45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3213 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3213  hypothetical protein  100 
 
 		 172 aa  356  8e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2237  methylmalonyl-CoA epimerase  26.53 
 
 		 162 aa  65.5  0.0000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0271579  hitchhiker  0.00000000000849272 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0277  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.88 
 
 		 149 aa  65.5  0.0000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000264017  hitchhiker  0.0000643241 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2255  methylmalonyl-CoA epimerase  27.5 
 
 		 174 aa  63.9  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.539584 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5705  hypothetical protein  30.25 
 
 		 185 aa  61.6  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.16357 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1435  lactoylglutathione lyase-like protein  31.78 
 
 		 169 aa  60.1  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0333  lactoylglutathione lyase-like protein  26.62 
 
 		 163 aa  59.3  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3537  hypothetical protein  27.03 
 
 		 183 aa  58.9  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2262  hypothetical protein  32.14 
 
 		 177 aa  58.5  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5151  hypothetical protein  29.37 
 
 		 170 aa  55.5  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.548962  hitchhiker  0.00118646 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2443  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.32 
 
 		 150 aa  55.1  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2559  hypothetical protein  25 
 
 		 151 aa  53.5  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000299394  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3963  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.09 
 
 		 150 aa  53.5  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1041  hypothetical protein  23.81 
 
 		 164 aa  52.4  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2610  hypothetical protein  28.57 
 
 		 182 aa  52  0.000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0177001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3412  hypothetical protein  27.7 
 
 		 164 aa  51.6  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0399534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0790  hypothetical protein  26.62 
 
 		 152 aa  51.6  0.000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0306  hypothetical protein  25.18 
 
 		 162 aa  49.7  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.451967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0440  putative lactoylglutathione lyase  27.59 
 
 		 179 aa  49.3  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3666  hypothetical protein  29.68 
 
 		 202 aa  48.5  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.150223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1865  hypothetical protein  28.93 
 
 		 181 aa  48.5  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.669999  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0586  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.43 
 
 		 135 aa  48.5  0.00005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7229  putative lactoylglutathione lyase  26.44 
 
 		 179 aa  47.8  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0215  hypothetical protein  27.97 
 
 		 175 aa  47.8  0.00008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2271  hypothetical protein  28.17 
 
 		 170 aa  46.2  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.667437 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2521  hypothetical protein  30.97 
 
 		 172 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.121012  normal  0.689181 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3166  hypothetical protein  28.7 
 
 		 158 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0603801  normal  0.0644468 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0953  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.78 
 
 		 131 aa  46.6  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0254493 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1277  lactoylglutathione lyase or related lyase  20.71 
 
 		 151 aa  46.6  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.297735  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0288  hypothetical protein  29.87 
 
 		 167 aa  45.8  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.133197  normal  0.680109 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0770  hypothetical protein  27.92 
 
 		 182 aa  45.8  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0295  methylmalonyl-CoA epimerase  26.38 
 
 		 186 aa  45.8  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.985987  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1946  hypothetical protein  28.97 
 
 		 179 aa  45.1  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.321745  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1013  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.17 
 
 		 178 aa  44.7  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0572298  normal  0.362959 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4739  hypothetical protein  26.67 
 
 		 183 aa  44.7  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.861724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0033  hypothetical protein  28.28 
 
 		 179 aa  44.7  0.0007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2908  hypothetical protein  27.97 
 
 		 192 aa  44.7  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.142076  normal  0.706044 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0871  methylmalonyl-CoA epimerase  24.24 
 
 		 135 aa  44.3  0.0008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0552  methylmalonyl-CoA epimerase  25.95 
 
 		 134 aa  43.1  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2781  methylmalonyl-CoA epimerase  33.72 
 
 		 141 aa  42  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2857  hypothetical protein  25.85 
 
 		 175 aa  42  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2901  hypothetical protein  25.85 
 
 		 175 aa  42  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2006  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.82 
 
 		 140 aa  41.6  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0152  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  23.19 
 
 		 134 aa  41.2  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0655  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.57 
 
 		 134 aa  41.2  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000195436  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>