63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5705 on replicon NC_012853
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012853  Rleg_5705  hypothetical protein  100 
 
 		 185 aa  390  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.16357 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3666  hypothetical protein  47.06 
 
 		 202 aa  188  4e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.150223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0333  lactoylglutathione lyase-like protein  32.93 
 
 		 163 aa  110  9e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1041  hypothetical protein  32.48 
 
 		 164 aa  108  5e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1435  lactoylglutathione lyase-like protein  39.74 
 
 		 169 aa  106  2e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2237  methylmalonyl-CoA epimerase  31.85 
 
 		 162 aa  98.2  6e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0271579  hitchhiker  0.00000000000849272 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2271  hypothetical protein  31.79 
 
 		 170 aa  78.2  0.00000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.667437 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7229  putative lactoylglutathione lyase  32.58 
 
 		 179 aa  75.1  0.0000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0440  putative lactoylglutathione lyase  32.58 
 
 		 179 aa  75.1  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2443  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.77 
 
 		 150 aa  70.1  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2610  hypothetical protein  29.37 
 
 		 182 aa  67  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0177001  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1946  hypothetical protein  32.87 
 
 		 179 aa  66.6  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.321745  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3412  hypothetical protein  31.08 
 
 		 164 aa  65.5  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0399534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0033  hypothetical protein  31.47 
 
 		 179 aa  64.3  0.0000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4137  hypothetical protein  30.25 
 
 		 175 aa  63.9  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.425431  normal  0.34656 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3213  hypothetical protein  30.25 
 
 		 172 aa  61.6  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2521  hypothetical protein  29.69 
 
 		 172 aa  62  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.121012  normal  0.689181 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0629  hypothetical protein  25 
 
 		 182 aa  61.6  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.873986 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4739  hypothetical protein  24.29 
 
 		 183 aa  58.2  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.861724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2901  hypothetical protein  26.85 
 
 		 175 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2857  hypothetical protein  26.85 
 
 		 175 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2887  hypothetical protein  26.85 
 
 		 658 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2559  hypothetical protein  26.45 
 
 		 151 aa  56.6  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000299394  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0306  methylmalonyl-CoA epimerase  37.21 
 
 		 141 aa  56.2  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2285  methylmalonyl-CoA epimerase  38.16 
 
 		 140 aa  56.2  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000102737  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3806  hypothetical protein  27.48 
 
 		 181 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.559464  normal  0.066376 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3745  hypothetical protein  27.48 
 
 		 181 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3733  hypothetical protein  27.48 
 
 		 181 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3166  hypothetical protein  28.97 
 
 		 158 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0603801  normal  0.0644468 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0215  hypothetical protein  27.89 
 
 		 175 aa  52.8  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0277  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.91 
 
 		 149 aa  50.8  0.00001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000264017  hitchhiker  0.0000643241 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0655  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.15 
 
 		 134 aa  50.1  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000195436  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3258  methylmalonyl-CoA epimerase  39.13 
 
 		 134 aa  50.1  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000316472  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1289  lactoylglutathione lyase  33.78 
 
 		 137 aa  49.3  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3253  methylmalonyl-CoA epimerase  39.39 
 
 		 134 aa  47  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000018375  hitchhiker  3.27573e-17 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1277  lactoylglutathione lyase or related lyase  26.39 
 
 		 151 aa  46.6  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.297735  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3303  methylmalonyl-CoA epimerase  35.53 
 
 		 134 aa  46.2  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000981467  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0480  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.51 
 
 		 134 aa  46.2  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0770  hypothetical protein  23.68 
 
 		 182 aa  45.8  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0152  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.51 
 
 		 134 aa  46.2  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2006  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  45.65 
 
 		 140 aa  45.1  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0790  hypothetical protein  27.91 
 
 		 152 aa  45.1  0.0007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1865  hypothetical protein  24.35 
 
 		 181 aa  44.7  0.0007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.669999  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1623  methylmalonyl-CoA epimerase  34.15 
 
 		 136 aa  44.3  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0877  methylmalonyl-CoA epimerase  25.52 
 
 		 134 aa  43.1  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.157449  normal  0.0450617 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1170  methylmalonyl-CoA epimerase  37.29 
 
 		 135 aa  43.1  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.107967  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1175  methylmalonyl-CoA epimerase  27.18 
 
 		 134 aa  43.5  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0281042 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0586  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  41.3 
 
 		 135 aa  43.5  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0659  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.3 
 
 		 134 aa  43.5  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00502246  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0295  methylmalonyl-CoA epimerase  28.89 
 
 		 186 aa  43.1  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.985987  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0571  methylmalonyl-CoA epimerase  34.72 
 
 		 137 aa  43.5  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.82853e-18 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0552  methylmalonyl-CoA epimerase  37.5 
 
 		 134 aa  42.7  0.003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0228  methylmalonyl-CoA epimerase  32.14 
 
 		 132 aa  42.4  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0290  methylmalonyl-CoA epimerase  32.89 
 
 		 133 aa  42.4  0.004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03285  Lactoylglutathione lyase and related lyase  33.8 
 
 		 135 aa  42  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.275732  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0981  methylmalonyl-CoA epimerase  33.87 
 
 		 139 aa  42  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0245792  normal  0.390705 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1316  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.04 
 
 		 135 aa  42  0.005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0558  methylmalonyl-CoA epimerase  35.38 
 
 		 137 aa  42  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000977172  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0871  methylmalonyl-CoA epimerase  27.37 
 
 		 135 aa  41.6  0.006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3306  methylmalonyl-CoA epimerase  36.36 
 
 		 135 aa  42  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.369567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3963  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.95 
 
 		 150 aa  41.6  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0306  hypothetical protein  27.45 
 
 		 162 aa  41.6  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.451967  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1613  glyoxalase family protein  34.78 
 
 		 134 aa  41.2  0.009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>