17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3644 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3644  hypothetical protein  100 
 
 		 171 aa  345  2e-94  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.64826 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0276  hypothetical protein  37.4 
 
 		 157 aa  69.7  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.669813  normal  0.188863 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0288  hypothetical protein  30.56 
 
 		 167 aa  65.9  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.133197  normal  0.680109 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3412  hypothetical protein  30.72 
 
 		 164 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0399534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2008  hypothetical protein  31.21 
 
 		 166 aa  52  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1946  hypothetical protein  29.88 
 
 		 179 aa  49.3  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.321745  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0033  hypothetical protein  29.45 
 
 		 179 aa  46.2  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3166  hypothetical protein  31.1 
 
 		 158 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0603801  normal  0.0644468 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1013  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.08 
 
 		 178 aa  44.3  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0572298  normal  0.362959 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3561  hypothetical protein  33.33 
 
 		 181 aa  43.5  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.0000255712  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2262  hypothetical protein  31.9 
 
 		 177 aa  43.9  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3276  hypothetical protein  30 
 
 		 174 aa  43.5  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.52081  normal  0.190198 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7229  putative lactoylglutathione lyase  29.88 
 
 		 179 aa  42  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1435  lactoylglutathione lyase-like protein  29.03 
 
 		 169 aa  42  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1041  hypothetical protein  25.35 
 
 		 164 aa  41.6  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0440  putative lactoylglutathione lyase  28.83 
 
 		 179 aa  41.6  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2887  hypothetical protein  33.33 
 
 		 658 aa  40.8  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>