72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_3458 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_3458  FMN-binding domain-containing protein  100 
 
 		 184 aa  380  1e-105  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000627682  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0905  FMN-binding domain-containing protein  99.46 
 
 		 184 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000303402  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0920  FMN-binding domain-containing protein  93.92 
 
 		 183 aa  357  6e-98  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0051552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0921  FMN-binding domain-containing protein  93.92 
 
 		 183 aa  357  6e-98  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00888668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0956  FMN-binding domain-containing protein  93.37 
 
 		 183 aa  356  9e-98  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0275776  normal  0.549187 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2656  putative signal peptide protein  71.02 
 
 		 183 aa  258  5.0000000000000005e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000219967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1799  FMN-binding domain protein  50.87 
 
 		 184 aa  184  9e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.0000508928  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0417  FMN-binding  47.65 
 
 		 179 aa  172  1.9999999999999998e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000846474  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0709  putative signal peptide protein  46.75 
 
 		 181 aa  165  4e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.549423  normal  0.030053 
 
 
-
 
NC_003296  RS01729  signal peptide protein  47.59 
 
 		 186 aa  159  3e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1179  FMN-binding  45.14 
 
 		 173 aa  157  7e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1564  FMN-binding domain-containing protein  45.71 
 
 		 180 aa  150  8.999999999999999e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1558  FMN-binding domain protein  42.86 
 
 		 186 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.335211 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0361  FMN-binding domain protein  43.31 
 
 		 168 aa  144  5e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.221019 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1887  FMN-binding domain protein  42.26 
 
 		 186 aa  143  1e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00905192  normal  0.670131 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1847  FMN-binding domain protein  44.94 
 
 		 173 aa  142  4e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000189195 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5380  FMN-binding domain protein  44.94 
 
 		 173 aa  142  4e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.17391 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0610  putative signal peptide protein  42.35 
 
 		 171 aa  141  5e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.739239 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3432  FMN-binding domain-containing protein  34.78 
 
 		 149 aa  104  9e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.953268  normal  0.193685 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2626  hypothetical protein  35.71 
 
 		 152 aa  101  6e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.240318  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1833  FMN-binding domain protein  35 
 
 		 192 aa  97.1  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.653717  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0588  FMN-binding  37.21 
 
 		 169 aa  56.2  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00870871  decreased coverage  0.000120733 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0978  FMN-binding domain protein  31.43 
 
 		 185 aa  55.5  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.224949 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4034  FMN-binding domain-containing protein  30.18 
 
 		 176 aa  55.5  0.0000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1083  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  32.65 
 
 		 368 aa  54.7  0.0000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0590058 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3789  FMN-binding domain-containing protein  40.28 
 
 		 175 aa  53.9  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000077872  decreased coverage  0.000000492054 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0496  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  33.33 
 
 		 177 aa  53.9  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00037002  hitchhiker  0.000327646 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0639  FMN-binding  40.51 
 
 		 176 aa  54.3  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000261865  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1316  FMN-binding  34.52 
 
 		 182 aa  53.1  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000101636  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3890  FMN-binding domain-containing protein  40.28 
 
 		 189 aa  53.1  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00153293  normal  0.0179558 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0261  NADH:ubiquinone oxidoreductase, RnfG subunit-like  35.04 
 
 		 201 aa  52.8  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0652  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  36.49 
 
 		 580 aa  52.8  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.200112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0907  FMN-binding domain protein  32.33 
 
 		 176 aa  52.4  0.000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2015  FMN-binding domain-containing protein  37.84 
 
 		 191 aa  51.2  0.000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0694  FMN-binding domain protein  29.91 
 
 		 391 aa  51.2  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4601  hypothetical protein  32.14 
 
 		 170 aa  50.4  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0711  FMN-binding domain-containing protein  37.97 
 
 		 173 aa  50.8  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000470992  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1568  hypothetical protein  25.83 
 
 		 184 aa  49.7  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0717  FMN-binding domain protein  31.58 
 
 		 393 aa  48.5  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2246  hypothetical protein  24.43 
 
 		 187 aa  48.5  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.246047 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0344  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  28.85 
 
 		 185 aa  47.8  0.00008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2383  FMN-binding domain protein  25.83 
 
 		 184 aa  47.8  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.877175  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0934  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  31.86 
 
 		 233 aa  47.4  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1846  electron transport complex protein RnfG  37.5 
 
 		 208 aa  47.4  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000030729  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1185  hypothetical protein  23.7 
 
 		 166 aa  47.8  0.0001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3121  FMN-binding domain-containing protein  34.72 
 
 		 171 aa  46.6  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.132086  unclonable  0.00000402249 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1638  FMN-binding domain protein  27.54 
 
 		 373 aa  46.6  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000487572  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1596  transcriptional regulator, putative  27.59 
 
 		 397 aa  46.2  0.0003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000252282  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0986  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  35 
 
 		 181 aa  45.1  0.0007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.625397  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1794  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  32.35 
 
 		 222 aa  44.7  0.0007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.956584  hitchhiker  0.000880554 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2869  FMN-binding domain protein  24.3 
 
 		 382 aa  44.7  0.0008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00242086  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1343  FMN-binding domain-containing protein  28.45 
 
 		 397 aa  44.3  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.000000579258  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2295  hypothetical protein  24.17 
 
 		 184 aa  44.3  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.340312  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2630  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  30.4 
 
 		 233 aa  44.3  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2172  electron transport complex protein RnfG  35.23 
 
 		 208 aa  43.9  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.179108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0081  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  26.6 
 
 		 193 aa  43.5  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0628211  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1903  hypothetical protein  24.18 
 
 		 164 aa  43.1  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1479  membrane bound regulatory protein, VcrC-like protein  32.58 
 
 		 397 aa  43.1  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00732489  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2512  electron transport complex protein RnfG  34.09 
 
 		 212 aa  43.1  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2068  electron transport complex protein RnfG  35.23 
 
 		 208 aa  43.5  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00132342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1907  electron transport complex protein RnfG  35.23 
 
 		 208 aa  43.5  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0722  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  34.15 
 
 		 224 aa  43.1  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.271576  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4549  electron transport complex protein RnfG  34.09 
 
 		 208 aa  43.1  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2263  electron transport complex protein RnfG  34.09 
 
 		 208 aa  43.1  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00083065  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2108  electron transport complex protein RnfG  34.09 
 
 		 208 aa  43.1  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.220327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2277  electron transport complex protein RnfG  34.09 
 
 		 212 aa  42.7  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.050891  normal  0.93229 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2436  hypothetical protein  26.87 
 
 		 181 aa  42.7  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000527429  normal  0.0196691 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0308  FMN-binding domain-containing protein  28.57 
 
 		 199 aa  42.7  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0470915  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1531  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  31.25 
 
 		 181 aa  42.4  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00374795  normal  0.943593 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2972  hypothetical protein  20.12 
 
 		 195 aa  42.4  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000219791  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0738  FMN-binding domain protein  22.88 
 
 		 392 aa  42  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000701173  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2560  electron transport complex protein RnfG  32.97 
 
 		 208 aa  41.6  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0486766 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>