63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3412 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_3412  hypothetical protein  100 
 
 
164 aa  338  1e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0399534  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3166  hypothetical protein  76.22 
 
 
158 aa  251  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0603801  normal  0.0644468 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2901  hypothetical protein  67.07 
 
 
175 aa  239  2e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2857  hypothetical protein  67.07 
 
 
175 aa  239  2e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2887  hypothetical protein  67.31 
 
 
658 aa  224  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3666  hypothetical protein  33.56 
 
 
202 aa  76.6  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.150223  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1435  lactoylglutathione lyase-like protein  38.58 
 
 
169 aa  74.3  0.0000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2521  hypothetical protein  40.16 
 
 
172 aa  70.9  0.000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.121012  normal  0.689181 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3745  hypothetical protein  36.22 
 
 
181 aa  68.9  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3806  hypothetical protein  36.22 
 
 
181 aa  68.9  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.559464  normal  0.066376 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3733  hypothetical protein  36.22 
 
 
181 aa  68.9  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2262  hypothetical protein  34.57 
 
 
177 aa  67.4  0.00000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5705  hypothetical protein  31.08 
 
 
185 aa  65.5  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.16357 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2237  methylmalonyl-CoA epimerase  33.33 
 
 
162 aa  63.9  0.0000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0271579  hitchhiker  0.00000000000849272 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4137  hypothetical protein  37.69 
 
 
175 aa  63.5  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.425431  normal  0.34656 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0333  lactoylglutathione lyase-like protein  30.6 
 
 
163 aa  60.8  0.000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1041  hypothetical protein  30.6 
 
 
164 aa  59.7  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0440  putative lactoylglutathione lyase  30.13 
 
 
179 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7229  putative lactoylglutathione lyase  30.13 
 
 
179 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0770  hypothetical protein  27.56 
 
 
182 aa  56.2  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2610  hypothetical protein  34.83 
 
 
182 aa  55.5  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0177001  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0295  methylmalonyl-CoA epimerase  26.77 
 
 
186 aa  54.3  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.985987  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2271  hypothetical protein  37.27 
 
 
170 aa  53.9  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.667437 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2559  hypothetical protein  26.56 
 
 
151 aa  53.5  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000299394  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3644  hypothetical protein  30.72 
 
 
171 aa  53.1  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.64826 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4739  hypothetical protein  34.65 
 
 
183 aa  52  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.861724  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3213  hypothetical protein  27.7 
 
 
172 aa  51.6  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0629  hypothetical protein  30.77 
 
 
182 aa  51.6  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.873986 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0033  hypothetical protein  26.62 
 
 
179 aa  51.2  0.000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2443  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.54 
 
 
150 aa  51.2  0.000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1865  hypothetical protein  30.28 
 
 
181 aa  50.1  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.669999  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0981  methylmalonyl-CoA epimerase  36.62 
 
 
139 aa  49.3  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0245792  normal  0.390705 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0277  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.24 
 
 
149 aa  49.3  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000264017  hitchhiker  0.0000643241 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0215  hypothetical protein  28.21 
 
 
175 aa  50.1  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1946  hypothetical protein  25.97 
 
 
179 aa  48.9  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.321745  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3561  hypothetical protein  37.08 
 
 
181 aa  48.5  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.0000255712  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0480  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.05 
 
 
134 aa  47.4  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0152  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.05 
 
 
134 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1170  methylmalonyl-CoA epimerase  26.43 
 
 
135 aa  46.6  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.107967  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1013  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.06 
 
 
178 aa  47.4  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0572298  normal  0.362959 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0571  methylmalonyl-CoA epimerase  31.52 
 
 
137 aa  45.4  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.82853e-18 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0288  hypothetical protein  28.17 
 
 
167 aa  45.1  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.133197  normal  0.680109 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0558  methylmalonyl-CoA epimerase  31.07 
 
 
137 aa  44.3  0.0008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000977172  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0655  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.57 
 
 
134 aa  43.5  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000195436  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3537  hypothetical protein  28.68 
 
 
183 aa  43.5  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1949  methylmalonyl-CoA epimerase  29.51 
 
 
157 aa  42.7  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.331779  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0790  hypothetical protein  27.13 
 
 
152 aa  42.7  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3303  methylmalonyl-CoA epimerase  34.62 
 
 
134 aa  43.1  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000981467  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3258  methylmalonyl-CoA epimerase  32.05 
 
 
134 aa  42.4  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000316472  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2875  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  48.15 
 
 
155 aa  42.4  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5151  hypothetical protein  28.7 
 
 
170 aa  42.4  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.548962  hitchhiker  0.00118646 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2006  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.05 
 
 
140 aa  42.4  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1361  methylmalonyl-CoA epimerase  27.78 
 
 
129 aa  41.6  0.005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  2.7651e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0871  methylmalonyl-CoA epimerase  24.82 
 
 
135 aa  41.6  0.005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1790  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  43.06 
 
 
158 aa  41.6  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4113  methylmalonyl-CoA epimerase  36.73 
 
 
162 aa  41.2  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0776501  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1277  lactoylglutathione lyase or related lyase  24.43 
 
 
151 aa  41.2  0.007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.297735  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2155  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.86 
 
 
139 aa  40.8  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0614905  normal  0.240575 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2348  methylmalonyl-CoA epimerase  30 
 
 
131 aa  40.8  0.008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1613  glyoxalase family protein  30.56 
 
 
134 aa  40.8  0.008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6105  methylmalonyl-CoA epimerase  36.05 
 
 
146 aa  40.8  0.009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2255  methylmalonyl-CoA epimerase  26.67 
 
 
174 aa  40.8  0.009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.539584 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3253  methylmalonyl-CoA epimerase  31.94 
 
 
134 aa  40.4  0.01  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000018375  hitchhiker  3.27573e-17 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>