60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4739 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4739  hypothetical protein  100 
 
 		 183 aa  369  1e-101  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.861724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0629  hypothetical protein  68.89 
 
 		 182 aa  268  2.9999999999999997e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.873986 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4137  hypothetical protein  63.01 
 
 		 175 aa  226  1e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.425431  normal  0.34656 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2521  hypothetical protein  62.13 
 
 		 172 aa  221  4e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.121012  normal  0.689181 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3745  hypothetical protein  56.9 
 
 		 181 aa  196  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3733  hypothetical protein  56.9 
 
 		 181 aa  196  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3806  hypothetical protein  56.9 
 
 		 181 aa  196  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.559464  normal  0.066376 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0215  hypothetical protein  39.52 
 
 		 175 aa  130  1.0000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7229  putative lactoylglutathione lyase  38.69 
 
 		 179 aa  128  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0440  putative lactoylglutathione lyase  38.1 
 
 		 179 aa  127  8.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1946  hypothetical protein  37.5 
 
 		 179 aa  124  8.000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.321745  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0033  hypothetical protein  36.31 
 
 		 179 aa  122  3e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0295  methylmalonyl-CoA epimerase  35.58 
 
 		 186 aa  105  5e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.985987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0770  hypothetical protein  36.09 
 
 		 182 aa  102  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1013  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.93 
 
 		 178 aa  95.1  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0572298  normal  0.362959 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2908  hypothetical protein  35.86 
 
 		 192 aa  90.5  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.142076  normal  0.706044 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2255  methylmalonyl-CoA epimerase  35.37 
 
 		 174 aa  88.2  7e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.539584 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1865  hypothetical protein  30.99 
 
 		 181 aa  84.7  6e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.669999  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3561  hypothetical protein  32.76 
 
 		 181 aa  84  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.0000255712  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3537  hypothetical protein  32.53 
 
 		 183 aa  79.3  0.00000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2237  methylmalonyl-CoA epimerase  31.65 
 
 		 162 aa  76.3  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0271579  hitchhiker  0.00000000000849272 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0333  lactoylglutathione lyase-like protein  31.33 
 
 		 163 aa  75.5  0.0000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2262  hypothetical protein  34.66 
 
 		 177 aa  73.9  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3276  hypothetical protein  36.42 
 
 		 174 aa  73.2  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.52081  normal  0.190198 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1041  hypothetical protein  30.71 
 
 		 164 aa  71.6  0.000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2559  hypothetical protein  32.14 
 
 		 151 aa  70.1  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000299394  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1277  lactoylglutathione lyase or related lyase  30.28 
 
 		 151 aa  63.9  0.000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.297735  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1435  lactoylglutathione lyase-like protein  33.05 
 
 		 169 aa  63.2  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2443  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.61 
 
 		 150 aa  60.8  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0790  hypothetical protein  30.43 
 
 		 152 aa  60.1  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3461  hypothetical protein  26.95 
 
 		 177 aa  58.2  0.00000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5705  hypothetical protein  24.29 
 
 		 185 aa  58.2  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.16357 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2271  hypothetical protein  34.69 
 
 		 170 aa  57  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.667437 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3666  hypothetical protein  27.4 
 
 		 202 aa  55.5  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.150223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2901  hypothetical protein  33.33 
 
 		 175 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2887  hypothetical protein  34.39 
 
 		 658 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2857  hypothetical protein  33.33 
 
 		 175 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3412  hypothetical protein  34.65 
 
 		 164 aa  52  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0399534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0277  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.55 
 
 		 149 aa  51.6  0.000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000264017  hitchhiker  0.0000643241 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2610  hypothetical protein  31.62 
 
 		 182 aa  47.4  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0177001  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0290  methylmalonyl-CoA epimerase  24.65 
 
 		 133 aa  45.8  0.0003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0558  methylmalonyl-CoA epimerase  30.43 
 
 		 137 aa  45.8  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000977172  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3303  methylmalonyl-CoA epimerase  28.57 
 
 		 134 aa  44.7  0.0008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000981467  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3213  hypothetical protein  26.67 
 
 		 172 aa  44.7  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1175  methylmalonyl-CoA epimerase  25.21 
 
 		 134 aa  44.3  0.0009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0281042 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0871  methylmalonyl-CoA epimerase  23.19 
 
 		 135 aa  44.3  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3166  hypothetical protein  33.6 
 
 		 158 aa  44.3  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0603801  normal  0.0644468 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2006  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  23.24 
 
 		 140 aa  43.5  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2339  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.11 
 
 		 168 aa  43.1  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.630848  normal  0.527959 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0680  methylmalonyl-CoA epimerase  27.01 
 
 		 131 aa  43.5  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.227621  normal  0.151437 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3641  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.26 
 
 		 352 aa  42.7  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.258218 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1916  glyoxalase family protein  25.56 
 
 		 139 aa  42.4  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.037102  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0571  methylmalonyl-CoA epimerase  29.35 
 
 		 137 aa  42.4  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.82853e-18 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2225  methylmalonyl-CoA epimerase  22.31 
 
 		 136 aa  42.4  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0152  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  23.36 
 
 		 134 aa  42  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0639  methylmalonyl-CoA epimerase  23.24 
 
 		 140 aa  42  0.005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.237468  normal  0.259775 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3428  glyoxalase family protein  22.56 
 
 		 139 aa  41.6  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0993579  hitchhiker  0.000000357721 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3306  methylmalonyl-CoA epimerase  24.64 
 
 		 135 aa  41.6  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.369567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3253  methylmalonyl-CoA epimerase  25.53 
 
 		 134 aa  41.6  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000018375  hitchhiker  3.27573e-17 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1361  methylmalonyl-CoA epimerase  21.97 
 
 		 129 aa  41.2  0.009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  2.7651e-17  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>