50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3561 on replicon NC_009427
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009427  Saro_3561  hypothetical protein  100 
 
 		 181 aa  368  1e-101  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.0000255712  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0215  hypothetical protein  35.84 
 
 		 175 aa  104  6e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0440  putative lactoylglutathione lyase  33.91 
 
 		 179 aa  103  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7229  putative lactoylglutathione lyase  33.91 
 
 		 179 aa  102  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1946  hypothetical protein  33.91 
 
 		 179 aa  97.1  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.321745  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4739  hypothetical protein  32.57 
 
 		 183 aa  97.1  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.861724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0033  hypothetical protein  33.33 
 
 		 179 aa  94  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2521  hypothetical protein  30.34 
 
 		 172 aa  90.9  8e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.121012  normal  0.689181 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1865  hypothetical protein  31.61 
 
 		 181 aa  90.5  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.669999  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4137  hypothetical protein  30.77 
 
 		 175 aa  90.1  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.425431  normal  0.34656 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0770  hypothetical protein  31.25 
 
 		 182 aa  89.4  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3537  hypothetical protein  34.27 
 
 		 183 aa  88.6  4e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3745  hypothetical protein  32.18 
 
 		 181 aa  84  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3806  hypothetical protein  32.18 
 
 		 181 aa  84  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.559464  normal  0.066376 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3733  hypothetical protein  32.18 
 
 		 181 aa  84  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2255  methylmalonyl-CoA epimerase  31.79 
 
 		 174 aa  82  0.000000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.539584 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0629  hypothetical protein  28.8 
 
 		 182 aa  77  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.873986 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1013  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.23 
 
 		 178 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0572298  normal  0.362959 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0295  methylmalonyl-CoA epimerase  27.81 
 
 		 186 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.985987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2262  hypothetical protein  35.36 
 
 		 177 aa  75.1  0.0000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3461  hypothetical protein  25.86 
 
 		 177 aa  66.2  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3276  hypothetical protein  38.3 
 
 		 174 aa  64.7  0.0000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.52081  normal  0.190198 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2237  methylmalonyl-CoA epimerase  32.06 
 
 		 162 aa  58.2  0.00000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0271579  hitchhiker  0.00000000000849272 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3412  hypothetical protein  33.33 
 
 		 164 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0399534  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2610  hypothetical protein  30.14 
 
 		 182 aa  53.5  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0177001  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2443  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.8 
 
 		 150 aa  52.4  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0277  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.61 
 
 		 149 aa  50.4  0.00001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000264017  hitchhiker  0.0000643241 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1435  lactoylglutathione lyase-like protein  31.82 
 
 		 169 aa  50.1  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0790  hypothetical protein  29.05 
 
 		 152 aa  50.1  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0349  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.08 
 
 		 134 aa  50.1  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0717499  normal  0.143694 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2908  hypothetical protein  28.95 
 
 		 192 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.142076  normal  0.706044 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2857  hypothetical protein  30.95 
 
 		 175 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3166  hypothetical protein  33.33 
 
 		 158 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0603801  normal  0.0644468 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2901  hypothetical protein  30.95 
 
 		 175 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2887  hypothetical protein  30.77 
 
 		 658 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0871  methylmalonyl-CoA epimerase  25.38 
 
 		 135 aa  47  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4198  methylmalonyl-CoA epimerase  32.31 
 
 		 134 aa  46.6  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.152541  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4223  methylmalonyl-CoA epimerase  32.31 
 
 		 133 aa  47  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0906  methylmalonyl-CoA epimerase  32.58 
 
 		 134 aa  45.8  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.61726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0333  lactoylglutathione lyase-like protein  29.2 
 
 		 163 aa  45.1  0.0006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2814  methylmalonyl-CoA epimerase  42.25 
 
 		 138 aa  44.7  0.0008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.744827  normal  0.836687 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1733  lactoylglutathione lyase  28.47 
 
 		 134 aa  44.7  0.0008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.881956  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3644  hypothetical protein  33.33 
 
 		 171 aa  43.9  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.64826 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4074  methylmalonyl-CoA epimerase  30 
 
 		 133 aa  43.9  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0584893  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1041  hypothetical protein  29.46 
 
 		 164 aa  43.1  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0810  methylmalonyl-CoA epimerase  27.07 
 
 		 146 aa  43.1  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0981  methylmalonyl-CoA epimerase  35.71 
 
 		 139 aa  42.7  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0245792  normal  0.390705 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2559  hypothetical protein  24.53 
 
 		 151 aa  42.7  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000299394  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0290  methylmalonyl-CoA epimerase  26.61 
 
 		 133 aa  41.6  0.007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1277  methylmalonyl-CoA epimerase  28.03 
 
 		 134 aa  41.2  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.149828  normal  0.902197 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>