56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0306 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0306  hypothetical protein  100 
 
 		 162 aa  332  2e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.451967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2237  methylmalonyl-CoA epimerase  30.14 
 
 		 162 aa  58.9  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0271579  hitchhiker  0.00000000000849272 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2559  hypothetical protein  25.36 
 
 		 151 aa  57.8  0.00000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000299394  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1277  lactoylglutathione lyase or related lyase  27.46 
 
 		 151 aa  57.8  0.00000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.297735  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2443  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.63 
 
 		 150 aa  56.6  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1435  lactoylglutathione lyase-like protein  33.63 
 
 		 169 aa  56.6  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0790  hypothetical protein  33.68 
 
 		 152 aa  55.5  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2271  hypothetical protein  34.27 
 
 		 170 aa  55.1  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.667437 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0436  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.35 
 
 		 148 aa  54.3  0.0000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0306  methylmalonyl-CoA epimerase  32.26 
 
 		 141 aa  53.1  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3306  methylmalonyl-CoA epimerase  28.89 
 
 		 135 aa  53.5  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.369567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0152  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.89 
 
 		 134 aa  51.2  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2262  hypothetical protein  30.1 
 
 		 177 aa  51.2  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3666  hypothetical protein  34.29 
 
 		 202 aa  50.4  0.000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.150223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3213  hypothetical protein  25.18 
 
 		 172 aa  49.7  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0480  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.15 
 
 		 134 aa  49.3  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03285  Lactoylglutathione lyase and related lyase  27.78 
 
 		 135 aa  49.7  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.275732  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1613  glyoxalase family protein  28.26 
 
 		 134 aa  48.9  0.00003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3303  methylmalonyl-CoA epimerase  31.11 
 
 		 134 aa  47.8  0.00007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000981467  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0877  methylmalonyl-CoA epimerase  27.17 
 
 		 134 aa  47.8  0.00007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.157449  normal  0.0450617 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1623  methylmalonyl-CoA epimerase  27.78 
 
 		 136 aa  47.4  0.00008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0200  methylmalonyl-CoA epimerase  28.57 
 
 		 140 aa  47  0.0001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000715247  normal  0.843381 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1869  methylmalonyl-CoA epimerase  30.94 
 
 		 134 aa  46.2  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.441583  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5823  methylmalonyl-CoA epimerase  25.56 
 
 		 135 aa  46.2  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.609352 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1564  methylmalonyl-CoA epimerase  25.56 
 
 		 134 aa  45.8  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.395959 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0655  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28 
 
 		 134 aa  46.2  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000195436  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0522  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.47 
 
 		 134 aa  45.4  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000014865  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0277  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  24.29 
 
 		 149 aa  45.4  0.0003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000264017  hitchhiker  0.0000643241 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3963  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.29 
 
 		 150 aa  45.4  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0333  lactoylglutathione lyase-like protein  30.11 
 
 		 163 aa  44.7  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3891  methylmalonyl-CoA epimerase  28.72 
 
 		 145 aa  44.7  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.394666  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0356  methylmalonyl-CoA epimerase  25.77 
 
 		 192 aa  43.9  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2901  hypothetical protein  35.63 
 
 		 175 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0558  methylmalonyl-CoA epimerase  27.78 
 
 		 137 aa  43.5  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000977172  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2887  hypothetical protein  35.63 
 
 		 658 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1289  lactoylglutathione lyase  26.17 
 
 		 137 aa  43.1  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2857  hypothetical protein  35.63 
 
 		 175 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09410  methylmalonyl-CoA epimerase  24.44 
 
 		 145 aa  43.1  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.990135  normal  0.273906 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0571  methylmalonyl-CoA epimerase  27.78 
 
 		 137 aa  42.7  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.82853e-18 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2285  methylmalonyl-CoA epimerase  24.73 
 
 		 140 aa  43.1  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000102737  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0981  methylmalonyl-CoA epimerase  27.96 
 
 		 139 aa  42.4  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0245792  normal  0.390705 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3166  hypothetical protein  31.87 
 
 		 158 aa  42  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0603801  normal  0.0644468 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0455  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.53 
 
 		 134 aa  42.4  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.571993 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1170  methylmalonyl-CoA epimerase  23.33 
 
 		 135 aa  42.4  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.107967  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0295  methylmalonyl-CoA epimerase  26.62 
 
 		 186 aa  42  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.985987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2395  methylmalonyl-CoA epimerase  25 
 
 		 147 aa  42  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.754558  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1175  methylmalonyl-CoA epimerase  26.6 
 
 		 134 aa  41.6  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0281042 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5705  hypothetical protein  27.45 
 
 		 185 aa  41.6  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.16357 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1258  methylmalonyl-CoA epimerase  24.58 
 
 		 147 aa  41.6  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3258  methylmalonyl-CoA epimerase  25.56 
 
 		 134 aa  41.2  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000316472  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0290  methylmalonyl-CoA epimerase  23.91 
 
 		 133 aa  41.2  0.005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2610  hypothetical protein  29.67 
 
 		 182 aa  41.6  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0177001  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1852  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.71 
 
 		 133 aa  41.2  0.006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2006  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.89 
 
 		 140 aa  41.2  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0770  hypothetical protein  30.61 
 
 		 182 aa  40.8  0.009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1316  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.89 
 
 		 135 aa  40.4  0.01  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>