16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0276 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0276  hypothetical protein  100 
 
 		 157 aa  313  7e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.669813  normal  0.188863 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0288  hypothetical protein  37.06 
 
 		 167 aa  83.2  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.133197  normal  0.680109 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3644  hypothetical protein  38.46 
 
 		 171 aa  82  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.64826 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2008  hypothetical protein  34.39 
 
 		 166 aa  78.2  0.00000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7229  putative lactoylglutathione lyase  34.84 
 
 		 179 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0440  putative lactoylglutathione lyase  34.84 
 
 		 179 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2255  methylmalonyl-CoA epimerase  32.3 
 
 		 174 aa  58.2  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.539584 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1946  hypothetical protein  32.21 
 
 		 179 aa  55.8  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.321745  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1176  hypothetical protein  31.96 
 
 		 99 aa  51.2  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0033  hypothetical protein  30.2 
 
 		 179 aa  50.4  0.000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3213  hypothetical protein  29.08 
 
 		 172 aa  50.1  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0333  lactoylglutathione lyase-like protein  27.5 
 
 		 163 aa  45.4  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3166  hypothetical protein  29.27 
 
 		 158 aa  43.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0603801  normal  0.0644468 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3537  hypothetical protein  32.04 
 
 		 183 aa  43.1  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2908  hypothetical protein  32.65 
 
 		 192 aa  42.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.142076  normal  0.706044 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3412  hypothetical protein  28.91 
 
 		 164 aa  41.2  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0399534  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>