23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1185 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_1185  hypothetical protein  100 
 
 
166 aa  331  3e-90  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0907  FMN-binding domain protein  31.17 
 
 
176 aa  85.5  3e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2972  hypothetical protein  28.86 
 
 
195 aa  80.9  0.000000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000219791  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2383  FMN-binding domain protein  26.87 
 
 
184 aa  78.2  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.877175  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2295  hypothetical protein  27.13 
 
 
184 aa  76.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.340312  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1568  hypothetical protein  27.13 
 
 
184 aa  76.6  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1903  hypothetical protein  25 
 
 
164 aa  74.3  0.0000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2246  hypothetical protein  24.44 
 
 
187 aa  70.1  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.246047 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0709  putative signal peptide protein  24.84 
 
 
181 aa  54.3  0.0000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.549423  normal  0.030053 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0417  FMN-binding  27.4 
 
 
179 aa  50.1  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000846474  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1564  FMN-binding domain-containing protein  26.58 
 
 
180 aa  50.4  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0610  putative signal peptide protein  24.42 
 
 
171 aa  50.1  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.739239 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0920  FMN-binding domain-containing protein  23.7 
 
 
183 aa  48.9  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0051552  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0956  FMN-binding domain-containing protein  23.7 
 
 
183 aa  48.9  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0275776  normal  0.549187 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0921  FMN-binding domain-containing protein  23.7 
 
 
183 aa  48.9  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00888668  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0905  FMN-binding domain-containing protein  24.28 
 
 
184 aa  47.8  0.00007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000303402  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3458  FMN-binding domain-containing protein  23.7 
 
 
184 aa  47.8  0.00008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000627682  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2656  putative signal peptide protein  21.82 
 
 
183 aa  44.7  0.0006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000219967  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1179  FMN-binding  29.47 
 
 
173 aa  42.4  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01729  signal peptide protein  23.74 
 
 
186 aa  42  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3432  FMN-binding domain-containing protein  31.37 
 
 
149 aa  41.2  0.006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.953268  normal  0.193685 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0361  FMN-binding domain protein  24.36 
 
 
168 aa  41.2  0.007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.221019 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1799  FMN-binding domain protein  23.98 
 
 
184 aa  40.8  0.008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.0000508928  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>