50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0440 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_7229  putative lactoylglutathione lyase  98.88 
 
 		 179 aa  370  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0440  putative lactoylglutathione lyase  100 
 
 		 179 aa  372  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0033  hypothetical protein  76.54 
 
 		 179 aa  293  1e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1946  hypothetical protein  77.09 
 
 		 179 aa  288  2e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.321745  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0215  hypothetical protein  58.72 
 
 		 175 aa  209  2e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4137  hypothetical protein  41.52 
 
 		 175 aa  134  7.000000000000001e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.425431  normal  0.34656 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4739  hypothetical protein  38.1 
 
 		 183 aa  127  8.000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.861724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2521  hypothetical protein  39.29 
 
 		 172 aa  125  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.121012  normal  0.689181 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0629  hypothetical protein  38.1 
 
 		 182 aa  125  4.0000000000000003e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.873986 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0295  methylmalonyl-CoA epimerase  38.41 
 
 		 186 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.985987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3537  hypothetical protein  39.76 
 
 		 183 aa  108  4.0000000000000004e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0770  hypothetical protein  36.9 
 
 		 182 aa  107  9.000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2262  hypothetical protein  40.45 
 
 		 177 aa  107  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3733  hypothetical protein  36.78 
 
 		 181 aa  103  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3806  hypothetical protein  36.78 
 
 		 181 aa  103  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.559464  normal  0.066376 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3745  hypothetical protein  36.78 
 
 		 181 aa  103  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2255  methylmalonyl-CoA epimerase  35.63 
 
 		 174 aa  100  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.539584 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1013  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.29 
 
 		 178 aa  95.9  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0572298  normal  0.362959 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3561  hypothetical protein  33.15 
 
 		 181 aa  91.3  8e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.0000255712  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1865  hypothetical protein  28.65 
 
 		 181 aa  81.3  0.000000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.669999  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3461  hypothetical protein  29.52 
 
 		 177 aa  79.7  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2237  methylmalonyl-CoA epimerase  31.25 
 
 		 162 aa  79  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0271579  hitchhiker  0.00000000000849272 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5705  hypothetical protein  32.58 
 
 		 185 aa  75.1  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.16357 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2908  hypothetical protein  32.64 
 
 		 192 aa  72  0.000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.142076  normal  0.706044 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2271  hypothetical protein  35.21 
 
 		 170 aa  71.2  0.000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.667437 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3276  hypothetical protein  35.71 
 
 		 174 aa  70.5  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.52081  normal  0.190198 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1041  hypothetical protein  27.59 
 
 		 164 aa  69.7  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0333  lactoylglutathione lyase-like protein  26.7 
 
 		 163 aa  69.7  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1435  lactoylglutathione lyase-like protein  34.33 
 
 		 169 aa  66.2  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0790  hypothetical protein  32.14 
 
 		 152 aa  65.1  0.0000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3412  hypothetical protein  30.13 
 
 		 164 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0399534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2443  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.53 
 
 		 150 aa  55.1  0.0000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3666  hypothetical protein  30.61 
 
 		 202 aa  54.7  0.0000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.150223  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1277  lactoylglutathione lyase or related lyase  28.37 
 
 		 151 aa  54.3  0.0000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.297735  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0152  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.08 
 
 		 134 aa  53.1  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0277  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.45 
 
 		 149 aa  52.8  0.000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000264017  hitchhiker  0.0000643241 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3213  hypothetical protein  27.59 
 
 		 172 aa  49.3  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0981  methylmalonyl-CoA epimerase  30.97 
 
 		 139 aa  49.3  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0245792  normal  0.390705 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3166  hypothetical protein  28.29 
 
 		 158 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0603801  normal  0.0644468 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2857  hypothetical protein  26.92 
 
 		 175 aa  47  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2901  hypothetical protein  26.92 
 
 		 175 aa  47  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0276  hypothetical protein  34.84 
 
 		 157 aa  46.2  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.669813  normal  0.188863 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3963  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28 
 
 		 150 aa  45.1  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2887  hypothetical protein  27.97 
 
 		 658 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2610  hypothetical protein  26.45 
 
 		 182 aa  42  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0177001  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1167  methylmalonyl-CoA epimerase  27.13 
 
 		 135 aa  42  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.217696  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3644  hypothetical protein  28.83 
 
 		 171 aa  41.6  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.64826 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1341  methylmalonyl-CoA epimerase  25.68 
 
 		 136 aa  41.2  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.886384  normal  0.16528 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0080  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  24.66 
 
 		 135 aa  41.2  0.009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0425619  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03285  Lactoylglutathione lyase and related lyase  22.45 
 
 		 135 aa  40.8  0.009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.275732  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>