228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0586 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_0586  radical SAM family protein  100 
 
 		 350 aa  712    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0506  radical SAM domain-containing protein  60.29 
 
 		 355 aa  421  1e-117  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0244  Radical SAM domain protein  28.57 
 
 		 342 aa  120  3e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0305821  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1807  radical SAM domain-containing protein  29.58 
 
 		 363 aa  115  7.999999999999999e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2586  radical SAM domain-containing protein  25.73 
 
 		 318 aa  98.6  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0509  radical SAM domain-containing protein  27.13 
 
 		 359 aa  91.3  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000294869  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0505  radical SAM domain-containing protein  28.86 
 
 		 367 aa  80.9  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0919  radical SAM domain-containing protein  26.57 
 
 		 338 aa  80.1  0.00000000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2032  radical SAM domain-containing protein  27.7 
 
 		 411 aa  79.3  0.00000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.744875 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0794  radical SAM domain-containing protein  27.36 
 
 		 446 aa  77  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0444  Radical SAM domain protein  28.05 
 
 		 401 aa  75.9  0.0000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.121875 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0122  Radical SAM domain protein  25.35 
 
 		 344 aa  75.9  0.000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1099  radical SAM domain-containing protein  24.63 
 
 		 501 aa  74.3  0.000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0879  radical SAM domain-containing protein  28.09 
 
 		 349 aa  71.2  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.11149  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4272  Radical SAM domain protein  26.14 
 
 		 337 aa  70.9  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1786  Radical SAM domain protein  26.98 
 
 		 377 aa  69.3  0.00000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0587  radical SAM family protein  29.91 
 
 		 376 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0912  Radical SAM domain protein  30.21 
 
 		 368 aa  68.6  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.492815  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4323  radical SAM family protein  28.45 
 
 		 373 aa  67.4  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1270  Radical SAM domain protein  25.15 
 
 		 320 aa  66.6  0.0000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0511064  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3559  radical SAM domain-containing protein  27.86 
 
 		 347 aa  66.6  0.0000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.152847  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1135  radical SAM domain-containing protein  26.35 
 
 		 325 aa  65.5  0.000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0101  radical SAM domain-containing protein  25.24 
 
 		 323 aa  65.5  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0881  radical SAM family Fe-S protein  25.25 
 
 		 351 aa  65.1  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.730435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0894  radical SAM domain-containing protein  24.45 
 
 		 320 aa  64.7  0.000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.192099  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1814  radical SAM domain-containing protein  22.87 
 
 		 369 aa  63.9  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0102  radical SAM domain-containing protein  26.18 
 
 		 323 aa  63.9  0.000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1256  Radical SAM domain protein  26.02 
 
 		 330 aa  63.5  0.000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2461  Radical SAM domain protein  22.75 
 
 		 380 aa  63.2  0.000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  23.99 
 
 		 496 aa  63.2  0.000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2159  radical SAM domain-containing protein  26.33 
 
 		 330 aa  62.4  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0939338  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0512  radical SAM domain-containing protein  25.08 
 
 		 347 aa  62.4  0.00000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000575478  hitchhiker  0.000767983 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0862  radical SAM domain-containing protein  26.26 
 
 		 317 aa  61.6  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000001092  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1002  Radical SAM domain protein  21.04 
 
 		 365 aa  61.6  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.808631  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0095  radical SAM domain-containing protein  24.67 
 
 		 316 aa  61.6  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0204398  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1728  hypothetical protein  33.1 
 
 		 491 aa  60.8  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0031  Radical SAM domain protein  32.21 
 
 		 372 aa  60.8  0.00000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.082628  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1245  radical SAM family protein  25.54 
 
 		 335 aa  60.8  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1728  Radical SAM domain protein  30.43 
 
 		 380 aa  60.8  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3350  Radical SAM domain protein  23.95 
 
 		 332 aa  60.5  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3864  Radical SAM domain protein  29.03 
 
 		 319 aa  60.5  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0170641  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2352  radical SAM family protein  28.5 
 
 		 487 aa  59.7  0.00000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.227908 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3158  radical SAM domain-containing protein  24.17 
 
 		 428 aa  59.7  0.00000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.271249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4936  Radical SAM domain protein  28.14 
 
 		 410 aa  58.9  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3162  radical SAM domain-containing protein  31.09 
 
 		 351 aa  58.5  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.313662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2198  radical SAM domain-containing protein  28.7 
 
 		 373 aa  58.2  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0314345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1343  radical SAM domain-containing protein  26.33 
 
 		 334 aa  58.5  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2362  Radical SAM domain protein  25.48 
 
 		 409 aa  58.2  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000000979641  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0298  radical SAM domain-containing protein  23.7 
 
 		 491 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0608  coenzyme PQQ synthesis protein E  22.93 
 
 		 330 aa  57.4  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.051547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1180  radical SAM domain-containing protein  27.96 
 
 		 418 aa  57.8  0.0000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.832103  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1255  Radical SAM domain protein  25.23 
 
 		 330 aa  57.4  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.411599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2181  radical SAM domain-containing protein  31.25 
 
 		 491 aa  57  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.161056  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1951  radical SAM family Fe-S protein  21.77 
 
 		 326 aa  57  0.0000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1862  radical SAM domain-containing protein  23.38 
 
 		 491 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.27199  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1743  heme biosynthesis protein  23.38 
 
 		 491 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0870  radical SAM domain-containing protein  23.38 
 
 		 491 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1157  radical SAM domain-containing protein  23.38 
 
 		 491 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.43485  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0390  radical SAM domain-containing protein  23.38 
 
 		 491 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2134  radical SAM domain-containing protein  23.38 
 
 		 491 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0055  radical SAM domain-containing protein  24.24 
 
 		 429 aa  56.2  0.0000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1247  radical SAM family protein  28.74 
 
 		 355 aa  56.2  0.0000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.421544 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0459  Radical SAM domain protein  21.26 
 
 		 375 aa  56.2  0.0000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000994889  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04320  Radical SAM domain protein  25.31 
 
 		 459 aa  55.8  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0958  radical SAM domain-containing protein  33.33 
 
 		 356 aa  55.5  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0775  Radical SAM domain protein  26.35 
 
 		 405 aa  55.8  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3059  Radical SAM domain protein  31.21 
 
 		 418 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.699008  normal  0.88782 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6508  Radical SAM domain protein  26.63 
 
 		 366 aa  55.8  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.969716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5552  radical SAM domain-containing protein  23.03 
 
 		 482 aa  55.8  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.789613 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1128  Radical SAM domain protein  24.69 
 
 		 327 aa  55.1  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.823251 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1309  radical SAM family protein  27.13 
 
 		 357 aa  54.7  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0341  Radical SAM domain protein  25.45 
 
 		 358 aa  55.1  0.000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000860608  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2983  Radical SAM domain protein  31.08 
 
 		 394 aa  54.7  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1296  radical SAM domain-containing protein  27.94 
 
 		 395 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595995 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1665  Radical SAM domain protein  21.82 
 
 		 438 aa  53.5  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3154  radical SAM family protein  28.66 
 
 		 367 aa  53.5  0.000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1560  radical SAM domain-containing protein  24.47 
 
 		 412 aa  53.1  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0307632  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1236  radical SAM family Fe-S protein  21.95 
 
 		 397 aa  53.1  0.000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1676  radical SAM domain-containing protein  22.22 
 
 		 385 aa  53.1  0.000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2076  Radical SAM domain protein  30.86 
 
 		 382 aa  53.1  0.000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1737  coenzyme PQQ synthesis protein  26.37 
 
 		 378 aa  53.1  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1875  coenzyme PQQ synthesis protein  26.37 
 
 		 377 aa  53.1  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0228  Methyltransferase type 11  29.03 
 
 		 1002 aa  52.4  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2110  radical SAM domain protein  22.22 
 
 		 385 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.73629  normal  0.549751 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0429  Radical SAM domain protein  31.25 
 
 		 324 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12330  predicted Fe-S oxidoreductase  24.68 
 
 		 561 aa  52  0.00001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1017  Radical SAM domain protein  25.87 
 
 		 345 aa  52  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3326  radical SAM domain-containing protein  26.95 
 
 		 396 aa  52.8  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.579785 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1767  radical SAM domain-containing protein  31.58 
 
 		 333 aa  52.4  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.186252  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01455  hypothetical protein  21.93 
 
 		 385 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1713  coenzyme PQQ synthesis protein  26.37 
 
 		 377 aa  51.6  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00161975  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1687  coenzyme PQQ synthesis protein  26.37 
 
 		 342 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1582  radical SAM domain-containing protein  21.93 
 
 		 385 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.28073  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1880  Radical SAM domain protein  31.11 
 
 		 359 aa  51.6  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1910  putative coenzyme PQQ synthesis protein  26.37 
 
 		 377 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.302049 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0691  radical SAM domain-containing protein  22.5 
 
 		 333 aa  51.6  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2921  radical SAM domain-containing protein  33.33 
 
 		 324 aa  51.6  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.925202  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01468  hypothetical protein  21.93 
 
 		 385 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2160  radical SAM domain-containing protein  21.93 
 
 		 385 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.821975 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0511  radical SAM domain-containing protein  23.32 
 
 		 366 aa  52  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00485755  decreased coverage  0.00020138 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>