39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3537 on replicon NC_009427
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009427  Saro_3537  hypothetical protein  100 
 
 
183 aa  377  1e-104  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2255  methylmalonyl-CoA epimerase  51.88 
 
 
174 aa  157  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.539584 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0215  hypothetical protein  37.06 
 
 
175 aa  120  9.999999999999999e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0033  hypothetical protein  38.1 
 
 
179 aa  119  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1946  hypothetical protein  38.1 
 
 
179 aa  117  7e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.321745  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0440  putative lactoylglutathione lyase  39.76 
 
 
179 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7229  putative lactoylglutathione lyase  39.16 
 
 
179 aa  115  5e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0770  hypothetical protein  41.14 
 
 
182 aa  113  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0295  methylmalonyl-CoA epimerase  35.56 
 
 
186 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.985987  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4137  hypothetical protein  34.48 
 
 
175 aa  102  4e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.425431  normal  0.34656 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1865  hypothetical protein  35.88 
 
 
181 aa  101  6e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.669999  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2262  hypothetical protein  38.69 
 
 
177 aa  101  7e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2521  hypothetical protein  35.26 
 
 
172 aa  95.5  3e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.121012  normal  0.689181 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0629  hypothetical protein  31.69 
 
 
182 aa  94.4  9e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.873986 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2908  hypothetical protein  37.93 
 
 
192 aa  92.4  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.142076  normal  0.706044 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3561  hypothetical protein  35.39 
 
 
181 aa  90.5  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.0000255712  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4739  hypothetical protein  31.93 
 
 
183 aa  88.2  6e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.861724  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3461  hypothetical protein  37.13 
 
 
177 aa  87  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3745  hypothetical protein  35.8 
 
 
181 aa  86.7  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3806  hypothetical protein  35.8 
 
 
181 aa  86.7  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.559464  normal  0.066376 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3733  hypothetical protein  35.8 
 
 
181 aa  86.7  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1013  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.77 
 
 
178 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0572298  normal  0.362959 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0277  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.65 
 
 
149 aa  70.1  0.00000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000264017  hitchhiker  0.0000643241 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0333  lactoylglutathione lyase-like protein  30.07 
 
 
163 aa  67.8  0.00000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1041  hypothetical protein  30.5 
 
 
164 aa  65.5  0.0000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1435  lactoylglutathione lyase-like protein  34.04 
 
 
169 aa  64.7  0.0000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3213  hypothetical protein  27.03 
 
 
172 aa  62.8  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3276  hypothetical protein  32.91 
 
 
174 aa  60.1  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.52081  normal  0.190198 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2237  methylmalonyl-CoA epimerase  28.28 
 
 
162 aa  60.1  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0271579  hitchhiker  0.00000000000849272 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0288  hypothetical protein  29.5 
 
 
167 aa  53.5  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.133197  normal  0.680109 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2559  hypothetical protein  25 
 
 
151 aa  53.9  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000299394  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2443  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.21 
 
 
150 aa  53.5  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1277  lactoylglutathione lyase or related lyase  24.29 
 
 
151 aa  52.8  0.000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.297735  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2271  hypothetical protein  30.99 
 
 
170 aa  50.8  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.667437 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2610  hypothetical protein  25.16 
 
 
182 aa  48.9  0.00004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0177001  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0790  hypothetical protein  24.65 
 
 
152 aa  47.8  0.00008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3412  hypothetical protein  28.68 
 
 
164 aa  47.8  0.00009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0399534  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3641  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.33 
 
 
352 aa  44.7  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.258218 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0276  hypothetical protein  32.04 
 
 
157 aa  43.1  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.669813  normal  0.188863 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>