56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_2901 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_2857  hypothetical protein  100 
 
 
175 aa  358  2e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2901  hypothetical protein  100 
 
 
175 aa  358  2e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2887  hypothetical protein  98.08 
 
 
658 aa  320  9.000000000000001e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3412  hypothetical protein  67.07 
 
 
164 aa  239  2e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0399534  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3166  hypothetical protein  68.29 
 
 
158 aa  231  5e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0603801  normal  0.0644468 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2521  hypothetical protein  34.42 
 
 
172 aa  72  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.121012  normal  0.689181 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0770  hypothetical protein  32.08 
 
 
182 aa  67.4  0.00000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1435  lactoylglutathione lyase-like protein  32.88 
 
 
169 aa  66.6  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3666  hypothetical protein  30.28 
 
 
202 aa  64.3  0.0000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.150223  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0277  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.22 
 
 
149 aa  64.3  0.0000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000264017  hitchhiker  0.0000643241 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2262  hypothetical protein  37.69 
 
 
177 aa  63.9  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3745  hypothetical protein  35.43 
 
 
181 aa  62  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3806  hypothetical protein  35.43 
 
 
181 aa  62  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.559464  normal  0.066376 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3733  hypothetical protein  35.43 
 
 
181 aa  62  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1041  hypothetical protein  30.46 
 
 
164 aa  60.1  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2237  methylmalonyl-CoA epimerase  25.85 
 
 
162 aa  60.5  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0271579  hitchhiker  0.00000000000849272 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0629  hypothetical protein  32.16 
 
 
182 aa  60.5  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.873986 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5705  hypothetical protein  26.85 
 
 
185 aa  57.4  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.16357 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4137  hypothetical protein  33.33 
 
 
175 aa  55.8  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.425431  normal  0.34656 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0333  lactoylglutathione lyase-like protein  30.08 
 
 
163 aa  55.5  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2610  hypothetical protein  31.96 
 
 
182 aa  55.1  0.0000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0177001  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0295  methylmalonyl-CoA epimerase  25.87 
 
 
186 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.985987  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2559  hypothetical protein  24.31 
 
 
151 aa  54.7  0.0000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000299394  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2443  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.05 
 
 
150 aa  53.9  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1865  hypothetical protein  28.48 
 
 
181 aa  52.8  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.669999  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4739  hypothetical protein  33.33 
 
 
183 aa  53.1  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.861724  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2255  methylmalonyl-CoA epimerase  31.52 
 
 
174 aa  52.4  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.539584 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3258  methylmalonyl-CoA epimerase  34.18 
 
 
134 aa  52  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000316472  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0288  hypothetical protein  33.08 
 
 
167 aa  51.2  0.000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.133197  normal  0.680109 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3561  hypothetical protein  33.33 
 
 
181 aa  49.3  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.0000255712  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0480  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.89 
 
 
134 aa  48.1  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0790  hypothetical protein  28.03 
 
 
152 aa  47.8  0.00007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1946  hypothetical protein  27.67 
 
 
179 aa  47.8  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.321745  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1361  methylmalonyl-CoA epimerase  26.09 
 
 
129 aa  47.4  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  2.7651e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0215  hypothetical protein  26.28 
 
 
175 aa  47  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1289  lactoylglutathione lyase  29.2 
 
 
137 aa  47  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7229  putative lactoylglutathione lyase  26.92 
 
 
179 aa  47.4  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0440  putative lactoylglutathione lyase  26.92 
 
 
179 aa  47  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0152  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.89 
 
 
134 aa  47.4  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0655  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.33 
 
 
134 aa  46.2  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000195436  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2271  hypothetical protein  36.67 
 
 
170 aa  45.8  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.667437 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2875  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  63.89 
 
 
155 aa  45.4  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1790  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.5 
 
 
158 aa  45.1  0.0005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0306  methylmalonyl-CoA epimerase  33.85 
 
 
141 aa  44.3  0.0008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0033  hypothetical protein  25.79 
 
 
179 aa  44.3  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0306  hypothetical protein  35.63 
 
 
162 aa  43.9  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.451967  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1175  methylmalonyl-CoA epimerase  30.11 
 
 
134 aa  43.5  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0281042 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0558  methylmalonyl-CoA epimerase  31.91 
 
 
137 aa  42.7  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000977172  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1170  methylmalonyl-CoA epimerase  22.86 
 
 
135 aa  42.7  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.107967  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0877  methylmalonyl-CoA epimerase  29.03 
 
 
134 aa  42.7  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.157449  normal  0.0450617 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1277  lactoylglutathione lyase or related lyase  22.66 
 
 
151 aa  42  0.004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.297735  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3213  hypothetical protein  25.85 
 
 
172 aa  42  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0571  methylmalonyl-CoA epimerase  29.47 
 
 
137 aa  42  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.82853e-18 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28560  methylmalonyl-CoA epimerase  28.57 
 
 
153 aa  41.6  0.006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.215327 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2006  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.33 
 
 
140 aa  41.6  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3303  methylmalonyl-CoA epimerase  30.95 
 
 
134 aa  41.2  0.007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000981467  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>