26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0907 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0907  FMN-binding domain protein  100 
 
 
176 aa  355  1.9999999999999998e-97  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1568  hypothetical protein  31.17 
 
 
184 aa  99.4  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2972  hypothetical protein  36.62 
 
 
195 aa  98.6  4e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000219791  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2295  hypothetical protein  30.26 
 
 
184 aa  98.2  5e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.340312  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2383  FMN-binding domain protein  30.52 
 
 
184 aa  97.4  9e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.877175  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2246  hypothetical protein  29.3 
 
 
187 aa  94  9e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.246047 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1185  hypothetical protein  31.17 
 
 
166 aa  85.5  4e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1903  hypothetical protein  33.09 
 
 
164 aa  84.3  8e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3458  FMN-binding domain-containing protein  32.33 
 
 
184 aa  52.4  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000627682  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0905  FMN-binding domain-containing protein  32.33 
 
 
184 aa  52  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000303402  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0921  FMN-binding domain-containing protein  31.58 
 
 
183 aa  50.1  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00888668  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0956  FMN-binding domain-containing protein  31.58 
 
 
183 aa  50.1  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0275776  normal  0.549187 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0920  FMN-binding domain-containing protein  31.58 
 
 
183 aa  50.1  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0051552  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2656  putative signal peptide protein  32.26 
 
 
183 aa  49.3  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000219967  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1564  FMN-binding domain-containing protein  35.62 
 
 
180 aa  48.1  0.00007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0610  putative signal peptide protein  27.27 
 
 
171 aa  47.8  0.00008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.739239 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2626  hypothetical protein  38.82 
 
 
152 aa  46.2  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.240318  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01729  signal peptide protein  27.56 
 
 
186 aa  46.2  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0361  FMN-binding domain protein  38.75 
 
 
168 aa  45.4  0.0004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.221019 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1887  FMN-binding domain protein  26.28 
 
 
186 aa  44.3  0.0008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00905192  normal  0.670131 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1316  FMN-binding  40 
 
 
182 aa  43.9  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000101636  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1558  FMN-binding domain protein  26.28 
 
 
186 aa  43.5  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.335211 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1799  FMN-binding domain protein  26.89 
 
 
184 aa  42.4  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.0000508928  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1847  FMN-binding domain protein  24.69 
 
 
173 aa  41.6  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000189195 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0417  FMN-binding  29.13 
 
 
179 aa  41.6  0.005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000846474  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5380  FMN-binding domain protein  24.69 
 
 
173 aa  41.6  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.17391 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>