27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_2015 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009052  Sbal_2015  FMN-binding domain-containing protein  100 
 
 
191 aa  393  1e-109  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4034  FMN-binding domain-containing protein  76.36 
 
 
176 aa  256  1e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3890  FMN-binding domain-containing protein  77.03 
 
 
189 aa  241  6e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00153293  normal  0.0179558 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0711  FMN-binding domain-containing protein  68.45 
 
 
173 aa  236  1e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000470992  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0639  FMN-binding  73.2 
 
 
176 aa  235  3e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000261865  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3789  FMN-binding domain-containing protein  68.71 
 
 
175 aa  234  4e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000077872  decreased coverage  0.000000492054 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3121  FMN-binding domain-containing protein  67.48 
 
 
171 aa  222  3e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.132086  unclonable  0.00000402249 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0588  FMN-binding  62.58 
 
 
169 aa  199  1.9999999999999998e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00870871  decreased coverage  0.000120733 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4601  hypothetical protein  49.08 
 
 
170 aa  176  2e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2436  hypothetical protein  43.33 
 
 
181 aa  137  8.999999999999999e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000527429  normal  0.0196691 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1316  FMN-binding  44.06 
 
 
182 aa  124  7e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000101636  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1833  FMN-binding domain protein  33.33 
 
 
192 aa  56.6  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.653717  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0610  putative signal peptide protein  33.33 
 
 
171 aa  56.6  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.739239 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0920  FMN-binding domain-containing protein  34.02 
 
 
183 aa  53.9  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0051552  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0956  FMN-binding domain-containing protein  34.02 
 
 
183 aa  53.9  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0275776  normal  0.549187 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0921  FMN-binding domain-containing protein  34.02 
 
 
183 aa  53.9  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00888668  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2656  putative signal peptide protein  33.06 
 
 
183 aa  53.5  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000219967  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0709  putative signal peptide protein  29.3 
 
 
181 aa  53.5  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.549423  normal  0.030053 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0905  FMN-binding domain-containing protein  37.97 
 
 
184 aa  52  0.000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000303402  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3458  FMN-binding domain-containing protein  31.96 
 
 
184 aa  51.6  0.000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000627682  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1564  FMN-binding domain-containing protein  31.13 
 
 
180 aa  50.8  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0417  FMN-binding  27.57 
 
 
179 aa  49.3  0.00003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000846474  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1847  FMN-binding domain protein  27.86 
 
 
173 aa  46.2  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000189195 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5380  FMN-binding domain protein  27.86 
 
 
173 aa  46.2  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.17391 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3432  FMN-binding domain-containing protein  30.77 
 
 
149 aa  45.1  0.0006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.953268  normal  0.193685 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2626  hypothetical protein  31.31 
 
 
152 aa  43.9  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.240318  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01729  signal peptide protein  38.36 
 
 
186 aa  43.1  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>