40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1179 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A1179  FMN-binding  100 
 
 		 173 aa  357  5e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1847  FMN-binding domain protein  69.19 
 
 		 173 aa  242  1.9999999999999999e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000189195 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5380  FMN-binding domain protein  69.19 
 
 		 173 aa  242  1.9999999999999999e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.17391 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0610  putative signal peptide protein  50 
 
 		 171 aa  166  2e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.739239 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1564  FMN-binding domain-containing protein  46.29 
 
 		 180 aa  164  5.9999999999999996e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3458  FMN-binding domain-containing protein  45.14 
 
 		 184 aa  157  6e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000627682  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0905  FMN-binding domain-containing protein  45.14 
 
 		 184 aa  157  6e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000303402  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0921  FMN-binding domain-containing protein  44.38 
 
 		 183 aa  153  1e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00888668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0956  FMN-binding domain-containing protein  44.38 
 
 		 183 aa  153  1e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0275776  normal  0.549187 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0920  FMN-binding domain-containing protein  44.38 
 
 		 183 aa  153  1e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0051552  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0361  FMN-binding domain protein  45.95 
 
 		 168 aa  150  5.9999999999999996e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.221019 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0417  FMN-binding  44.77 
 
 		 179 aa  149  2e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000846474  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1799  FMN-binding domain protein  45.45 
 
 		 184 aa  145  2.0000000000000003e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.0000508928  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0709  putative signal peptide protein  49.68 
 
 		 181 aa  142  3e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.549423  normal  0.030053 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1558  FMN-binding domain protein  44.05 
 
 		 186 aa  141  4e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.335211 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1887  FMN-binding domain protein  44.05 
 
 		 186 aa  141  5e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00905192  normal  0.670131 
 
 
-
 
NC_003296  RS01729  signal peptide protein  45.78 
 
 		 186 aa  139  3e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2626  hypothetical protein  45.51 
 
 		 152 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.240318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3432  FMN-binding domain-containing protein  43.67 
 
 		 149 aa  134  8e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.953268  normal  0.193685 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2656  putative signal peptide protein  42.69 
 
 		 183 aa  130  7.999999999999999e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000219967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1833  FMN-binding domain protein  32.5 
 
 		 192 aa  73.9  0.0000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.653717  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1083  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  42.11 
 
 		 368 aa  67  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0590058 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0652  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  43.42 
 
 		 580 aa  63.2  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.200112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0978  FMN-binding domain protein  38.46 
 
 		 185 aa  60.8  0.000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.224949 
 
 
-
 
NC_002936  DET1596  transcriptional regulator, putative  35.56 
 
 		 397 aa  48.5  0.00004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000252282  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0496  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  35.71 
 
 		 177 aa  48.9  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00037002  hitchhiker  0.000327646 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0738  FMN-binding domain protein  39.13 
 
 		 392 aa  45.8  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000701173  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0717  FMN-binding domain protein  36 
 
 		 393 aa  46.2  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0344  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  28.71 
 
 		 185 aa  44.7  0.0006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1638  FMN-binding domain protein  25.96 
 
 		 373 aa  44.7  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000487572  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1479  membrane bound regulatory protein, VcrC-like protein  31.87 
 
 		 397 aa  44.3  0.0008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00732489  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1093  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  29.9 
 
 		 178 aa  43.9  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.997884  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1343  FMN-binding domain-containing protein  31.87 
 
 		 397 aa  43.9  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.000000579258  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1316  FMN-binding  40 
 
 		 182 aa  42.7  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000101636  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2342  FMN-binding domain protein  31.58 
 
 		 453 aa  42.7  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.607847  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1318  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  23.12 
 
 		 344 aa  42.4  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0617616  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1185  hypothetical protein  29.47 
 
 		 166 aa  42.4  0.003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2246  hypothetical protein  29.27 
 
 		 187 aa  42  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.246047 
 
 
-
 
NC_002936  DET0310  transcriptional regulator, putative  35.53 
 
 		 572 aa  41.6  0.006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4034  FMN-binding domain-containing protein  27.22 
 
 		 176 aa  40.8  0.008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>