127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0333 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0333  lactoylglutathione lyase-like protein  100 
 
 		 163 aa  334  2.9999999999999997e-91  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1041  hypothetical protein  71.25 
 
 		 164 aa  256  8e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2237  methylmalonyl-CoA epimerase  43.75 
 
 		 162 aa  151  2.9999999999999998e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0271579  hitchhiker  0.00000000000849272 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3666  hypothetical protein  41.4 
 
 		 202 aa  127  6e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.150223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1435  lactoylglutathione lyase-like protein  42.95 
 
 		 169 aa  124  7e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5705  hypothetical protein  32.93 
 
 		 185 aa  110  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.16357 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2610  hypothetical protein  32.24 
 
 		 182 aa  95.5  3e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0177001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0277  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.53 
 
 		 149 aa  83.2  0.000000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000264017  hitchhiker  0.0000643241 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2271  hypothetical protein  29.82 
 
 		 170 aa  80.5  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.667437 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2443  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.04 
 
 		 150 aa  79.7  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2559  hypothetical protein  30.22 
 
 		 151 aa  77.8  0.00000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000299394  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4739  hypothetical protein  31.33 
 
 		 183 aa  75.5  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.861724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1277  lactoylglutathione lyase or related lyase  31.65 
 
 		 151 aa  75.1  0.0000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.297735  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2521  hypothetical protein  32.19 
 
 		 172 aa  73.9  0.0000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.121012  normal  0.689181 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4137  hypothetical protein  31.17 
 
 		 175 aa  71.6  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.425431  normal  0.34656 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0629  hypothetical protein  31.21 
 
 		 182 aa  71.2  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.873986 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0033  hypothetical protein  28.67 
 
 		 179 aa  70.1  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7229  putative lactoylglutathione lyase  26.7 
 
 		 179 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0790  hypothetical protein  28.17 
 
 		 152 aa  69.3  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0440  putative lactoylglutathione lyase  26.7 
 
 		 179 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0215  hypothetical protein  30.2 
 
 		 175 aa  68.9  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3733  hypothetical protein  30.92 
 
 		 181 aa  68.2  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3806  hypothetical protein  30.92 
 
 		 181 aa  68.2  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.559464  normal  0.066376 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3745  hypothetical protein  30.92 
 
 		 181 aa  68.2  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2262  hypothetical protein  29.93 
 
 		 177 aa  65.5  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2255  methylmalonyl-CoA epimerase  29.86 
 
 		 174 aa  65.1  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.539584 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0200  methylmalonyl-CoA epimerase  31.3 
 
 		 140 aa  65.1  0.0000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000715247  normal  0.843381 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1946  hypothetical protein  28 
 
 		 179 aa  64.7  0.0000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.321745  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0295  methylmalonyl-CoA epimerase  26.21 
 
 		 186 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.985987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2395  methylmalonyl-CoA epimerase  29.91 
 
 		 147 aa  62.4  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.754558  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2285  methylmalonyl-CoA epimerase  30.7 
 
 		 140 aa  62  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000102737  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3412  hypothetical protein  30.6 
 
 		 164 aa  60.8  0.000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0399534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1316  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.91 
 
 		 135 aa  60.8  0.000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0152  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  24.22 
 
 		 134 aa  60.5  0.000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2006  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  23.66 
 
 		 140 aa  60.5  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0306  methylmalonyl-CoA epimerase  26.15 
 
 		 141 aa  60.1  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0586  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.58 
 
 		 135 aa  59.3  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3213  hypothetical protein  26.62 
 
 		 172 aa  59.3  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0981  methylmalonyl-CoA epimerase  23.48 
 
 		 139 aa  58.9  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0245792  normal  0.390705 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0480  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  23.44 
 
 		 134 aa  58.5  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1013  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.17 
 
 		 178 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0572298  normal  0.362959 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0877  methylmalonyl-CoA epimerase  29.46 
 
 		 134 aa  58.2  0.00000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.157449  normal  0.0450617 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3537  hypothetical protein  30.07 
 
 		 183 aa  57.4  0.00000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1613  glyoxalase family protein  24.14 
 
 		 134 aa  57.4  0.00000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0871  methylmalonyl-CoA epimerase  27.83 
 
 		 135 aa  57.4  0.00000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3891  methylmalonyl-CoA epimerase  30.08 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.394666  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4074  methylmalonyl-CoA epimerase  32.11 
 
 		 133 aa  56.6  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0584893  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0356  methylmalonyl-CoA epimerase  29.2 
 
 		 192 aa  56.2  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4198  methylmalonyl-CoA epimerase  32.11 
 
 		 134 aa  56.2  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.152541  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4223  methylmalonyl-CoA epimerase  32.11 
 
 		 133 aa  56.2  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1289  lactoylglutathione lyase  30.3 
 
 		 137 aa  55.5  0.0000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2857  hypothetical protein  30.08 
 
 		 175 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2901  hypothetical protein  30.08 
 
 		 175 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0349  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.32 
 
 		 134 aa  55.5  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0717499  normal  0.143694 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3166  hypothetical protein  31.54 
 
 		 158 aa  55.1  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0603801  normal  0.0644468 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1341  methylmalonyl-CoA epimerase  27.43 
 
 		 136 aa  54.3  0.0000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.886384  normal  0.16528 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1170  methylmalonyl-CoA epimerase  26.36 
 
 		 135 aa  52.4  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.107967  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1167  methylmalonyl-CoA epimerase  25.89 
 
 		 135 aa  52  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.217696  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2908  hypothetical protein  25.81 
 
 		 192 aa  52.4  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.142076  normal  0.706044 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0290  methylmalonyl-CoA epimerase  26.27 
 
 		 133 aa  52  0.000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28560  methylmalonyl-CoA epimerase  27.97 
 
 		 153 aa  52  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.215327 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2887  hypothetical protein  29.32 
 
 		 658 aa  52  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0770  hypothetical protein  25.17 
 
 		 182 aa  50.8  0.000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1361  methylmalonyl-CoA epimerase  27.03 
 
 		 129 aa  50.8  0.000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  2.7651e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1865  hypothetical protein  26.55 
 
 		 181 aa  50.4  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.669999  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2364  methylmalonyl-CoA epimerase  40.35 
 
 		 135 aa  50.4  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0953  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.53 
 
 		 131 aa  50.1  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0254493 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3303  methylmalonyl-CoA epimerase  26.92 
 
 		 134 aa  49.7  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000981467  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3276  hypothetical protein  35.96 
 
 		 174 aa  49.3  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.52081  normal  0.190198 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3306  methylmalonyl-CoA epimerase  32.89 
 
 		 135 aa  49.7  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.369567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1175  methylmalonyl-CoA epimerase  27.12 
 
 		 134 aa  49.3  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0281042 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5823  methylmalonyl-CoA epimerase  24.35 
 
 		 135 aa  49.3  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.609352 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0230  methylmalonyl-CoA epimerase  27.73 
 
 		 142 aa  48.9  0.00003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0571  methylmalonyl-CoA epimerase  22.3 
 
 		 137 aa  48.9  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.82853e-18 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0655  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  23.89 
 
 		 134 aa  48.5  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000195436  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0552  methylmalonyl-CoA epimerase  30.09 
 
 		 134 aa  48.1  0.00005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0558  methylmalonyl-CoA epimerase  22.3 
 
 		 137 aa  48.1  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000977172  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1126  hypothetical protein  26.5 
 
 		 135 aa  46.2  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0639  methylmalonyl-CoA epimerase  27.68 
 
 		 140 aa  45.8  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.237468  normal  0.259775 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03285  Lactoylglutathione lyase and related lyase  19.83 
 
 		 135 aa  46.6  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.275732  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09410  methylmalonyl-CoA epimerase  26.09 
 
 		 145 aa  45.4  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.990135  normal  0.273906 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0080  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25 
 
 		 135 aa  45.4  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0425619  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1258  methylmalonyl-CoA epimerase  27.5 
 
 		 147 aa  45.1  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0306  hypothetical protein  30.11 
 
 		 162 aa  44.7  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.451967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2339  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  24.26 
 
 		 168 aa  44.7  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.630848  normal  0.527959 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003655  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  32.39 
 
 		 357 aa  44.3  0.0007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1282  methylmalonyl-CoA epimerase  23.48 
 
 		 142 aa  44.3  0.0008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.922944  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0522  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25 
 
 		 134 aa  43.9  0.0009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000014865  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4113  methylmalonyl-CoA epimerase  25.22 
 
 		 162 aa  43.5  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0776501  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4306  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.41 
 
 		 161 aa  43.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.725625 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0960  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  32.35 
 
 		 369 aa  43.5  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02177  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  30.99 
 
 		 357 aa  43.5  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4406  methylmalonyl-CoA epimerase  25.83 
 
 		 134 aa  43.5  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.865386  normal  0.62826 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00580  glyoxalase family protein  19.51 
 
 		 168 aa  43.9  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1916  glyoxalase family protein  22.69 
 
 		 139 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.037102  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1510  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  32.22 
 
 		 369 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00348363  normal  0.317162 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1773  glyoxalase family protein  32.79 
 
 		 139 aa  42.7  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00831345  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1752  glyoxalase family protein  32.79 
 
 		 139 aa  42.7  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000441097  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1869  methylmalonyl-CoA epimerase  25.45 
 
 		 134 aa  42.7  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.441583  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1946  glyoxalase family protein  32.79 
 
 		 139 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5587800000000002e-23 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>