42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_0361 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010531  Pnec_0361  FMN-binding domain protein  100 
 
 		 168 aa  349  1e-95  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.221019 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1564  FMN-binding domain-containing protein  71.9 
 
 		 180 aa  246  8e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0610  putative signal peptide protein  54.36 
 
 		 171 aa  176  9e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.739239 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1847  FMN-binding domain protein  48.65 
 
 		 173 aa  168  3e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000189195 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5380  FMN-binding domain protein  48.65 
 
 		 173 aa  168  3e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.17391 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1179  FMN-binding  45.95 
 
 		 173 aa  150  5e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1799  FMN-binding domain protein  46.45 
 
 		 184 aa  147  8e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.0000508928  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3458  FMN-binding domain-containing protein  43.31 
 
 		 184 aa  144  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000627682  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0905  FMN-binding domain-containing protein  43.31 
 
 		 184 aa  144  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000303402  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0709  putative signal peptide protein  42.86 
 
 		 181 aa  140  8e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.549423  normal  0.030053 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0921  FMN-binding domain-containing protein  41.67 
 
 		 183 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00888668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0920  FMN-binding domain-containing protein  41.67 
 
 		 183 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0051552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0956  FMN-binding domain-containing protein  41.67 
 
 		 183 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0275776  normal  0.549187 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0417  FMN-binding  42.95 
 
 		 179 aa  134  7.000000000000001e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000846474  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1887  FMN-binding domain protein  45.16 
 
 		 186 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00905192  normal  0.670131 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2656  putative signal peptide protein  42.04 
 
 		 183 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000219967  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1558  FMN-binding domain protein  44.16 
 
 		 186 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.335211 
 
 
-
 
NC_003296  RS01729  signal peptide protein  43.23 
 
 		 186 aa  131  3.9999999999999996e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3432  FMN-binding domain-containing protein  43.75 
 
 		 149 aa  130  1.0000000000000001e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.953268  normal  0.193685 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2626  hypothetical protein  42.86 
 
 		 152 aa  123  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.240318  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1833  FMN-binding domain protein  29.8 
 
 		 192 aa  74.3  0.0000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.653717  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1316  FMN-binding  33.33 
 
 		 182 aa  61.2  0.000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000101636  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0652  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  36.9 
 
 		 580 aa  60.1  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.200112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0978  FMN-binding domain protein  39.08 
 
 		 185 aa  57.8  0.00000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.224949 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1083  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  37.5 
 
 		 368 aa  52.8  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0590058 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0588  FMN-binding  31.85 
 
 		 169 aa  50.8  0.000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00870871  decreased coverage  0.000120733 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0711  FMN-binding domain-containing protein  32.54 
 
 		 173 aa  49.7  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000470992  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0717  FMN-binding domain protein  30.16 
 
 		 393 aa  49.3  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2246  hypothetical protein  32.84 
 
 		 187 aa  48.9  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.246047 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0496  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  34.44 
 
 		 177 aa  49.3  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00037002  hitchhiker  0.000327646 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3789  FMN-binding domain-containing protein  32.82 
 
 		 175 aa  47.8  0.00007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000077872  decreased coverage  0.000000492054 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0738  FMN-binding domain protein  30.77 
 
 		 392 aa  47.8  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000701173  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0694  FMN-binding domain protein  31.73 
 
 		 391 aa  46.2  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2383  FMN-binding domain protein  25.42 
 
 		 184 aa  46.6  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.877175  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0907  FMN-binding domain protein  38.75 
 
 		 176 aa  45.4  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4601  hypothetical protein  33.33 
 
 		 170 aa  45.8  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2295  hypothetical protein  24.58 
 
 		 184 aa  45.4  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.340312  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0836  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase, C subunit  34.21 
 
 		 189 aa  44.7  0.0005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.294872  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1568  hypothetical protein  25.42 
 
 		 184 aa  44.7  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1596  transcriptional regulator, putative  32.5 
 
 		 397 aa  42  0.004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000252282  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1343  FMN-binding domain-containing protein  29.03 
 
 		 397 aa  41.2  0.006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.000000579258  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1185  hypothetical protein  24.36 
 
 		 166 aa  41.2  0.007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>