58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3166 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_3166  hypothetical protein  100 
 
 		 158 aa  323  5e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0603801  normal  0.0644468 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3412  hypothetical protein  76.22 
 
 		 164 aa  251  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0399534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2857  hypothetical protein  68.29 
 
 		 175 aa  231  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2901  hypothetical protein  68.29 
 
 		 175 aa  231  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2887  hypothetical protein  67.31 
 
 		 658 aa  215  2e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3666  hypothetical protein  31.72 
 
 		 202 aa  68.9  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.150223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1435  lactoylglutathione lyase-like protein  35.34 
 
 		 169 aa  63.9  0.0000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2262  hypothetical protein  35.67 
 
 		 177 aa  62.4  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2237  methylmalonyl-CoA epimerase  28.47 
 
 		 162 aa  58.9  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0271579  hitchhiker  0.00000000000849272 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3733  hypothetical protein  35.2 
 
 		 181 aa  57  0.00000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3745  hypothetical protein  35.2 
 
 		 181 aa  57  0.00000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3806  hypothetical protein  35.2 
 
 		 181 aa  57  0.00000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.559464  normal  0.066376 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2255  methylmalonyl-CoA epimerase  31.9 
 
 		 174 aa  55.8  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.539584 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2521  hypothetical protein  34.78 
 
 		 172 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.121012  normal  0.689181 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2559  hypothetical protein  26.92 
 
 		 151 aa  55.5  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000299394  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2610  hypothetical protein  29.2 
 
 		 182 aa  55.5  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0177001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0333  lactoylglutathione lyase-like protein  31.54 
 
 		 163 aa  55.1  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0770  hypothetical protein  28.39 
 
 		 182 aa  55.1  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2271  hypothetical protein  37.14 
 
 		 170 aa  53.9  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.667437 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0295  methylmalonyl-CoA epimerase  26.17 
 
 		 186 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.985987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1041  hypothetical protein  30.88 
 
 		 164 aa  53.1  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5705  hypothetical protein  28.97 
 
 		 185 aa  53.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.16357 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4137  hypothetical protein  29.94 
 
 		 175 aa  52.4  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.425431  normal  0.34656 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0790  hypothetical protein  31.21 
 
 		 152 aa  51.6  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1865  hypothetical protein  28.03 
 
 		 181 aa  51.2  0.000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.669999  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0288  hypothetical protein  33.33 
 
 		 167 aa  50.8  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.133197  normal  0.680109 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0629  hypothetical protein  29.22 
 
 		 182 aa  50.4  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.873986 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2443  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.67 
 
 		 150 aa  49.3  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0215  hypothetical protein  29.41 
 
 		 175 aa  49.3  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0277  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.43 
 
 		 149 aa  49.3  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000264017  hitchhiker  0.0000643241 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3561  hypothetical protein  35.16 
 
 		 181 aa  48.1  0.00005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.0000255712  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7229  putative lactoylglutathione lyase  28.29 
 
 		 179 aa  48.1  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0871  methylmalonyl-CoA epimerase  25.18 
 
 		 135 aa  47.8  0.00006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0440  putative lactoylglutathione lyase  28.29 
 
 		 179 aa  47.4  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3213  hypothetical protein  28.7 
 
 		 172 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0480  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.45 
 
 		 134 aa  46.2  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3644  hypothetical protein  31.1 
 
 		 171 aa  45.8  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.64826 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0152  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.45 
 
 		 134 aa  45.4  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0033  hypothetical protein  28.8 
 
 		 179 aa  44.7  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1013  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.39 
 
 		 178 aa  44.3  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0572298  normal  0.362959 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4739  hypothetical protein  33.6 
 
 		 183 aa  44.3  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.861724  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0571  methylmalonyl-CoA epimerase  32.95 
 
 		 137 aa  43.9  0.0008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.82853e-18 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1170  methylmalonyl-CoA epimerase  23.57 
 
 		 135 aa  43.9  0.0008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.107967  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0558  methylmalonyl-CoA epimerase  31.82 
 
 		 137 aa  43.5  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000977172  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5151  hypothetical protein  30.93 
 
 		 170 aa  43.5  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.548962  hitchhiker  0.00118646 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1361  methylmalonyl-CoA epimerase  28.57 
 
 		 129 aa  43.5  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  2.7651e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1946  hypothetical protein  26.8 
 
 		 179 aa  42.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.321745  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0655  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.42 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000195436  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3258  methylmalonyl-CoA epimerase  34.62 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000316472  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0306  hypothetical protein  31.87 
 
 		 162 aa  42  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.451967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0981  methylmalonyl-CoA epimerase  43.4 
 
 		 139 aa  41.6  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0245792  normal  0.390705 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1623  methylmalonyl-CoA epimerase  28.85 
 
 		 136 aa  41.6  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3303  methylmalonyl-CoA epimerase  39.13 
 
 		 134 aa  41.2  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000981467  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0276  hypothetical protein  30.48 
 
 		 157 aa  41.2  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.669813  normal  0.188863 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2875  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  57.14 
 
 		 155 aa  41.2  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3104  methylmalonyl-CoA epimerase  29.21 
 
 		 163 aa  40.8  0.008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000698993  hitchhiker  0.0000492352 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6105  methylmalonyl-CoA epimerase  33.33 
 
 		 146 aa  40.4  0.009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0586  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.17 
 
 		 135 aa  40.4  0.009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>