19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0288 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0288  hypothetical protein  100 
 
 		 167 aa  338  2e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.133197  normal  0.680109 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0276  hypothetical protein  41.41 
 
 		 157 aa  72.4  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.669813  normal  0.188863 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3644  hypothetical protein  30.56 
 
 		 171 aa  65.9  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.64826 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2008  hypothetical protein  33.13 
 
 		 166 aa  58.5  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1013  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30 
 
 		 178 aa  52.8  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0572298  normal  0.362959 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2887  hypothetical protein  33.08 
 
 		 658 aa  51.6  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2857  hypothetical protein  33.08 
 
 		 175 aa  51.2  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2901  hypothetical protein  33.08 
 
 		 175 aa  51.2  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3166  hypothetical protein  33.33 
 
 		 158 aa  50.8  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0603801  normal  0.0644468 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1176  hypothetical protein  29.9 
 
 		 99 aa  50.1  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2255  methylmalonyl-CoA epimerase  30.99 
 
 		 174 aa  50.1  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.539584 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3537  hypothetical protein  31.11 
 
 		 183 aa  48.9  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3213  hypothetical protein  29.87 
 
 		 172 aa  45.8  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3412  hypothetical protein  28.17 
 
 		 164 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0399534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1865  hypothetical protein  31.75 
 
 		 181 aa  44.3  0.0009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.669999  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0277  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.69 
 
 		 149 aa  43.1  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000264017  hitchhiker  0.0000643241 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2262  hypothetical protein  36.96 
 
 		 177 aa  42  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5151  hypothetical protein  26.45 
 
 		 170 aa  42  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.548962  hitchhiker  0.00118646 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1041  hypothetical protein  28.85 
 
 		 164 aa  41.2  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>