62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_2521 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_2521  hypothetical protein  100 
 
 
172 aa  350  5e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.121012  normal  0.689181 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4137  hypothetical protein  74.71 
 
 
175 aa  265  2e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.425431  normal  0.34656 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4739  hypothetical protein  62.13 
 
 
183 aa  221  4e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.861724  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0629  hypothetical protein  58.33 
 
 
182 aa  214  5e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.873986 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3745  hypothetical protein  59.17 
 
 
181 aa  195  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3806  hypothetical protein  59.17 
 
 
181 aa  195  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.559464  normal  0.066376 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3733  hypothetical protein  59.17 
 
 
181 aa  195  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7229  putative lactoylglutathione lyase  39.88 
 
 
179 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0440  putative lactoylglutathione lyase  39.29 
 
 
179 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0770  hypothetical protein  40.24 
 
 
182 aa  121  6e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1946  hypothetical protein  39.16 
 
 
179 aa  119  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.321745  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0033  hypothetical protein  37.95 
 
 
179 aa  116  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0215  hypothetical protein  37.06 
 
 
175 aa  113  2.0000000000000002e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0295  methylmalonyl-CoA epimerase  37.35 
 
 
186 aa  111  5e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.985987  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1013  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.9 
 
 
178 aa  94.4  7e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0572298  normal  0.362959 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3537  hypothetical protein  35.26 
 
 
183 aa  86.3  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2255  methylmalonyl-CoA epimerase  34.29 
 
 
174 aa  81.6  0.000000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.539584 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1865  hypothetical protein  30.59 
 
 
181 aa  79  0.00000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.669999  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1435  lactoylglutathione lyase-like protein  39.84 
 
 
169 aa  76.3  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3276  hypothetical protein  35.37 
 
 
174 aa  75.5  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.52081  normal  0.190198 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1041  hypothetical protein  32.39 
 
 
164 aa  75.1  0.0000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0333  lactoylglutathione lyase-like protein  32.19 
 
 
163 aa  73.9  0.0000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2901  hypothetical protein  34.42 
 
 
175 aa  72  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2857  hypothetical protein  34.42 
 
 
175 aa  72  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2908  hypothetical protein  29.53 
 
 
192 aa  71.6  0.000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.142076  normal  0.706044 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2887  hypothetical protein  34.18 
 
 
658 aa  70.9  0.000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3412  hypothetical protein  40.16 
 
 
164 aa  70.9  0.000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0399534  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3561  hypothetical protein  29.21 
 
 
181 aa  69.7  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.0000255712  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2237  methylmalonyl-CoA epimerase  27.4 
 
 
162 aa  67.8  0.00000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0271579  hitchhiker  0.00000000000849272 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2262  hypothetical protein  32.6 
 
 
177 aa  67  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2443  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.51 
 
 
150 aa  65.1  0.0000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2271  hypothetical protein  36.36 
 
 
170 aa  63.9  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.667437 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1277  lactoylglutathione lyase or related lyase  29.5 
 
 
151 aa  63.2  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.297735  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2559  hypothetical protein  30.22 
 
 
151 aa  62.4  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000299394  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5705  hypothetical protein  29.69 
 
 
185 aa  62  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.16357 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0790  hypothetical protein  31.43 
 
 
152 aa  61.6  0.000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3666  hypothetical protein  30.71 
 
 
202 aa  56.2  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.150223  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0277  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.5 
 
 
149 aa  56.2  0.0000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000264017  hitchhiker  0.0000643241 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3166  hypothetical protein  34.78 
 
 
158 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0603801  normal  0.0644468 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0981  methylmalonyl-CoA epimerase  32.39 
 
 
139 aa  52.8  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0245792  normal  0.390705 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3851  methylmalonyl-CoA epimerase  28.26 
 
 
156 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00602371 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3865  methylmalonyl-CoA epimerase  28.26 
 
 
156 aa  52  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.241683  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3939  methylmalonyl-CoA epimerase  28.26 
 
 
156 aa  52  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.368557  normal  0.0232297 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2339  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.54 
 
 
168 aa  50.8  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.630848  normal  0.527959 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3461  hypothetical protein  27.01 
 
 
177 aa  49.3  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4306  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.14 
 
 
161 aa  48.1  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.725625 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3213  hypothetical protein  30.97 
 
 
172 aa  46.6  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0152  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.24 
 
 
134 aa  46.2  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0480  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.53 
 
 
134 aa  44.3  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2781  methylmalonyl-CoA epimerase  25.9 
 
 
141 aa  43.9  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2875  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.39 
 
 
155 aa  43.9  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6105  methylmalonyl-CoA epimerase  31.88 
 
 
146 aa  43.1  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03285  Lactoylglutathione lyase and related lyase  22.92 
 
 
135 aa  42.7  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.275732  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2006  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  24.31 
 
 
140 aa  42.7  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3963  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  24.16 
 
 
150 aa  41.6  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11354  hypothetical protein  25.74 
 
 
151 aa  41.6  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.498935  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1916  glyoxalase family protein  25.9 
 
 
139 aa  41.2  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.037102  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0558  methylmalonyl-CoA epimerase  25.51 
 
 
137 aa  41.2  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000977172  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5865  methylmalonyl-CoA epimerase  26.24 
 
 
136 aa  41.2  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1946  glyoxalase family protein  25.18 
 
 
139 aa  40.8  0.01  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5587800000000002e-23 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1730  glyoxalase family protein  25.18 
 
 
139 aa  40.8  0.01  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00522629  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1752  glyoxalase family protein  25.18 
 
 
139 aa  40.8  0.01  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000441097  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>