60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2262 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2262  hypothetical protein  100 
 
 		 177 aa  356  9.999999999999999e-98  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0215  hypothetical protein  39.44 
 
 		 175 aa  124  9e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0440  putative lactoylglutathione lyase  40.45 
 
 		 179 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0033  hypothetical protein  39.33 
 
 		 179 aa  112  3e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7229  putative lactoylglutathione lyase  39.89 
 
 		 179 aa  111  5e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1946  hypothetical protein  40.22 
 
 		 179 aa  110  7.000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.321745  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0770  hypothetical protein  38.07 
 
 		 182 aa  99  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0629  hypothetical protein  37.43 
 
 		 182 aa  95.5  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.873986 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3537  hypothetical protein  38.69 
 
 		 183 aa  92.8  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2255  methylmalonyl-CoA epimerase  36.59 
 
 		 174 aa  91.3  6e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.539584 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1865  hypothetical protein  33.53 
 
 		 181 aa  85.1  4e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.669999  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1013  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.57 
 
 		 178 aa  84.3  9e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0572298  normal  0.362959 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0295  methylmalonyl-CoA epimerase  34.71 
 
 		 186 aa  81.6  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.985987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4739  hypothetical protein  34.66 
 
 		 183 aa  81.3  0.000000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.861724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4137  hypothetical protein  34.44 
 
 		 175 aa  80.5  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.425431  normal  0.34656 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3733  hypothetical protein  34.64 
 
 		 181 aa  75.1  0.0000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3806  hypothetical protein  34.64 
 
 		 181 aa  75.1  0.0000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.559464  normal  0.066376 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3745  hypothetical protein  34.64 
 
 		 181 aa  75.1  0.0000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2521  hypothetical protein  32.6 
 
 		 172 aa  72.4  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.121012  normal  0.689181 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3412  hypothetical protein  34.57 
 
 		 164 aa  72  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0399534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3276  hypothetical protein  38.64 
 
 		 174 aa  70.5  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.52081  normal  0.190198 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3561  hypothetical protein  34.41 
 
 		 181 aa  69.3  0.00000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.0000255712  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0333  lactoylglutathione lyase-like protein  29.93 
 
 		 163 aa  67.8  0.00000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1435  lactoylglutathione lyase-like protein  33.54 
 
 		 169 aa  67  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3166  hypothetical protein  35.67 
 
 		 158 aa  67  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0603801  normal  0.0644468 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2857  hypothetical protein  37.69 
 
 		 175 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2887  hypothetical protein  36.84 
 
 		 658 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2901  hypothetical protein  37.69 
 
 		 175 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3213  hypothetical protein  32.14 
 
 		 172 aa  64.7  0.0000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2908  hypothetical protein  35.06 
 
 		 192 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.142076  normal  0.706044 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2443  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.2 
 
 		 150 aa  61.6  0.000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2559  hypothetical protein  28.46 
 
 		 151 aa  60.1  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000299394  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2610  hypothetical protein  30.08 
 
 		 182 aa  58.5  0.00000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0177001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3461  hypothetical protein  29.14 
 
 		 177 aa  56.2  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1041  hypothetical protein  25.81 
 
 		 164 aa  55.1  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2237  methylmalonyl-CoA epimerase  27.94 
 
 		 162 aa  54.7  0.0000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0271579  hitchhiker  0.00000000000849272 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0152  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.23 
 
 		 134 aa  54.3  0.0000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3963  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.1 
 
 		 150 aa  53.9  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0480  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.42 
 
 		 134 aa  52.4  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0306  hypothetical protein  30.1 
 
 		 162 aa  51.6  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.451967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3644  hypothetical protein  31.9 
 
 		 171 aa  51.2  0.000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.64826 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0277  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.89 
 
 		 149 aa  51.2  0.000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000264017  hitchhiker  0.0000643241 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2271  hypothetical protein  34 
 
 		 170 aa  50.8  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.667437 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0790  hypothetical protein  30 
 
 		 152 aa  50.1  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1277  lactoylglutathione lyase or related lyase  26.15 
 
 		 151 aa  50.1  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.297735  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2008  hypothetical protein  32.1 
 
 		 166 aa  47.8  0.00007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0871  methylmalonyl-CoA epimerase  24.79 
 
 		 135 aa  46.6  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2006  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  23.68 
 
 		 140 aa  45.8  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1175  methylmalonyl-CoA epimerase  27.59 
 
 		 134 aa  45.8  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0281042 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0288  hypothetical protein  31.18 
 
 		 167 aa  45.8  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.133197  normal  0.680109 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1170  methylmalonyl-CoA epimerase  25 
 
 		 135 aa  45.4  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.107967  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0981  methylmalonyl-CoA epimerase  23.72 
 
 		 139 aa  45.1  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0245792  normal  0.390705 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1289  lactoylglutathione lyase  26.96 
 
 		 137 aa  45.4  0.0005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5151  hypothetical protein  27.89 
 
 		 170 aa  43.5  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.548962  hitchhiker  0.00118646 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0655  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.19 
 
 		 134 aa  42  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000195436  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0436  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.56 
 
 		 148 aa  41.6  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0558  methylmalonyl-CoA epimerase  40 
 
 		 137 aa  41.2  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000977172  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1282  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  40 
 
 		 134 aa  41.2  0.009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3306  methylmalonyl-CoA epimerase  25 
 
 		 135 aa  40.8  0.01  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.369567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0522  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  40 
 
 		 134 aa  40.8  0.01  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000014865  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>