42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A3666 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A3666  hypothetical protein  100 
 
 		 202 aa  417  1e-116  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.150223  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5705  hypothetical protein  46.82 
 
 		 185 aa  189  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.16357 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0333  lactoylglutathione lyase-like protein  41.4 
 
 		 163 aa  127  8.000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1041  hypothetical protein  42.58 
 
 		 164 aa  124  1e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1435  lactoylglutathione lyase-like protein  43.67 
 
 		 169 aa  110  1.0000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2237  methylmalonyl-CoA epimerase  32.69 
 
 		 162 aa  99  4e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0271579  hitchhiker  0.00000000000849272 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2271  hypothetical protein  34.59 
 
 		 170 aa  88.2  7e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.667437 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3412  hypothetical protein  33.56 
 
 		 164 aa  75.5  0.0000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0399534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2443  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.67 
 
 		 150 aa  74.3  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2610  hypothetical protein  30.77 
 
 		 182 aa  73.9  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0177001  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3166  hypothetical protein  34.38 
 
 		 158 aa  68.6  0.00000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0603801  normal  0.0644468 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0790  hypothetical protein  33.33 
 
 		 152 aa  65.5  0.0000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2857  hypothetical protein  30.28 
 
 		 175 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2901  hypothetical protein  30.28 
 
 		 175 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2559  hypothetical protein  26.76 
 
 		 151 aa  62.8  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000299394  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2887  hypothetical protein  29.53 
 
 		 658 aa  62  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1865  hypothetical protein  33.33 
 
 		 181 aa  62  0.000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.669999  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0277  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.37 
 
 		 149 aa  60.5  0.00000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000264017  hitchhiker  0.0000643241 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0629  hypothetical protein  27.86 
 
 		 182 aa  58.2  0.00000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.873986 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0295  methylmalonyl-CoA epimerase  40.85 
 
 		 186 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.985987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3733  hypothetical protein  32.19 
 
 		 181 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3806  hypothetical protein  32.19 
 
 		 181 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.559464  normal  0.066376 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3745  hypothetical protein  32.19 
 
 		 181 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0215  hypothetical protein  31.58 
 
 		 175 aa  57  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4739  hypothetical protein  27.4 
 
 		 183 aa  55.1  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.861724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2521  hypothetical protein  30.71 
 
 		 172 aa  55.1  0.0000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.121012  normal  0.689181 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0440  putative lactoylglutathione lyase  30.61 
 
 		 179 aa  53.9  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7229  putative lactoylglutathione lyase  30.61 
 
 		 179 aa  54.3  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0770  hypothetical protein  26.71 
 
 		 182 aa  53.5  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1277  lactoylglutathione lyase or related lyase  27.7 
 
 		 151 aa  53.5  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.297735  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4137  hypothetical protein  36.36 
 
 		 175 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.425431  normal  0.34656 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0033  hypothetical protein  28 
 
 		 179 aa  52  0.000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0306  hypothetical protein  34.29 
 
 		 162 aa  51.6  0.000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.451967  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1946  hypothetical protein  29.73 
 
 		 179 aa  51.2  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.321745  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3213  hypothetical protein  29.68 
 
 		 172 aa  48.1  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2255  methylmalonyl-CoA epimerase  30.46 
 
 		 174 aa  45.1  0.0007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.539584 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2285  methylmalonyl-CoA epimerase  30.99 
 
 		 140 aa  43.5  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000102737  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3963  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.98 
 
 		 150 aa  43.9  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0306  methylmalonyl-CoA epimerase  30.99 
 
 		 141 aa  42  0.006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1013  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.57 
 
 		 178 aa  42  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0572298  normal  0.362959 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2006  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.36 
 
 		 140 aa  42  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0571  methylmalonyl-CoA epimerase  26.96 
 
 		 137 aa  41.6  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.82853e-18 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>