27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3121 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_3121  FMN-binding domain-containing protein  100 
 
 		 171 aa  354  3.9999999999999996e-97  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.132086  unclonable  0.00000402249 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3789  FMN-binding domain-containing protein  70.41 
 
 		 175 aa  252  2.0000000000000002e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000077872  decreased coverage  0.000000492054 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3890  FMN-binding domain-containing protein  70.24 
 
 		 189 aa  243  6.999999999999999e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00153293  normal  0.0179558 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0711  FMN-binding domain-containing protein  66.07 
 
 		 173 aa  233  1.0000000000000001e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000470992  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4034  FMN-binding domain-containing protein  68.32 
 
 		 176 aa  224  4e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0639  FMN-binding  68.55 
 
 		 176 aa  224  5.0000000000000005e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000261865  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2015  FMN-binding domain-containing protein  71.23 
 
 		 191 aa  219  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0588  FMN-binding  69.66 
 
 		 169 aa  210  7e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00870871  decreased coverage  0.000120733 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4601  hypothetical protein  52.76 
 
 		 170 aa  190  7e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2436  hypothetical protein  40.83 
 
 		 181 aa  140  8e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000527429  normal  0.0196691 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1316  FMN-binding  42.48 
 
 		 182 aa  124  5e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000101636  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1833  FMN-binding domain protein  38.37 
 
 		 192 aa  58.5  0.00000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.653717  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0921  FMN-binding domain-containing protein  28.1 
 
 		 183 aa  51.2  0.000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00888668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0920  FMN-binding domain-containing protein  28.1 
 
 		 183 aa  51.2  0.000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0051552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0956  FMN-binding domain-containing protein  27.45 
 
 		 183 aa  50.8  0.000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0275776  normal  0.549187 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2656  putative signal peptide protein  38.89 
 
 		 183 aa  47.4  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000219967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0905  FMN-binding domain-containing protein  34.18 
 
 		 184 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000303402  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0709  putative signal peptide protein  30.53 
 
 		 181 aa  47.4  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.549423  normal  0.030053 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1564  FMN-binding domain-containing protein  27.88 
 
 		 180 aa  46.2  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3458  FMN-binding domain-containing protein  34.72 
 
 		 184 aa  46.6  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000627682  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3432  FMN-binding domain-containing protein  30.77 
 
 		 149 aa  45.8  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.953268  normal  0.193685 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0610  putative signal peptide protein  26.67 
 
 		 171 aa  44.7  0.0007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.739239 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3767  sulfite reductase alpha subunit (flavoprotein)-like protein  29.17 
 
 		 969 aa  41.6  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01729  signal peptide protein  39.68 
 
 		 186 aa  41.6  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0417  FMN-binding  33.73 
 
 		 179 aa  41.2  0.008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000846474  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1558  FMN-binding domain protein  39.68 
 
 		 186 aa  40.8  0.009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.335211 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1887  FMN-binding domain protein  39.68 
 
 		 186 aa  40.8  0.01  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00905192  normal  0.670131 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>