64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0629 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0629  hypothetical protein  100 
 
 		 182 aa  372  1e-102  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.873986 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4739  hypothetical protein  68.89 
 
 		 183 aa  268  2.9999999999999997e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.861724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4137  hypothetical protein  62.43 
 
 		 175 aa  231  5e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.425431  normal  0.34656 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2521  hypothetical protein  58.33 
 
 		 172 aa  214  5.9999999999999996e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.121012  normal  0.689181 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3745  hypothetical protein  53.49 
 
 		 181 aa  184  7e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3806  hypothetical protein  53.49 
 
 		 181 aa  184  7e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.559464  normal  0.066376 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3733  hypothetical protein  53.49 
 
 		 181 aa  184  7e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1946  hypothetical protein  39.16 
 
 		 179 aa  128  4.0000000000000003e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.321745  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0215  hypothetical protein  39.52 
 
 		 175 aa  127  9.000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0033  hypothetical protein  38.55 
 
 		 179 aa  126  2.0000000000000002e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7229  putative lactoylglutathione lyase  38.1 
 
 		 179 aa  125  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0440  putative lactoylglutathione lyase  38.1 
 
 		 179 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0295  methylmalonyl-CoA epimerase  35.19 
 
 		 186 aa  107  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.985987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0770  hypothetical protein  36.14 
 
 		 182 aa  105  5e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1013  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.75 
 
 		 178 aa  99.8  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0572298  normal  0.362959 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2908  hypothetical protein  36.55 
 
 		 192 aa  93.6  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.142076  normal  0.706044 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2255  methylmalonyl-CoA epimerase  35.12 
 
 		 174 aa  90.9  9e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.539584 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3537  hypothetical protein  31.69 
 
 		 183 aa  86.7  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2262  hypothetical protein  37.29 
 
 		 177 aa  86.7  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3276  hypothetical protein  37.2 
 
 		 174 aa  78.2  0.00000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.52081  normal  0.190198 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1435  lactoylglutathione lyase-like protein  36.51 
 
 		 169 aa  75.9  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2237  methylmalonyl-CoA epimerase  30.94 
 
 		 162 aa  75.5  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0271579  hitchhiker  0.00000000000849272 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1041  hypothetical protein  31.21 
 
 		 164 aa  72.4  0.000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0333  lactoylglutathione lyase-like protein  31.21 
 
 		 163 aa  71.2  0.000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1865  hypothetical protein  31.18 
 
 		 181 aa  71.2  0.000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.669999  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2271  hypothetical protein  36.55 
 
 		 170 aa  67  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.667437 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3561  hypothetical protein  29.17 
 
 		 181 aa  65.1  0.0000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.0000255712  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5705  hypothetical protein  25 
 
 		 185 aa  61.6  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.16357 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3461  hypothetical protein  26.95 
 
 		 177 aa  60.8  0.000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2901  hypothetical protein  32.16 
 
 		 175 aa  60.5  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2857  hypothetical protein  32.16 
 
 		 175 aa  60.5  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2559  hypothetical protein  28.17 
 
 		 151 aa  59.3  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000299394  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3666  hypothetical protein  27.86 
 
 		 202 aa  58.5  0.00000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.150223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2887  hypothetical protein  34.46 
 
 		 658 aa  58.2  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0790  hypothetical protein  28.99 
 
 		 152 aa  57.8  0.00000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2443  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.07 
 
 		 150 aa  56.6  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3412  hypothetical protein  30.77 
 
 		 164 aa  51.6  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0399534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2006  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.45 
 
 		 140 aa  51.6  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0152  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.74 
 
 		 134 aa  50.8  0.000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3166  hypothetical protein  29.22 
 
 		 158 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0603801  normal  0.0644468 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1277  lactoylglutathione lyase or related lyase  26.06 
 
 		 151 aa  49.7  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.297735  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0290  methylmalonyl-CoA epimerase  25.35 
 
 		 133 aa  49.7  0.00002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0639  methylmalonyl-CoA epimerase  26.24 
 
 		 140 aa  49.3  0.00003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.237468  normal  0.259775 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0480  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.01 
 
 		 134 aa  48.9  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0655  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.57 
 
 		 134 aa  48.5  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000195436  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1175  methylmalonyl-CoA epimerase  27.21 
 
 		 134 aa  47.4  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0281042 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2008  hypothetical protein  27.56 
 
 		 166 aa  46.6  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3851  methylmalonyl-CoA epimerase  26.76 
 
 		 156 aa  45.4  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00602371 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3865  methylmalonyl-CoA epimerase  26.76 
 
 		 156 aa  44.7  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.241683  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3939  methylmalonyl-CoA epimerase  26.76 
 
 		 156 aa  44.7  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.368557  normal  0.0232297 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0277  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  24.82 
 
 		 149 aa  44.3  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000264017  hitchhiker  0.0000643241 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0230  methylmalonyl-CoA epimerase  25.35 
 
 		 142 aa  43.9  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4198  methylmalonyl-CoA epimerase  24.82 
 
 		 134 aa  43.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.152541  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4223  methylmalonyl-CoA epimerase  24.82 
 
 		 133 aa  43.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2339  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.57 
 
 		 168 aa  42.4  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.630848  normal  0.527959 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09410  methylmalonyl-CoA epimerase  24 
 
 		 145 aa  42  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.990135  normal  0.273906 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3641  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.26 
 
 		 352 aa  42  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.258218 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0558  methylmalonyl-CoA epimerase  26.6 
 
 		 137 aa  42  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000977172  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1623  methylmalonyl-CoA epimerase  22.63 
 
 		 136 aa  42  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2610  hypothetical protein  32.97 
 
 		 182 aa  41.6  0.006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0177001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3253  methylmalonyl-CoA epimerase  23.96 
 
 		 134 aa  41.6  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000018375  hitchhiker  3.27573e-17 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3303  methylmalonyl-CoA epimerase  25 
 
 		 134 aa  41.6  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000981467  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0522  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.24 
 
 		 134 aa  41.2  0.008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000014865  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1790  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.93 
 
 		 158 aa  41.2  0.008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>