118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2237 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2237  methylmalonyl-CoA epimerase  100 
 
 		 162 aa  340  5.999999999999999e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0271579  hitchhiker  0.00000000000849272 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1041  hypothetical protein  42.94 
 
 		 164 aa  154  4e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0333  lactoylglutathione lyase-like protein  43.75 
 
 		 163 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1435  lactoylglutathione lyase-like protein  37.34 
 
 		 169 aa  103  1e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3666  hypothetical protein  32.69 
 
 		 202 aa  99  3e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.150223  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5705  hypothetical protein  31.85 
 
 		 185 aa  98.2  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.16357 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2271  hypothetical protein  30.67 
 
 		 170 aa  85.9  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.667437 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2559  hypothetical protein  35.25 
 
 		 151 aa  86.3  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000299394  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0277  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.57 
 
 		 149 aa  85.1  3e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000264017  hitchhiker  0.0000643241 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2443  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.64 
 
 		 150 aa  85.1  4e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3963  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.64 
 
 		 150 aa  82  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0440  putative lactoylglutathione lyase  31.25 
 
 		 179 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7229  putative lactoylglutathione lyase  31.25 
 
 		 179 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0033  hypothetical protein  29.86 
 
 		 179 aa  77.4  0.00000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4739  hypothetical protein  31.65 
 
 		 183 aa  76.3  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.861724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0629  hypothetical protein  30.94 
 
 		 182 aa  75.5  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.873986 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2610  hypothetical protein  27.7 
 
 		 182 aa  73.9  0.0000000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0177001  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1946  hypothetical protein  28.87 
 
 		 179 aa  73.9  0.0000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.321745  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0770  hypothetical protein  28.78 
 
 		 182 aa  73.2  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0295  methylmalonyl-CoA epimerase  25.69 
 
 		 186 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.985987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1277  lactoylglutathione lyase or related lyase  33.09 
 
 		 151 aa  71.6  0.000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.297735  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0215  hypothetical protein  30.34 
 
 		 175 aa  70.5  0.000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2006  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.43 
 
 		 140 aa  68.2  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2521  hypothetical protein  27.4 
 
 		 172 aa  67.8  0.00000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.121012  normal  0.689181 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2395  methylmalonyl-CoA epimerase  29.86 
 
 		 147 aa  67.4  0.00000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.754558  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4137  hypothetical protein  27.59 
 
 		 175 aa  67.4  0.00000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.425431  normal  0.34656 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0152  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.66 
 
 		 134 aa  66.2  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0877  methylmalonyl-CoA epimerase  30.43 
 
 		 134 aa  65.9  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.157449  normal  0.0450617 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0790  hypothetical protein  30.28 
 
 		 152 aa  66.2  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3213  hypothetical protein  26.53 
 
 		 172 aa  65.5  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0480  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.93 
 
 		 134 aa  64.3  0.0000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3412  hypothetical protein  33.33 
 
 		 164 aa  63.9  0.0000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0399534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1341  methylmalonyl-CoA epimerase  30.13 
 
 		 136 aa  62  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.886384  normal  0.16528 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1013  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.53 
 
 		 178 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0572298  normal  0.362959 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2255  methylmalonyl-CoA epimerase  31.29 
 
 		 174 aa  60.8  0.000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.539584 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0306  methylmalonyl-CoA epimerase  29.2 
 
 		 141 aa  60.8  0.000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2857  hypothetical protein  25.85 
 
 		 175 aa  60.5  0.000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2901  hypothetical protein  25.85 
 
 		 175 aa  60.5  0.000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3733  hypothetical protein  25.66 
 
 		 181 aa  60.5  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3806  hypothetical protein  25.66 
 
 		 181 aa  60.5  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.559464  normal  0.066376 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3745  hypothetical protein  25.66 
 
 		 181 aa  60.5  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2887  hypothetical protein  25.85 
 
 		 658 aa  59.7  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3166  hypothetical protein  28.47 
 
 		 158 aa  58.9  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0603801  normal  0.0644468 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0306  hypothetical protein  30.14 
 
 		 162 aa  58.9  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.451967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0871  methylmalonyl-CoA epimerase  29.6 
 
 		 135 aa  58.9  0.00000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0655  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.21 
 
 		 134 aa  58.2  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000195436  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2285  methylmalonyl-CoA epimerase  30.08 
 
 		 140 aa  58.2  0.00000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000102737  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1613  glyoxalase family protein  30.66 
 
 		 134 aa  57  0.0000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1865  hypothetical protein  25.81 
 
 		 181 aa  56.6  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.669999  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0981  methylmalonyl-CoA epimerase  29.57 
 
 		 139 aa  57  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0245792  normal  0.390705 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0290  methylmalonyl-CoA epimerase  30.95 
 
 		 133 aa  56.2  0.0000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0586  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.66 
 
 		 135 aa  56.2  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0552  methylmalonyl-CoA epimerase  32.37 
 
 		 134 aa  55.8  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1852  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.21 
 
 		 133 aa  56.2  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1175  methylmalonyl-CoA epimerase  31.9 
 
 		 134 aa  55.1  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0281042 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3537  hypothetical protein  28.28 
 
 		 183 aa  54.7  0.0000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1696  methylmalonyl-CoA epimerase  26.17 
 
 		 140 aa  54.7  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.019096  normal  0.134039 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1316  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.82 
 
 		 135 aa  54.7  0.0000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03285  Lactoylglutathione lyase and related lyase  29.82 
 
 		 135 aa  53.9  0.0000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.275732  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0555  methylmalonyl-CoA epimerase  24.26 
 
 		 127 aa  53.9  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0558  methylmalonyl-CoA epimerase  29.91 
 
 		 137 aa  53.5  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000977172  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3303  methylmalonyl-CoA epimerase  33.64 
 
 		 134 aa  52.4  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000981467  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1289  lactoylglutathione lyase  35.11 
 
 		 137 aa  52.8  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3258  methylmalonyl-CoA epimerase  25.87 
 
 		 134 aa  52.8  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000316472  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1869  methylmalonyl-CoA epimerase  34.41 
 
 		 134 aa  52  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.441583  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0571  methylmalonyl-CoA epimerase  28.21 
 
 		 137 aa  51.6  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.82853e-18 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1167  methylmalonyl-CoA epimerase  25.68 
 
 		 135 aa  51.2  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.217696  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0356  methylmalonyl-CoA epimerase  29.66 
 
 		 192 aa  50.8  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1126  hypothetical protein  29.06 
 
 		 135 aa  50.1  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3561  hypothetical protein  32.06 
 
 		 181 aa  50.1  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.0000255712  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1258  methylmalonyl-CoA epimerase  24.34 
 
 		 147 aa  50.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3253  methylmalonyl-CoA epimerase  27.21 
 
 		 134 aa  49.7  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000018375  hitchhiker  3.27573e-17 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0522  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.84 
 
 		 134 aa  49.3  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000014865  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3891  methylmalonyl-CoA epimerase  28.28 
 
 		 145 aa  49.7  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.394666  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1361  methylmalonyl-CoA epimerase  25.69 
 
 		 129 aa  49.3  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  2.7651e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1170  methylmalonyl-CoA epimerase  27.2 
 
 		 135 aa  49.7  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.107967  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28560  methylmalonyl-CoA epimerase  25.17 
 
 		 153 aa  48.9  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.215327 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2262  hypothetical protein  27.94 
 
 		 177 aa  48.5  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1488  methylmalonyl-CoA epimerase  27.82 
 
 		 134 aa  48.5  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.383789  normal  0.131397 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4113  methylmalonyl-CoA epimerase  25 
 
 		 162 aa  48.5  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0776501  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3276  hypothetical protein  32.32 
 
 		 174 aa  48.1  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.52081  normal  0.190198 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0230  methylmalonyl-CoA epimerase  22.07 
 
 		 142 aa  47.4  0.00009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5865  methylmalonyl-CoA epimerase  24.5 
 
 		 136 aa  46.6  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0200  methylmalonyl-CoA epimerase  26.09 
 
 		 140 aa  47  0.0001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000715247  normal  0.843381 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1282  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.04 
 
 		 134 aa  45.8  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0916  methylmalonyl-CoA epimerase  23.97 
 
 		 140 aa  46.6  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.311023 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1989  methylmalonyl-CoA epimerase  25 
 
 		 127 aa  46.2  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0639  methylmalonyl-CoA epimerase  23.81 
 
 		 140 aa  45.4  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.237468  normal  0.259775 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2017  glyoxalase family protein  25 
 
 		 139 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000114361  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5151  hypothetical protein  28.97 
 
 		 170 aa  45.4  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.548962  hitchhiker  0.00118646 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3306  methylmalonyl-CoA epimerase  22.06 
 
 		 135 aa  45.1  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.369567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3461  hypothetical protein  24.82 
 
 		 177 aa  44.3  0.0007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1038  methylmalonyl-CoA epimerase  28 
 
 		 134 aa  44.3  0.0008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00716429  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0455  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.32 
 
 		 134 aa  44.3  0.0008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.571993 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0953  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  22.92 
 
 		 131 aa  44.3  0.0008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0254493 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2781  methylmalonyl-CoA epimerase  26.52 
 
 		 141 aa  43.9  0.0009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0349  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.13 
 
 		 134 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0717499  normal  0.143694 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1774  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  24.32 
 
 		 139 aa  43.5  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000533955  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0080  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  22.06 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0425619  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1995  glyoxalase family protein  24.32 
 
 		 139 aa  42.4  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00316995  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>