
 
 		 213 aa  90.1  2e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.15744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31300  Mn-dependent transcriptional regulator  33.33 
 
 		 234 aa  90.9  2e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0588  iron dependent repressor  36.43 
 
 		 221 aa  89.7  4e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0653  DtxR family iron dependent repressor  31.53 
 
 		 227 aa  89.7  4e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00367016  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1391  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.03 
 
 		 238 aa  89.4  5e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00204133  normal  0.214261 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1726  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  29.23 
 
 		 212 aa  89  7e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2236  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.7 
 
 		 226 aa  86.7  3e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0146641  hitchhiker  0.00566236 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5548  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.29 
 
 		 239 aa  86.7  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4172  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.61 
 
 		 227 aa  86.7  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.983941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2160  iron dependent repressor  32.86 
 
 		 240 aa  85.5  7e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.123888  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1669  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.62 
 
 		 239 aa  84.3  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1279  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  37.69 
 
 		 218 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2097  DtxR family iron dependent repressor  33.33 
 
 		 240 aa  82  0.000000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2143  iron dependent repressor  33.33 
 
 		 240 aa  82  0.000000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0419324 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2080  iron dependent repressor  33.33 
 
 		 240 aa  82  0.000000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.337906  normal  0.114786 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2117  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  37.31 
 
 		 233 aa  82  0.000000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2347  iron dependent repressor  34.07 
 
 		 248 aa  80.9  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.199086  hitchhiker  0.00189689 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12801  transcriptional repressor sirR  29.95 
 
 		 228 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4678  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.77 
 
 		 220 aa  80.5  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.289073 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2268  DtxR family iron dependent repressor  32.44 
 
 		 221 aa  79.7  0.00000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0515918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3281  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  39.22 
 
 		 214 aa  80.1  0.00000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13220  Mn-dependent transcriptional regulator  30.65 
 
 		 230 aa  79.3  0.00000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.979168 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1173  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  29.85 
 
 		 235 aa  79.7  0.00000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.990595  normal  0.0494432 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4026  iron dependent repressor  32.59 
 
 		 242 aa  79  0.00000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0873037 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3304  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.54 
 
 		 229 aa  78.6  0.00000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000325293 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1950  iron repressor, putative  32.17 
 
 		 218 aa  78.2  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1582  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.62 
 
 		 240 aa  78.2  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0904  Iron dependent repressor  34.35 
 
 		 218 aa  77  0.0000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000581778  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0933  iron dependent repressor  34.07 
 
 		 217 aa  77.4  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2391  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.56 
 
 		 237 aa  76.6  0.0000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000895819 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0687  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.43 
 
 		 234 aa  77  0.0000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000120383  normal  0.0346372 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2658  DtxR family iron dependent repressor  30 
 
 		 237 aa  76.3  0.0000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.303372  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1732  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.26 
 
 		 232 aa  75.9  0.0000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0495486  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0974  iron dependent repressor  32.28 
 
 		 134 aa  75.9  0.0000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.431439  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1655  iron dependent repressor  32.28 
 
 		 134 aa  75.9  0.0000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1534  iron-dependent transcriptional regulator  29.82 
 
 		 215 aa  75.9  0.0000000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000830846  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2226  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  38.89 
 
 		 240 aa  75.1  0.0000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0626  DtxR family iron (metal) dependent repressor  30.35 
 
 		 239 aa  75.5  0.0000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0317366  normal  0.280307 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2465  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.77 
 
 		 217 aa  75.1  0.0000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00437401  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0258  DtxR family iron dependent repressor  31.5 
 
 		 134 aa  74.7  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1228  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.07 
 
 		 216 aa  75.1  0.000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.294242  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2758  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.98 
 
 		 236 aa  74.7  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1506  iron dependent repressor  30.39 
 
 		 224 aa  73.9  0.000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.152976  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>