30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5151 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5151  hypothetical protein  100 
 
 		 170 aa  353  6.999999999999999e-97  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.548962  hitchhiker  0.00118646 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3213  hypothetical protein  29.37 
 
 		 172 aa  55.5  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1220  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.33 
 
 		 146 aa  53.5  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.019887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0810  methylmalonyl-CoA epimerase  29.29 
 
 		 146 aa  48.1  0.00006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4617  methylmalonyl-CoA epimerase  28.69 
 
 		 134 aa  46.2  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0621953 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0480  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.28 
 
 		 134 aa  46.2  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2443  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.1 
 
 		 150 aa  45.8  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2237  methylmalonyl-CoA epimerase  28.97 
 
 		 162 aa  45.4  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0271579  hitchhiker  0.00000000000849272 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4142  methylmalonyl-CoA epimerase  31.62 
 
 		 134 aa  45.4  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.65243  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0152  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.28 
 
 		 134 aa  45.1  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1372  methylmalonyl-CoA epimerase  29.82 
 
 		 139 aa  44.3  0.0009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0208267 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3166  hypothetical protein  30.93 
 
 		 158 aa  43.5  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0603801  normal  0.0644468 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2198  methylmalonyl-CoA epimerase  27.35 
 
 		 136 aa  43.1  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0637  methylmalonyl-CoA epimerase  29.31 
 
 		 134 aa  42.7  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.355591 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1041  hypothetical protein  26.03 
 
 		 164 aa  43.1  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2006  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.29 
 
 		 140 aa  42.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3412  hypothetical protein  28.7 
 
 		 164 aa  42.4  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0399534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2255  methylmalonyl-CoA epimerase  30.34 
 
 		 174 aa  42.4  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.539584 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4406  methylmalonyl-CoA epimerase  30.77 
 
 		 134 aa  42.7  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.865386  normal  0.62826 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3164  methylmalonyl-CoA epimerase  28.7 
 
 		 134 aa  42  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2559  hypothetical protein  23.61 
 
 		 151 aa  42  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000299394  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2892  methylmalonyl-CoA epimerase  27.21 
 
 		 141 aa  42  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.20735 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3258  methylmalonyl-CoA epimerase  29.37 
 
 		 134 aa  41.6  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000316472  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0288  hypothetical protein  26.45 
 
 		 167 aa  42  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.133197  normal  0.680109 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1733  lactoylglutathione lyase  28.95 
 
 		 134 aa  41.6  0.006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.881956  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1277  methylmalonyl-CoA epimerase  29.35 
 
 		 134 aa  41.2  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.149828  normal  0.902197 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2262  hypothetical protein  27.89 
 
 		 177 aa  40.8  0.008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0571  methylmalonyl-CoA epimerase  29.37 
 
 		 137 aa  40.8  0.009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.82853e-18 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0813  methylmalonyl-CoA epimerase  24.56 
 
 		 134 aa  40.8  0.009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0812  methylmalonyl-CoA epimerase  28.45 
 
 		 134 aa  40.8  0.009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>