104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2155 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_2155  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  100 
 
 
139 aa  280  4.0000000000000003e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0614905  normal  0.240575 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1790  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  40.44 
 
 
158 aa  72.4  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0104  methylmalonyl-CoA epimerase  35.21 
 
 
137 aa  71.2  0.000000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1361  methylmalonyl-CoA epimerase  32.12 
 
 
129 aa  69.7  0.00000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  2.7651e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5823  methylmalonyl-CoA epimerase  29.41 
 
 
135 aa  68.6  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.609352 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3197  methylmalonyl-CoA epimerase  30.15 
 
 
134 aa  66.6  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0552  methylmalonyl-CoA epimerase  30.22 
 
 
134 aa  65.9  0.0000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0455  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.32 
 
 
134 aa  64.3  0.0000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.571993 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0655  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.68 
 
 
134 aa  63.9  0.0000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000195436  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3303  methylmalonyl-CoA epimerase  27.66 
 
 
134 aa  63.9  0.0000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000981467  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03285  Lactoylglutathione lyase and related lyase  27.94 
 
 
135 aa  63.5  0.0000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.275732  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2348  methylmalonyl-CoA epimerase  35.11 
 
 
131 aa  63.5  0.0000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09410  methylmalonyl-CoA epimerase  33.57 
 
 
145 aa  63.2  0.000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.990135  normal  0.273906 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1623  methylmalonyl-CoA epimerase  32.86 
 
 
136 aa  62.4  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5865  methylmalonyl-CoA epimerase  37.8 
 
 
136 aa  62.4  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0659  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.03 
 
 
134 aa  61.6  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00502246  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0480  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.03 
 
 
134 aa  61.6  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0152  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.03 
 
 
134 aa  60.8  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0228  methylmalonyl-CoA epimerase  29.55 
 
 
132 aa  60.5  0.000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3258  methylmalonyl-CoA epimerase  26.24 
 
 
134 aa  60.1  0.000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000316472  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3865  methylmalonyl-CoA epimerase  36.59 
 
 
156 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.241683  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3939  methylmalonyl-CoA epimerase  36.59 
 
 
156 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.368557  normal  0.0232297 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11354  hypothetical protein  28.08 
 
 
151 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.498935  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2006  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.73 
 
 
140 aa  59.7  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0571  methylmalonyl-CoA epimerase  31.16 
 
 
137 aa  59.7  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.82853e-18 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1013  methylmalonyl-CoA epimerase  33.57 
 
 
128 aa  59.3  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.752457  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2285  methylmalonyl-CoA epimerase  32.18 
 
 
140 aa  58.9  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000102737  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1564  methylmalonyl-CoA epimerase  26.81 
 
 
134 aa  58.9  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.395959 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1989  methylmalonyl-CoA epimerase  31.88 
 
 
127 aa  59.3  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2781  methylmalonyl-CoA epimerase  37.8 
 
 
141 aa  58.5  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3851  methylmalonyl-CoA epimerase  35.37 
 
 
156 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00602371 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1341  methylmalonyl-CoA epimerase  33.75 
 
 
136 aa  58.2  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.886384  normal  0.16528 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0080  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.12 
 
 
135 aa  58.2  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0425619  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0558  methylmalonyl-CoA epimerase  30.22 
 
 
137 aa  57.8  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000977172  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3253  methylmalonyl-CoA epimerase  26.06 
 
 
134 aa  57.8  0.00000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000018375  hitchhiker  3.27573e-17 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0639  methylmalonyl-CoA epimerase  28.67 
 
 
140 aa  57.4  0.00000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.237468  normal  0.259775 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4306  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35 
 
 
161 aa  57  0.00000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.725625 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1488  methylmalonyl-CoA epimerase  24.11 
 
 
134 aa  57  0.00000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.383789  normal  0.131397 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28560  methylmalonyl-CoA epimerase  29.5 
 
 
153 aa  57  0.00000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.215327 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0586  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.21 
 
 
135 aa  56.6  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2339  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.75 
 
 
168 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.630848  normal  0.527959 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0349  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.18 
 
 
134 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0717499  normal  0.143694 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0871  methylmalonyl-CoA epimerase  28.68 
 
 
135 aa  55.5  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0981  methylmalonyl-CoA epimerase  31.76 
 
 
139 aa  55.5  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0245792  normal  0.390705 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6105  methylmalonyl-CoA epimerase  38.55 
 
 
146 aa  55.5  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1126  hypothetical protein  30 
 
 
135 aa  54.7  0.0000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0680  methylmalonyl-CoA epimerase  30.83 
 
 
131 aa  54.7  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.227621  normal  0.151437 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1316  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.94 
 
 
135 aa  55.1  0.0000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1852  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.55 
 
 
133 aa  55.1  0.0000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0230  methylmalonyl-CoA epimerase  27.08 
 
 
142 aa  54.3  0.0000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0522  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.87 
 
 
134 aa  54.3  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000014865  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0306  methylmalonyl-CoA epimerase  29.55 
 
 
141 aa  54.3  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1170  methylmalonyl-CoA epimerase  27.14 
 
 
135 aa  54.3  0.0000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.107967  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4198  methylmalonyl-CoA epimerase  38.75 
 
 
134 aa  54.3  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.152541  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3611  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.94 
 
 
157 aa  53.5  0.0000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1264  methylmalonyl-CoA epimerase  37.97 
 
 
167 aa  53.9  0.0000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0685112  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4223  methylmalonyl-CoA epimerase  37.5 
 
 
133 aa  53.5  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0555  methylmalonyl-CoA epimerase  35 
 
 
127 aa  53.5  0.0000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4074  methylmalonyl-CoA epimerase  37.5 
 
 
133 aa  53.5  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0584893  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3993  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.53 
 
 
159 aa  53.5  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00061687 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0200  methylmalonyl-CoA epimerase  24.69 
 
 
140 aa  53.1  0.000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000715247  normal  0.843381 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2364  methylmalonyl-CoA epimerase  36.14 
 
 
135 aa  52.8  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1167  methylmalonyl-CoA epimerase  25 
 
 
135 aa  52  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.217696  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1796  methylmalonyl-CoA epimerase  34.15 
 
 
170 aa  52.4  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2887  methylmalonyl-CoA epimerase  35.8 
 
 
129 aa  52.4  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.228803  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4113  methylmalonyl-CoA epimerase  35.37 
 
 
162 aa  52.4  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0776501  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1282  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.53 
 
 
134 aa  52  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0290  methylmalonyl-CoA epimerase  27.5 
 
 
133 aa  51.6  0.000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0916  methylmalonyl-CoA epimerase  27.54 
 
 
140 aa  51.2  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.311023 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1175  methylmalonyl-CoA epimerase  26.95 
 
 
134 aa  50.8  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0281042 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1696  methylmalonyl-CoA epimerase  27.54 
 
 
140 aa  50.4  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.019096  normal  0.134039 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3891  methylmalonyl-CoA epimerase  27.46 
 
 
145 aa  50.1  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.394666  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1869  methylmalonyl-CoA epimerase  40 
 
 
134 aa  48.9  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.441583  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1949  methylmalonyl-CoA epimerase  26.9 
 
 
157 aa  48.9  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.331779  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1613  glyoxalase family protein  25 
 
 
134 aa  48.5  0.00003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2507  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.59 
 
 
141 aa  48.1  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0106102  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3104  methylmalonyl-CoA epimerase  30.56 
 
 
163 aa  48.1  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000698993  hitchhiker  0.0000492352 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6000  methylmalonyl-CoA epimerase  31.25 
 
 
143 aa  47.8  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0251153 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2225  methylmalonyl-CoA epimerase  29.63 
 
 
136 aa  47  0.00009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2443  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.56 
 
 
150 aa  45.8  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0356  methylmalonyl-CoA epimerase  32.93 
 
 
192 aa  45.1  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0953  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.78 
 
 
131 aa  45.4  0.0003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0254493 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2559  hypothetical protein  26.97 
 
 
151 aa  45.1  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000299394  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1258  methylmalonyl-CoA epimerase  23.91 
 
 
147 aa  45.1  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1282  methylmalonyl-CoA epimerase  37.21 
 
 
142 aa  45.1  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.922944  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0277  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.89 
 
 
149 aa  44.3  0.0005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000264017  hitchhiker  0.0000643241 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0877  methylmalonyl-CoA epimerase  23.65 
 
 
134 aa  44.3  0.0005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.157449  normal  0.0450617 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1773  glyoxalase family protein  27.71 
 
 
139 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00831345  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1910  glyoxalase family protein  27.71 
 
 
139 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000915588  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1774  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.59 
 
 
139 aa  42.7  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000533955  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1995  glyoxalase family protein  28.24 
 
 
139 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00316995  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1752  glyoxalase family protein  28.24 
 
 
139 aa  42.7  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000441097  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1730  glyoxalase family protein  28.24 
 
 
139 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00522629  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1916  glyoxalase family protein  28.24 
 
 
139 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.037102  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1946  glyoxalase family protein  28.24 
 
 
139 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5587800000000002e-23 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3306  methylmalonyl-CoA epimerase  24.44 
 
 
135 aa  41.6  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.369567  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3428  glyoxalase family protein  28.24 
 
 
139 aa  41.6  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0993579  hitchhiker  0.000000357721 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4142  methylmalonyl-CoA epimerase  37.21 
 
 
134 aa  41.6  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.65243  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4406  methylmalonyl-CoA epimerase  37.21 
 
 
134 aa  41.2  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.865386  normal  0.62826 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2198  methylmalonyl-CoA epimerase  29.79 
 
 
136 aa  41.2  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>