72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_0920 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_0956  FMN-binding domain-containing protein  99.45 
 
 		 183 aa  376  1e-104  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0275776  normal  0.549187 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0921  FMN-binding domain-containing protein  100 
 
 		 183 aa  377  1e-104  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00888668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0920  FMN-binding domain-containing protein  100 
 
 		 183 aa  377  1e-104  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0051552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3458  FMN-binding domain-containing protein  93.92 
 
 		 184 aa  357  6e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000627682  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0905  FMN-binding domain-containing protein  93.92 
 
 		 184 aa  357  8e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000303402  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2656  putative signal peptide protein  72.41 
 
 		 183 aa  258  3e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000219967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1799  FMN-binding domain protein  50.86 
 
 		 184 aa  189  2.9999999999999997e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.0000508928  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0417  FMN-binding  45.88 
 
 		 179 aa  168  4e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000846474  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0709  putative signal peptide protein  46.75 
 
 		 181 aa  164  6.9999999999999995e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.549423  normal  0.030053 
 
 
-
 
NC_003296  RS01729  signal peptide protein  46.01 
 
 		 186 aa  157  5e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1179  FMN-binding  44.38 
 
 		 173 aa  153  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1558  FMN-binding domain protein  43.12 
 
 		 186 aa  147  7e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.335211 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1564  FMN-binding domain-containing protein  44.57 
 
 		 180 aa  147  1.0000000000000001e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1887  FMN-binding domain protein  41.21 
 
 		 186 aa  144  8.000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00905192  normal  0.670131 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5380  FMN-binding domain protein  43.67 
 
 		 173 aa  141  4e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.17391 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1847  FMN-binding domain protein  43.67 
 
 		 173 aa  141  4e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000189195 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0361  FMN-binding domain protein  41.67 
 
 		 168 aa  140  9.999999999999999e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.221019 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0610  putative signal peptide protein  41.18 
 
 		 171 aa  140  9.999999999999999e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.739239 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3432  FMN-binding domain-containing protein  33.54 
 
 		 149 aa  103  1e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.953268  normal  0.193685 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2626  hypothetical protein  34.52 
 
 		 152 aa  102  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.240318  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1833  FMN-binding domain protein  35 
 
 		 192 aa  97.4  9e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.653717  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3890  FMN-binding domain-containing protein  44.44 
 
 		 189 aa  58.2  0.00000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00153293  normal  0.0179558 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4034  FMN-binding domain-containing protein  31.18 
 
 		 176 aa  56.6  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0588  FMN-binding  38.37 
 
 		 169 aa  56.6  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00870871  decreased coverage  0.000120733 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0978  FMN-binding domain protein  31.37 
 
 		 185 aa  55.8  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.224949 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3789  FMN-binding domain-containing protein  30.07 
 
 		 175 aa  55.5  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000077872  decreased coverage  0.000000492054 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0639  FMN-binding  40.54 
 
 		 176 aa  55.1  0.0000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000261865  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1083  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  31.63 
 
 		 368 aa  54.3  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0590058 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2015  FMN-binding domain-containing protein  32.11 
 
 		 191 aa  53.5  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0694  FMN-binding domain protein  30.77 
 
 		 391 aa  52.8  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0711  FMN-binding domain-containing protein  34.02 
 
 		 173 aa  52.4  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000470992  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0652  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  35.14 
 
 		 580 aa  52.4  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.200112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3121  FMN-binding domain-containing protein  28.1 
 
 		 171 aa  51.2  0.000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.132086  unclonable  0.00000402249 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1316  FMN-binding  33.33 
 
 		 182 aa  51.2  0.000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000101636  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0496  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  31.43 
 
 		 177 aa  50.8  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00037002  hitchhiker  0.000327646 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1568  hypothetical protein  26.98 
 
 		 184 aa  50.8  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2246  hypothetical protein  25.55 
 
 		 187 aa  49.7  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.246047 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0907  FMN-binding domain protein  31.58 
 
 		 176 aa  50.1  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4601  hypothetical protein  31.25 
 
 		 170 aa  49.3  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2383  FMN-binding domain protein  26.98 
 
 		 184 aa  48.9  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.877175  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1185  hypothetical protein  23.7 
 
 		 166 aa  48.9  0.00004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0081  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  28.26 
 
 		 193 aa  48.5  0.00006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0628211  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0344  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  29.13 
 
 		 185 aa  47.8  0.00008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0261  NADH:ubiquinone oxidoreductase, RnfG subunit-like  32.04 
 
 		 201 aa  47.4  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1596  transcriptional regulator, putative  27.62 
 
 		 397 aa  47  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000252282  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2972  hypothetical protein  21.89 
 
 		 195 aa  46.2  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000219791  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2172  electron transport complex protein RnfG  35.23 
 
 		 208 aa  45.4  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.179108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1907  electron transport complex protein RnfG  35.23 
 
 		 208 aa  45.4  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2068  electron transport complex protein RnfG  35.23 
 
 		 208 aa  45.4  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00132342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2295  hypothetical protein  25.4 
 
 		 184 aa  45.8  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.340312  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0934  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  30.97 
 
 		 233 aa  45.1  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1638  FMN-binding domain protein  27.54 
 
 		 373 aa  45.1  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000487572  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2512  electron transport complex protein RnfG  34.09 
 
 		 212 aa  45.1  0.0006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0717  FMN-binding domain protein  30.53 
 
 		 393 aa  44.7  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1343  FMN-binding domain-containing protein  27.59 
 
 		 397 aa  44.7  0.0007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.000000579258  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1794  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  33.09 
 
 		 222 aa  44.7  0.0008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.956584  hitchhiker  0.000880554 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0308  FMN-binding domain-containing protein  28.57 
 
 		 199 aa  44.7  0.0008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0470915  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0986  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  35 
 
 		 181 aa  44.3  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.625397  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1846  electron transport complex protein RnfG  35.23 
 
 		 208 aa  44.3  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000030729  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1479  membrane bound regulatory protein, VcrC-like protein  31.46 
 
 		 397 aa  44.3  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00732489  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1903  hypothetical protein  24.32 
 
 		 164 aa  43.9  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2869  FMN-binding domain protein  25.23 
 
 		 382 aa  43.1  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00242086  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2630  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  29.6 
 
 		 233 aa  43.5  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0722  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  30.36 
 
 		 224 aa  43.1  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.271576  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2277  electron transport complex protein RnfG  32.95 
 
 		 212 aa  42.4  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.050891  normal  0.93229 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2560  electron transport complex protein RnfG  34.07 
 
 		 208 aa  42  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0486766 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2108  electron transport complex protein RnfG  32.95 
 
 		 208 aa  42.4  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.220327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2263  electron transport complex protein RnfG  32.95 
 
 		 208 aa  42.4  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00083065  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4549  electron transport complex protein RnfG  32.95 
 
 		 208 aa  42.4  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2436  hypothetical protein  27.41 
 
 		 181 aa  42  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000527429  normal  0.0196691 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1531  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  30.26 
 
 		 181 aa  41.6  0.006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00374795  normal  0.943593 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2176  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  30.39 
 
 		 215 aa  41.2  0.009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.193841  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>