82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2869 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_2869  FMN-binding domain protein  100 
 
 		 382 aa  774    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00242086  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0698  FMN-binding domain protein  31.16 
 
 		 360 aa  190  2.9999999999999997e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.911747  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0694  FMN-binding domain protein  27.71 
 
 		 391 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1638  FMN-binding domain protein  29.12 
 
 		 373 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000487572  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2342  FMN-binding domain protein  28.09 
 
 		 453 aa  160  3e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.607847  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0237  transcriptional regulator, putative  28.53 
 
 		 406 aa  156  5.0000000000000005e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.130282  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0310  transcriptional regulator, putative  27.05 
 
 		 572 aa  151  2e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1289  membrane-bound regulatory protein  30.37 
 
 		 389 aa  147  4.0000000000000006e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1598  transcriptional regulator, putative  28.02 
 
 		 396 aa  140  3.9999999999999997e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00672193  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0717  FMN-binding domain protein  26.39 
 
 		 393 aa  139  7e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1480  membrane bound regulatory protein, VcrC-like protein  27.66 
 
 		 399 aa  136  5e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1344  hypothetical protein  28.02 
 
 		 383 aa  135  9.999999999999999e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.024992  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4220  FMN-binding domain protein  23.96 
 
 		 480 aa  133  5e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000416896  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0738  FMN-binding domain protein  26.02 
 
 		 392 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000701173  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3767  sulfite reductase alpha subunit (flavoprotein)-like protein  27.04 
 
 		 969 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1596  transcriptional regulator, putative  26.34 
 
 		 397 aa  126  6e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000252282  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1343  FMN-binding domain-containing protein  26.63 
 
 		 397 aa  126  6e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.000000579258  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1479  membrane bound regulatory protein, VcrC-like protein  26.37 
 
 		 397 aa  124  2e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00732489  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2622  FMN-binding domain protein  26.76 
 
 		 321 aa  110  5e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2105  hypothetical protein  26.96 
 
 		 408 aa  95.1  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1623  membrane bound regulatory protein, putative  27.22 
 
 		 396 aa  82.4  0.00000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1739  regulatory protein NosR  24.62 
 
 		 715 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20230  regulatory protein NosR  24.08 
 
 		 715 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.578726 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2220  FMN-binding  26.5 
 
 		 716 aa  62  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000053417  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1482  FMN-binding domain-containing protein  25.88 
 
 		 886 aa  62  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2339  FMN-binding domain protein  24.77 
 
 		 638 aa  60.1  0.00000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1429  FMN-binding domain-containing protein  23.08 
 
 		 708 aa  58.9  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.865866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1073  FMN-binding domain-containing protein  26.46 
 
 		 712 aa  58.5  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.537433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0078  regulator of nitric oxide reductase transcription  26.86 
 
 		 625 aa  58.5  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.196865 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2563  FMN-binding domain protein  27.23 
 
 		 714 aa  58.2  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.132297  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3399  FMN-binding domain-containing protein  26.21 
 
 		 713 aa  57.4  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.360952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1093  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  37.39 
 
 		 178 aa  55.5  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.997884  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3181  nitrous oxide reductase regulatory protein NosR  20.39 
 
 		 687 aa  55.1  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.333663  normal  0.835049 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1059  FMN-binding domain protein  25.89 
 
 		 873 aa  55.1  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.602709  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4220  FMN-binding domain-containing protein  24.48 
 
 		 726 aa  54.3  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.384845  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4731  putative transcriptional regulator NosR  24.37 
 
 		 719 aa  54.7  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3961  regulatory protein, putative  28.26 
 
 		 743 aa  54.3  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0857472 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3079  FMN-binding domain-containing protein  24.2 
 
 		 714 aa  54.3  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1318  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  28.57 
 
 		 344 aa  54.3  0.000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0617616  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1138  FMN-binding domain-containing protein  24.55 
 
 		 873 aa  53.9  0.000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.599326  normal  0.568737 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2253  FMN-binding domain-containing protein  23.94 
 
 		 703 aa  53.1  0.000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2350  FMN-binding domain protein  26.2 
 
 		 764 aa  53.1  0.000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0697  FMN-binding domain protein  27.73 
 
 		 201 aa  52.8  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.820437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3198  FMN-binding  23.21 
 
 		 897 aa  52.4  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0274  transcriptional regulator NosR, putative  26.09 
 
 		 787 aa  51.6  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.288385  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0427  FMN-binding  25.69 
 
 		 764 aa  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.653996  normal  0.802121 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1083  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  24.07 
 
 		 368 aa  52  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0590058 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2371  iron-sulfur cluster-binding protein  27.4 
 
 		 277 aa  52  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000000206096  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3193  nitrous oxide reductase regulatory protein NosR  24.48 
 
 		 728 aa  51.6  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0250  putative transcriptional regulator NosR  24.3 
 
 		 763 aa  51.6  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4347  FMN-binding domain-containing protein  26.95 
 
 		 788 aa  52  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0663  nitrous oxide expression regulator, NosR  23.81 
 
 		 727 aa  51.2  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.342407  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0686  regulator of nitric oxide reductase transcription  25.12 
 
 		 696 aa  50.8  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0382945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3141  FMN-binding  27.21 
 
 		 752 aa  50.8  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0166  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  25.97 
 
 		 290 aa  49.7  0.00009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4868  FMN-binding domain protein  24.72 
 
 		 701 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.153246  normal  0.0739563 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_881  NapH protein  26.12 
 
 		 480 aa  48.1  0.0003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2862  FMN-binding domain-containing protein  20.34 
 
 		 749 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1972  FMN-binding domain-containing protein  36.25 
 
 		 449 aa  48.1  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.195856 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0709  putative signal peptide protein  26.72 
 
 		 181 aa  47.8  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.549423  normal  0.030053 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1369  transmembrane regulatory nosR transcription regulator protein  21.56 
 
 		 872 aa  47.4  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2432  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  29.25 
 
 		 197 aa  47  0.0006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000744665  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1157  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  28.72 
 
 		 181 aa  46.6  0.0007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.40861 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6007  nitrous oxide reductase regulatory protein NosR  26.85 
 
 		 764 aa  46.6  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0425173 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2486  FMN-binding domain-containing protein  22.75 
 
 		 681 aa  46.6  0.0008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.821812 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4916  putative transmembrane regulatory protein nosR  23.47 
 
 		 872 aa  45.8  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00666033 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2414  FMN-binding domain-containing protein  22.08 
 
 		 699 aa  45.8  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0308  FMN-binding domain-containing protein  30.37 
 
 		 199 aa  45.4  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0470915  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3789  FMN-binding domain-containing protein  30.15 
 
 		 175 aa  45.1  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000077872  decreased coverage  0.000000492054 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4060  FMN-binding domain protein  21.7 
 
 		 887 aa  45.1  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.034524  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4172  nitrous oxide expression regulator, NosR  21.7 
 
 		 887 aa  45.1  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3458  FMN-binding domain-containing protein  24.3 
 
 		 184 aa  44.7  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000627682  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0905  FMN-binding domain-containing protein  24.3 
 
 		 184 aa  44.7  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000303402  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0557  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  22.64 
 
 		 444 aa  44.7  0.003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1535  FMN-binding domain protein  24.57 
 
 		 704 aa  44.3  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1070  ferredoxin  28.68 
 
 		 417 aa  44.3  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000699309  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6246  nitrous oxide expression regulator, NosR  26.19 
 
 		 702 aa  43.9  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0956  FMN-binding domain-containing protein  25.23 
 
 		 183 aa  43.1  0.007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0275776  normal  0.549187 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0921  FMN-binding domain-containing protein  25.23 
 
 		 183 aa  43.1  0.007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00888668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0920  FMN-binding domain-containing protein  25.23 
 
 		 183 aa  43.1  0.007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0051552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3890  FMN-binding domain-containing protein  32.91 
 
 		 189 aa  43.1  0.008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00153293  normal  0.0179558 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1016  quinol dehydrogenase membrane component  26.12 
 
 		 263 aa  42.7  0.01  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>