45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_3733 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_3745  hypothetical protein  100 
 
 
181 aa  357  7e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3806  hypothetical protein  100 
 
 
181 aa  357  7e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.559464  normal  0.066376 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3733  hypothetical protein  100 
 
 
181 aa  357  7e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4739  hypothetical protein  56.9 
 
 
183 aa  208  3e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.861724  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2521  hypothetical protein  59.17 
 
 
172 aa  207  6e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.121012  normal  0.689181 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0629  hypothetical protein  53.49 
 
 
182 aa  196  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.873986 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4137  hypothetical protein  55.23 
 
 
175 aa  194  6e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.425431  normal  0.34656 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0215  hypothetical protein  39.66 
 
 
175 aa  108  4.0000000000000004e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0440  putative lactoylglutathione lyase  36.78 
 
 
179 aa  105  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1013  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  39.88 
 
 
178 aa  105  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0572298  normal  0.362959 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7229  putative lactoylglutathione lyase  36.78 
 
 
179 aa  105  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1946  hypothetical protein  37.22 
 
 
179 aa  103  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.321745  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0033  hypothetical protein  35.96 
 
 
179 aa  101  7e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0295  methylmalonyl-CoA epimerase  31.74 
 
 
186 aa  90.9  9e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.985987  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0770  hypothetical protein  32.37 
 
 
182 aa  90.9  9e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2908  hypothetical protein  34.25 
 
 
192 aa  87.4  9e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.142076  normal  0.706044 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2255  methylmalonyl-CoA epimerase  35.15 
 
 
174 aa  82.4  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.539584 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3561  hypothetical protein  32.18 
 
 
181 aa  80.1  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.0000255712  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1865  hypothetical protein  32.76 
 
 
181 aa  79  0.00000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.669999  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3537  hypothetical protein  35.8 
 
 
183 aa  77.8  0.00000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0333  lactoylglutathione lyase-like protein  30.92 
 
 
163 aa  71.6  0.000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2262  hypothetical protein  35.2 
 
 
177 aa  68.9  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3412  hypothetical protein  36.22 
 
 
164 aa  68.9  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0399534  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3276  hypothetical protein  43.33 
 
 
174 aa  68.2  0.00000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.52081  normal  0.190198 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1041  hypothetical protein  27.52 
 
 
164 aa  64.3  0.0000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2237  methylmalonyl-CoA epimerase  25.66 
 
 
162 aa  63.9  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0271579  hitchhiker  0.00000000000849272 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1435  lactoylglutathione lyase-like protein  31.97 
 
 
169 aa  62.8  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2901  hypothetical protein  35.43 
 
 
175 aa  62  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2857  hypothetical protein  35.43 
 
 
175 aa  62  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2887  hypothetical protein  35.43 
 
 
658 aa  60.5  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2443  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.77 
 
 
150 aa  59.7  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5705  hypothetical protein  26.39 
 
 
185 aa  58.2  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.16357 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3461  hypothetical protein  30.41 
 
 
177 aa  58.2  0.00000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3166  hypothetical protein  34.62 
 
 
158 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0603801  normal  0.0644468 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3666  hypothetical protein  34.35 
 
 
202 aa  57  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.150223  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1277  lactoylglutathione lyase or related lyase  27.66 
 
 
151 aa  56.6  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.297735  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2559  hypothetical protein  26.95 
 
 
151 aa  54.7  0.0000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000299394  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2610  hypothetical protein  31.93 
 
 
182 aa  52.4  0.000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0177001  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2271  hypothetical protein  35.71 
 
 
170 aa  48.1  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.667437 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0981  methylmalonyl-CoA epimerase  32.11 
 
 
139 aa  44.3  0.0009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0245792  normal  0.390705 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0790  hypothetical protein  27.08 
 
 
152 aa  44.3  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3963  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.78 
 
 
150 aa  44.3  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1361  methylmalonyl-CoA epimerase  29.76 
 
 
129 aa  43.1  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  2.7651e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1774  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  22.73 
 
 
139 aa  41.6  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000533955  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2006  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.98 
 
 
140 aa  41.2  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>