47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1564 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1564  FMN-binding domain-containing protein  100 
 
 		 180 aa  375  1e-103  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0361  FMN-binding domain protein  71.9 
 
 		 168 aa  246  1e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.221019 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0610  putative signal peptide protein  51.19 
 
 		 171 aa  179  2e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.739239 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5380  FMN-binding domain protein  45.71 
 
 		 173 aa  168  4e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.17391 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1847  FMN-binding domain protein  45.71 
 
 		 173 aa  168  4e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000189195 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1179  FMN-binding  46.29 
 
 		 173 aa  164  6.9999999999999995e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0905  FMN-binding domain-containing protein  45.71 
 
 		 184 aa  150  7e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000303402  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3458  FMN-binding domain-containing protein  45.71 
 
 		 184 aa  150  8.999999999999999e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000627682  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0921  FMN-binding domain-containing protein  44.57 
 
 		 183 aa  147  9e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00888668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0920  FMN-binding domain-containing protein  44.57 
 
 		 183 aa  147  9e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0051552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0956  FMN-binding domain-containing protein  44.57 
 
 		 183 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0275776  normal  0.549187 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0417  FMN-binding  42.26 
 
 		 179 aa  144  5e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000846474  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3432  FMN-binding domain-containing protein  45.73 
 
 		 149 aa  144  9e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.953268  normal  0.193685 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0709  putative signal peptide protein  45.45 
 
 		 181 aa  142  2e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.549423  normal  0.030053 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1799  FMN-binding domain protein  44.05 
 
 		 184 aa  142  2e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.0000508928  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01729  signal peptide protein  39.89 
 
 		 186 aa  142  3e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1887  FMN-binding domain protein  39.34 
 
 		 186 aa  140  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00905192  normal  0.670131 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1558  FMN-binding domain protein  40.54 
 
 		 186 aa  139  3e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.335211 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2656  putative signal peptide protein  43.31 
 
 		 183 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000219967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2626  hypothetical protein  38.65 
 
 		 152 aa  124  5e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.240318  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1833  FMN-binding domain protein  27.27 
 
 		 192 aa  76.6  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.653717  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1316  FMN-binding  35.29 
 
 		 182 aa  61.6  0.000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000101636  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0652  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  37.33 
 
 		 580 aa  57  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.200112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0588  FMN-binding  31.58 
 
 		 169 aa  53.9  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00870871  decreased coverage  0.000120733 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4034  FMN-binding domain-containing protein  37.11 
 
 		 176 aa  51.2  0.000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0717  FMN-binding domain protein  30.33 
 
 		 393 aa  50.4  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1083  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  35.44 
 
 		 368 aa  50.8  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0590058 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1185  hypothetical protein  26.58 
 
 		 166 aa  50.4  0.00001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0639  FMN-binding  35.45 
 
 		 176 aa  50.4  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000261865  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0711  FMN-binding domain-containing protein  32.28 
 
 		 173 aa  49.7  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000470992  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2246  hypothetical protein  24.26 
 
 		 187 aa  49.7  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.246047 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3890  FMN-binding domain-containing protein  34 
 
 		 189 aa  49.3  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00153293  normal  0.0179558 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0978  FMN-binding domain protein  32.88 
 
 		 185 aa  49.3  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.224949 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2015  FMN-binding domain-containing protein  33.66 
 
 		 191 aa  48.9  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0907  FMN-binding domain protein  35.62 
 
 		 176 aa  48.1  0.00007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0738  FMN-binding domain protein  31.78 
 
 		 392 aa  47.8  0.00009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000701173  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3789  FMN-binding domain-containing protein  33 
 
 		 175 aa  47  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000077872  decreased coverage  0.000000492054 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4601  hypothetical protein  29.2 
 
 		 170 aa  46.6  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0496  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  33.33 
 
 		 177 aa  45.8  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00037002  hitchhiker  0.000327646 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3121  FMN-binding domain-containing protein  27.88 
 
 		 171 aa  46.2  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.132086  unclonable  0.00000402249 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2383  FMN-binding domain protein  22.48 
 
 		 184 aa  45.4  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.877175  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2295  hypothetical protein  21.71 
 
 		 184 aa  44.7  0.0008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.340312  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0261  NADH:ubiquinone oxidoreductase, RnfG subunit-like  28.92 
 
 		 201 aa  43.9  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1568  hypothetical protein  26.87 
 
 		 184 aa  43.9  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2342  FMN-binding domain protein  33.85 
 
 		 453 aa  43.1  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.607847  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0836  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase, C subunit  33.33 
 
 		 189 aa  42.7  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.294872  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0344  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  29.35 
 
 		 185 aa  42.7  0.003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>