36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_2908 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_2908  hypothetical protein  100 
 
 
192 aa  389  1e-107  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.142076  normal  0.706044 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0629  hypothetical protein  36.81 
 
 
182 aa  103  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.873986 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2255  methylmalonyl-CoA epimerase  37.06 
 
 
174 aa  99  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.539584 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4739  hypothetical protein  35.37 
 
 
183 aa  99  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.861724  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3537  hypothetical protein  37.95 
 
 
183 aa  96.7  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4137  hypothetical protein  34.13 
 
 
175 aa  95.9  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.425431  normal  0.34656 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0215  hypothetical protein  34.68 
 
 
175 aa  93.2  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3733  hypothetical protein  34.34 
 
 
181 aa  92  4e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3806  hypothetical protein  34.34 
 
 
181 aa  92  4e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.559464  normal  0.066376 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3745  hypothetical protein  34.34 
 
 
181 aa  92  4e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1946  hypothetical protein  35.19 
 
 
179 aa  92.4  4e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.321745  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0033  hypothetical protein  34.57 
 
 
179 aa  90.9  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0440  putative lactoylglutathione lyase  34.71 
 
 
179 aa  90.1  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7229  putative lactoylglutathione lyase  34.71 
 
 
179 aa  89.7  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2521  hypothetical protein  30.36 
 
 
172 aa  81.3  0.000000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.121012  normal  0.689181 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0295  methylmalonyl-CoA epimerase  31.32 
 
 
186 aa  77.8  0.00000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.985987  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1013  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.53 
 
 
178 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0572298  normal  0.362959 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2262  hypothetical protein  35.06 
 
 
177 aa  76.3  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0770  hypothetical protein  29.76 
 
 
182 aa  75.1  0.0000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0333  lactoylglutathione lyase-like protein  27.59 
 
 
163 aa  67  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3461  hypothetical protein  30.12 
 
 
177 aa  65.9  0.0000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1041  hypothetical protein  27.59 
 
 
164 aa  63.2  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1865  hypothetical protein  31.71 
 
 
181 aa  62.4  0.000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.669999  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3276  hypothetical protein  32.93 
 
 
174 aa  60.5  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.52081  normal  0.190198 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2271  hypothetical protein  31.29 
 
 
170 aa  57.8  0.00000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.667437 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2443  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.58 
 
 
150 aa  52.8  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3213  hypothetical protein  28.47 
 
 
172 aa  51.6  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2559  hypothetical protein  24.64 
 
 
151 aa  50.8  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000299394  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3561  hypothetical protein  29.41 
 
 
181 aa  50.8  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.0000255712  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3644  hypothetical protein  30 
 
 
171 aa  50.8  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.64826 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2237  methylmalonyl-CoA epimerase  27.4 
 
 
162 aa  50.1  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0271579  hitchhiker  0.00000000000849272 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0790  hypothetical protein  26.35 
 
 
152 aa  49.3  0.00004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1435  lactoylglutathione lyase-like protein  27.61 
 
 
169 aa  47  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0306  hypothetical protein  27.59 
 
 
162 aa  44.7  0.0008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.451967  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0276  hypothetical protein  32.65 
 
 
157 aa  44.3  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.669813  normal  0.188863 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0277  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.18 
 
 
149 aa  41.2  0.009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000264017  hitchhiker  0.0000643241 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>