29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_3789 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_3789  FMN-binding domain-containing protein  100 
 
 		 175 aa  356  9e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000077872  decreased coverage  0.000000492054 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3890  FMN-binding domain-containing protein  72.09 
 
 		 189 aa  264  4e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00153293  normal  0.0179558 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0711  FMN-binding domain-containing protein  69.23 
 
 		 173 aa  256  1e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000470992  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3121  FMN-binding domain-containing protein  70.41 
 
 		 171 aa  252  2.0000000000000002e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.132086  unclonable  0.00000402249 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0639  FMN-binding  72.97 
 
 		 176 aa  234  6e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000261865  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2015  FMN-binding domain-containing protein  71.05 
 
 		 191 aa  233  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4034  FMN-binding domain-containing protein  61.99 
 
 		 176 aa  224  7e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0588  FMN-binding  64 
 
 		 169 aa  206  1e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00870871  decreased coverage  0.000120733 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4601  hypothetical protein  52.07 
 
 		 170 aa  194  5.000000000000001e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2436  hypothetical protein  41.36 
 
 		 181 aa  136  1e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000527429  normal  0.0196691 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1316  FMN-binding  44.96 
 
 		 182 aa  118  3.9999999999999996e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000101636  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1833  FMN-binding domain protein  24.28 
 
 		 192 aa  55.8  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.653717  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0920  FMN-binding domain-containing protein  30.07 
 
 		 183 aa  55.5  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0051552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0921  FMN-binding domain-containing protein  30.07 
 
 		 183 aa  55.5  0.0000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00888668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0956  FMN-binding domain-containing protein  29.41 
 
 		 183 aa  54.7  0.0000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0275776  normal  0.549187 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3458  FMN-binding domain-containing protein  40.28 
 
 		 184 aa  53.9  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000627682  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0905  FMN-binding domain-containing protein  39.24 
 
 		 184 aa  53.9  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000303402  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2656  putative signal peptide protein  41.67 
 
 		 183 aa  52  0.000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000219967  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0610  putative signal peptide protein  30.87 
 
 		 171 aa  51.6  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.739239 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0709  putative signal peptide protein  34.4 
 
 		 181 aa  51.6  0.000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.549423  normal  0.030053 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0361  FMN-binding domain protein  32.82 
 
 		 168 aa  47.8  0.00008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.221019 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0417  FMN-binding  29.88 
 
 		 179 aa  47.8  0.00009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000846474  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1564  FMN-binding domain-containing protein  33 
 
 		 180 aa  47  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01729  signal peptide protein  26.44 
 
 		 186 aa  46.2  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2869  FMN-binding domain protein  30.15 
 
 		 382 aa  45.1  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00242086  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3432  FMN-binding domain-containing protein  30.77 
 
 		 149 aa  44.7  0.0006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.953268  normal  0.193685 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1887  FMN-binding domain protein  39.06 
 
 		 186 aa  43.1  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00905192  normal  0.670131 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1558  FMN-binding domain protein  39.06 
 
 		 186 aa  43.5  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.335211 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2626  hypothetical protein  31.11 
 
 		 152 aa  41.2  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.240318  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>