54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_2656 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_2656  putative signal peptide protein  100 
 
 		 183 aa  377  1e-104  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000219967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0956  FMN-binding domain-containing protein  72.41 
 
 		 183 aa  273  8e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0275776  normal  0.549187 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0920  FMN-binding domain-containing protein  72.41 
 
 		 183 aa  273  9e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0051552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0921  FMN-binding domain-containing protein  72.41 
 
 		 183 aa  273  9e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00888668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3458  FMN-binding domain-containing protein  71.02 
 
 		 184 aa  271  3e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000627682  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0905  FMN-binding domain-containing protein  71.02 
 
 		 184 aa  271  3e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000303402  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1799  FMN-binding domain protein  50.89 
 
 		 184 aa  180  1e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.0000508928  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0709  putative signal peptide protein  49.02 
 
 		 181 aa  171  6.999999999999999e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.549423  normal  0.030053 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0417  FMN-binding  47.06 
 
 		 179 aa  157  7e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000846474  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5380  FMN-binding domain protein  43.67 
 
 		 173 aa  144  9e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.17391 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1847  FMN-binding domain protein  43.67 
 
 		 173 aa  144  9e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000189195 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1179  FMN-binding  42.69 
 
 		 173 aa  143  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0610  putative signal peptide protein  44.12 
 
 		 171 aa  142  2e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.739239 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1558  FMN-binding domain protein  38.89 
 
 		 186 aa  140  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.335211 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1564  FMN-binding domain-containing protein  42.46 
 
 		 180 aa  138  3.9999999999999997e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01729  signal peptide protein  39.08 
 
 		 186 aa  137  8.999999999999999e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1887  FMN-binding domain protein  38.33 
 
 		 186 aa  136  1e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00905192  normal  0.670131 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0361  FMN-binding domain protein  42.04 
 
 		 168 aa  132  3e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.221019 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3432  FMN-binding domain-containing protein  37.27 
 
 		 149 aa  114  8.999999999999998e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.953268  normal  0.193685 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2626  hypothetical protein  38.69 
 
 		 152 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.240318  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1833  FMN-binding domain protein  37.63 
 
 		 192 aa  84  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.653717  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3890  FMN-binding domain-containing protein  43.06 
 
 		 189 aa  57.8  0.00000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00153293  normal  0.0179558 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0639  FMN-binding  31.97 
 
 		 176 aa  57  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000261865  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0588  FMN-binding  36.79 
 
 		 169 aa  55.8  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00870871  decreased coverage  0.000120733 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0978  FMN-binding domain protein  32.35 
 
 		 185 aa  56.2  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.224949 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1083  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  33.67 
 
 		 368 aa  55.8  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0590058 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4034  FMN-binding domain-containing protein  40 
 
 		 176 aa  55.5  0.0000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0711  FMN-binding domain-containing protein  33.93 
 
 		 173 aa  54.3  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000470992  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0652  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  37.84 
 
 		 580 aa  53.5  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.200112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2015  FMN-binding domain-containing protein  33.06 
 
 		 191 aa  53.5  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3789  FMN-binding domain-containing protein  41.67 
 
 		 175 aa  52.4  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000077872  decreased coverage  0.000000492054 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0496  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  33.33 
 
 		 177 aa  52  0.000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00037002  hitchhiker  0.000327646 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1316  FMN-binding  36.49 
 
 		 182 aa  50.1  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000101636  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0907  FMN-binding domain protein  32.26 
 
 		 176 aa  49.3  0.00003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1185  hypothetical protein  24.14 
 
 		 166 aa  49.7  0.00003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2246  hypothetical protein  25.53 
 
 		 187 aa  48.5  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.246047 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4601  hypothetical protein  31.53 
 
 		 170 aa  48.1  0.00006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3121  FMN-binding domain-containing protein  38.89 
 
 		 171 aa  47.4  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.132086  unclonable  0.00000402249 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0694  FMN-binding domain protein  28.85 
 
 		 391 aa  46.2  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0344  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  29.81 
 
 		 185 aa  46.6  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3196  RnfA-Nqr electron transport subunit  34.04 
 
 		 220 aa  46.2  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.401599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2436  hypothetical protein  32.08 
 
 		 181 aa  45.8  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000527429  normal  0.0196691 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3935  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  35.71 
 
 		 219 aa  45.4  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00699897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3196  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  35.71 
 
 		 219 aa  45.4  0.0005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.314001  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2195  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  29.11 
 
 		 259 aa  44.7  0.0007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.648995  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0081  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  32.61 
 
 		 193 aa  43.9  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0628211  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2070  electron transport complex protein RnfG  34.04 
 
 		 212 aa  43.9  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1568  hypothetical protein  25 
 
 		 184 aa  44.3  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2897  electron transport complex, G subunit  32.52 
 
 		 212 aa  43.1  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.432539  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1596  transcriptional regulator, putative  32.58 
 
 		 397 aa  43.5  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000252282  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0722  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  32.5 
 
 		 224 aa  41.6  0.007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.271576  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2404  electron transport complex protein RnfG  31.25 
 
 		 215 aa  41.6  0.007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.59015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1489  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  28.97 
 
 		 229 aa  41.2  0.009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.753633 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0261  NADH:ubiquinone oxidoreductase, RnfG subunit-like  29.91 
 
 		 201 aa  40.8  0.01  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>