65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3276 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3276  hypothetical protein  100 
 
 		 174 aa  344  4e-94  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.52081  normal  0.190198 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1013  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  57.47 
 
 		 178 aa  192  3e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0572298  normal  0.362959 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0295  methylmalonyl-CoA epimerase  38.89 
 
 		 186 aa  100  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.985987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0629  hypothetical protein  37.2 
 
 		 182 aa  96.3  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.873986 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4739  hypothetical protein  36.42 
 
 		 183 aa  91.3  6e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.861724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4137  hypothetical protein  36.53 
 
 		 175 aa  89.4  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.425431  normal  0.34656 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2521  hypothetical protein  35.37 
 
 		 172 aa  88.6  4e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.121012  normal  0.689181 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2255  methylmalonyl-CoA epimerase  35.76 
 
 		 174 aa  88.2  5e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.539584 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7229  putative lactoylglutathione lyase  35.71 
 
 		 179 aa  85.1  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0440  putative lactoylglutathione lyase  35.71 
 
 		 179 aa  85.5  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3745  hypothetical protein  41.6 
 
 		 181 aa  84  9e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3806  hypothetical protein  41.6 
 
 		 181 aa  84  9e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.559464  normal  0.066376 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3733  hypothetical protein  41.6 
 
 		 181 aa  84  9e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2262  hypothetical protein  38.64 
 
 		 177 aa  84  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1865  hypothetical protein  33.73 
 
 		 181 aa  79.3  0.00000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.669999  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1946  hypothetical protein  34.91 
 
 		 179 aa  77.8  0.00000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.321745  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0033  hypothetical protein  34.13 
 
 		 179 aa  78.2  0.00000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0215  hypothetical protein  32.34 
 
 		 175 aa  77.4  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0770  hypothetical protein  32.94 
 
 		 182 aa  72.8  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3561  hypothetical protein  37 
 
 		 181 aa  67.4  0.00000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.0000255712  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2443  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.2 
 
 		 150 aa  62  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2271  hypothetical protein  35.95 
 
 		 170 aa  62  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.667437 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3537  hypothetical protein  32.91 
 
 		 183 aa  62  0.000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1435  lactoylglutathione lyase-like protein  30.95 
 
 		 169 aa  58.5  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1041  hypothetical protein  28.37 
 
 		 164 aa  56.2  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0152  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.94 
 
 		 134 aa  55.8  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3213  hypothetical protein  30.34 
 
 		 172 aa  55.1  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2006  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.28 
 
 		 140 aa  53.9  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0480  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.25 
 
 		 134 aa  53.9  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3461  hypothetical protein  35.85 
 
 		 177 aa  53.1  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0333  lactoylglutathione lyase-like protein  30.47 
 
 		 163 aa  53.1  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2237  methylmalonyl-CoA epimerase  28.93 
 
 		 162 aa  52.8  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0271579  hitchhiker  0.00000000000849272 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3644  hypothetical protein  27.78 
 
 		 171 aa  52.4  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.64826 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2908  hypothetical protein  30.28 
 
 		 192 aa  52.4  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.142076  normal  0.706044 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0288  hypothetical protein  30.77 
 
 		 167 aa  48.9  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.133197  normal  0.680109 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3412  hypothetical protein  33.07 
 
 		 164 aa  47.4  0.00009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0399534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0790  hypothetical protein  30 
 
 		 152 aa  46.2  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3166  hypothetical protein  32.67 
 
 		 158 aa  47  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0603801  normal  0.0644468 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2559  hypothetical protein  23.74 
 
 		 151 aa  45.8  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000299394  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0349  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.14 
 
 		 134 aa  44.7  0.0007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0717499  normal  0.143694 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4223  methylmalonyl-CoA epimerase  31.43 
 
 		 133 aa  44.3  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1995  glyoxalase family protein  27.46 
 
 		 139 aa  44.7  0.0008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00316995  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4198  methylmalonyl-CoA epimerase  31.69 
 
 		 134 aa  43.9  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.152541  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0200  methylmalonyl-CoA epimerase  26.67 
 
 		 140 aa  43.9  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000715247  normal  0.843381 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1946  glyoxalase family protein  26.06 
 
 		 139 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5587800000000002e-23 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1774  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.46 
 
 		 139 aa  43.9  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000533955  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1773  glyoxalase family protein  26.06 
 
 		 139 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00831345  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1752  glyoxalase family protein  26.06 
 
 		 139 aa  43.9  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000441097  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1730  glyoxalase family protein  26.06 
 
 		 139 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00522629  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1910  glyoxalase family protein  26.06 
 
 		 139 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000915588  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4074  methylmalonyl-CoA epimerase  31.43 
 
 		 133 aa  43.9  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0584893  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0655  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.61 
 
 		 134 aa  44.3  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000195436  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0104  methylmalonyl-CoA epimerase  32.17 
 
 		 137 aa  43.1  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2008  hypothetical protein  32.26 
 
 		 166 aa  42.7  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3428  glyoxalase family protein  30.07 
 
 		 139 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0993579  hitchhiker  0.000000357721 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1916  glyoxalase family protein  30.07 
 
 		 139 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.037102  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0981  methylmalonyl-CoA epimerase  30.07 
 
 		 139 aa  42.4  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0245792  normal  0.390705 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2610  hypothetical protein  28.87 
 
 		 182 aa  42  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0177001  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0877  methylmalonyl-CoA epimerase  25.53 
 
 		 134 aa  42  0.004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.157449  normal  0.0450617 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0306  hypothetical protein  28.87 
 
 		 162 aa  42  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.451967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1282  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.96 
 
 		 134 aa  42  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5865  methylmalonyl-CoA epimerase  27.4 
 
 		 136 aa  42  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0571  methylmalonyl-CoA epimerase  31.91 
 
 		 137 aa  41.2  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.82853e-18 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0230  methylmalonyl-CoA epimerase  28.38 
 
 		 142 aa  41.2  0.008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3303  methylmalonyl-CoA epimerase  27.4 
 
 		 134 aa  40.8  0.009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000981467  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>