125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1041 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_1041  hypothetical protein  100 
 
 		 164 aa  340  7e-93  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0333  lactoylglutathione lyase-like protein  71.25 
 
 		 163 aa  256  8e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2237  methylmalonyl-CoA epimerase  42.94 
 
 		 162 aa  154  4e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0271579  hitchhiker  0.00000000000849272 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3666  hypothetical protein  42.58 
 
 		 202 aa  124  7e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.150223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1435  lactoylglutathione lyase-like protein  40.38 
 
 		 169 aa  116  9.999999999999999e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5705  hypothetical protein  32.48 
 
 		 185 aa  108  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.16357 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2610  hypothetical protein  32.7 
 
 		 182 aa  90.5  9e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0177001  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2271  hypothetical protein  31.93 
 
 		 170 aa  85.1  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.667437 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2443  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32 
 
 		 150 aa  80.9  0.000000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2559  hypothetical protein  29.2 
 
 		 151 aa  79.7  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000299394  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1277  lactoylglutathione lyase or related lyase  30.66 
 
 		 151 aa  79  0.00000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.297735  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0277  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.78 
 
 		 149 aa  77.8  0.00000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000264017  hitchhiker  0.0000643241 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2521  hypothetical protein  32.39 
 
 		 172 aa  75.1  0.0000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.121012  normal  0.689181 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0033  hypothetical protein  30.61 
 
 		 179 aa  73.6  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0295  methylmalonyl-CoA epimerase  30.07 
 
 		 186 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.985987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0629  hypothetical protein  31.21 
 
 		 182 aa  72.4  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.873986 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4739  hypothetical protein  30.71 
 
 		 183 aa  71.6  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.861724  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0790  hypothetical protein  29.73 
 
 		 152 aa  71.2  0.000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4137  hypothetical protein  30.67 
 
 		 175 aa  70.5  0.000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.425431  normal  0.34656 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0440  putative lactoylglutathione lyase  27.59 
 
 		 179 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2006  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.21 
 
 		 140 aa  69.3  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0200  methylmalonyl-CoA epimerase  31.03 
 
 		 140 aa  69.3  0.00000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000715247  normal  0.843381 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7229  putative lactoylglutathione lyase  27.59 
 
 		 179 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1946  hypothetical protein  30.56 
 
 		 179 aa  69.7  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.321745  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2395  methylmalonyl-CoA epimerase  30.26 
 
 		 147 aa  66.2  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.754558  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1013  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.86 
 
 		 178 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0572298  normal  0.362959 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2255  methylmalonyl-CoA epimerase  29.45 
 
 		 174 aa  65.1  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.539584 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0877  methylmalonyl-CoA epimerase  30.89 
 
 		 134 aa  64.7  0.0000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.157449  normal  0.0450617 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0981  methylmalonyl-CoA epimerase  28.7 
 
 		 139 aa  63.5  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0245792  normal  0.390705 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0215  hypothetical protein  27.21 
 
 		 175 aa  63.2  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1341  methylmalonyl-CoA epimerase  31.4 
 
 		 136 aa  62  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.886384  normal  0.16528 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0152  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.03 
 
 		 134 aa  61.6  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3537  hypothetical protein  30.5 
 
 		 183 aa  61.2  0.000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3733  hypothetical protein  27.52 
 
 		 181 aa  60.8  0.000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3806  hypothetical protein  27.52 
 
 		 181 aa  60.8  0.000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.559464  normal  0.066376 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3745  hypothetical protein  27.52 
 
 		 181 aa  60.8  0.000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2857  hypothetical protein  30.46 
 
 		 175 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2901  hypothetical protein  30.46 
 
 		 175 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1613  glyoxalase family protein  26.06 
 
 		 134 aa  59.3  0.00000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3412  hypothetical protein  30.6 
 
 		 164 aa  59.7  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0399534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0480  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.34 
 
 		 134 aa  59.7  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3306  methylmalonyl-CoA epimerase  28.17 
 
 		 135 aa  58.2  0.00000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.369567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1289  lactoylglutathione lyase  32.35 
 
 		 137 aa  57.8  0.00000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1170  methylmalonyl-CoA epimerase  29.52 
 
 		 135 aa  57.4  0.00000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.107967  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0356  methylmalonyl-CoA epimerase  28.08 
 
 		 192 aa  57.4  0.00000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2887  hypothetical protein  30.46 
 
 		 658 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0655  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  24.14 
 
 		 134 aa  56.2  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000195436  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28560  methylmalonyl-CoA epimerase  25.68 
 
 		 153 aa  55.8  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.215327 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3303  methylmalonyl-CoA epimerase  24.83 
 
 		 134 aa  55.5  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000981467  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0586  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.37 
 
 		 135 aa  55.5  0.0000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1316  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.27 
 
 		 135 aa  55.5  0.0000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3891  methylmalonyl-CoA epimerase  29.53 
 
 		 145 aa  55.5  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.394666  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0770  hypothetical protein  25.87 
 
 		 182 aa  54.7  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0871  methylmalonyl-CoA epimerase  28.43 
 
 		 135 aa  54.3  0.0000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3253  methylmalonyl-CoA epimerase  24.66 
 
 		 134 aa  53.9  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000018375  hitchhiker  3.27573e-17 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3166  hypothetical protein  30.88 
 
 		 158 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0603801  normal  0.0644468 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2262  hypothetical protein  25.81 
 
 		 177 aa  53.5  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0306  methylmalonyl-CoA epimerase  25 
 
 		 141 aa  53.9  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3258  methylmalonyl-CoA epimerase  24.83 
 
 		 134 aa  53.5  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000316472  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1865  hypothetical protein  27.03 
 
 		 181 aa  52.8  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.669999  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1167  methylmalonyl-CoA epimerase  27.87 
 
 		 135 aa  52.8  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.217696  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3213  hypothetical protein  23.81 
 
 		 172 aa  52.4  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0571  methylmalonyl-CoA epimerase  24.66 
 
 		 137 aa  52.8  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.82853e-18 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1258  methylmalonyl-CoA epimerase  29.25 
 
 		 147 aa  52.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03285  Lactoylglutathione lyase and related lyase  22.38 
 
 		 135 aa  52  0.000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.275732  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4074  methylmalonyl-CoA epimerase  27.19 
 
 		 133 aa  51.6  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0584893  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0349  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.52 
 
 		 134 aa  51.2  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0717499  normal  0.143694 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4223  methylmalonyl-CoA epimerase  27.19 
 
 		 133 aa  50.8  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4198  methylmalonyl-CoA epimerase  27.19 
 
 		 134 aa  50.8  0.000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.152541  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2908  hypothetical protein  27.59 
 
 		 192 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.142076  normal  0.706044 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3276  hypothetical protein  32.29 
 
 		 174 aa  50.4  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.52081  normal  0.190198 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0953  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30 
 
 		 131 aa  50.1  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0254493 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0558  methylmalonyl-CoA epimerase  23.29 
 
 		 137 aa  50.1  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000977172  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09410  methylmalonyl-CoA epimerase  28.7 
 
 		 145 aa  49.3  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.990135  normal  0.273906 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2364  methylmalonyl-CoA epimerase  30.77 
 
 		 135 aa  48.9  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0522  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  22.6 
 
 		 134 aa  49.3  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000014865  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1282  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.88 
 
 		 134 aa  49.3  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1796  methylmalonyl-CoA epimerase  29.57 
 
 		 170 aa  49.3  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5823  methylmalonyl-CoA epimerase  23.28 
 
 		 135 aa  48.9  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.609352 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4113  methylmalonyl-CoA epimerase  29.57 
 
 		 162 aa  48.9  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0776501  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2285  methylmalonyl-CoA epimerase  24.37 
 
 		 140 aa  48.9  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000102737  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0555  methylmalonyl-CoA epimerase  25 
 
 		 127 aa  48.1  0.00005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2339  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  23.66 
 
 		 168 aa  48.1  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.630848  normal  0.527959 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02177  4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase  36.62 
 
 		 357 aa  47.4  0.00009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1852  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25 
 
 		 133 aa  47.4  0.00009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3963  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.52 
 
 		 150 aa  47  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1175  methylmalonyl-CoA epimerase  27.35 
 
 		 134 aa  47.4  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0281042 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1995  glyoxalase family protein  24.46 
 
 		 139 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00316995  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1773  glyoxalase family protein  24.78 
 
 		 139 aa  46.2  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00831345  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1126  hypothetical protein  25.89 
 
 		 135 aa  46.2  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1910  glyoxalase family protein  24.78 
 
 		 139 aa  46.2  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000915588  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4306  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25 
 
 		 161 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.725625 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0230  methylmalonyl-CoA epimerase  26.06 
 
 		 142 aa  45.4  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3428  glyoxalase family protein  24.46 
 
 		 139 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0993579  hitchhiker  0.000000357721 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1916  glyoxalase family protein  26.55 
 
 		 139 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.037102  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1869  methylmalonyl-CoA epimerase  23.24 
 
 		 134 aa  44.7  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.441583  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3865  methylmalonyl-CoA epimerase  22.9 
 
 		 156 aa  44.7  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.241683  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1282  methylmalonyl-CoA epimerase  25.22 
 
 		 142 aa  44.7  0.0006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.922944  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3939  methylmalonyl-CoA epimerase  22.9 
 
 		 156 aa  44.7  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.368557  normal  0.0232297 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3851  methylmalonyl-CoA epimerase  24.79 
 
 		 156 aa  44.7  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00602371 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>