52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_1847 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_1847  FMN-binding domain protein  100 
 
 		 173 aa  356  9.999999999999999e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000189195 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5380  FMN-binding domain protein  100 
 
 		 173 aa  356  9.999999999999999e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.17391 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1179  FMN-binding  69.19 
 
 		 173 aa  262  2e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0610  putative signal peptide protein  55.21 
 
 		 171 aa  178  2.9999999999999997e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.739239 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1564  FMN-binding domain-containing protein  45.71 
 
 		 180 aa  174  8e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0361  FMN-binding domain protein  48.65 
 
 		 168 aa  168  4e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.221019 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1799  FMN-binding domain protein  47.16 
 
 		 184 aa  160  6e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.0000508928  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0709  putative signal peptide protein  50.65 
 
 		 181 aa  152  2e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.549423  normal  0.030053 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3458  FMN-binding domain-containing protein  42.86 
 
 		 184 aa  152  2e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000627682  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0905  FMN-binding domain-containing protein  42.86 
 
 		 184 aa  152  2e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000303402  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3432  FMN-binding domain-containing protein  45.91 
 
 		 149 aa  150  7e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.953268  normal  0.193685 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0920  FMN-binding domain-containing protein  42.6 
 
 		 183 aa  149  2e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0051552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0921  FMN-binding domain-containing protein  42.6 
 
 		 183 aa  149  2e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00888668  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1558  FMN-binding domain protein  44.91 
 
 		 186 aa  149  2e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.335211 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0956  FMN-binding domain-containing protein  42.01 
 
 		 183 aa  149  3e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0275776  normal  0.549187 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1887  FMN-binding domain protein  44.31 
 
 		 186 aa  146  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00905192  normal  0.670131 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2656  putative signal peptide protein  42.6 
 
 		 183 aa  144  6e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000219967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0417  FMN-binding  38.37 
 
 		 179 aa  135  4e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000846474  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2626  hypothetical protein  43.37 
 
 		 152 aa  134  5e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.240318  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01729  signal peptide protein  43.9 
 
 		 186 aa  133  9.999999999999999e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1833  FMN-binding domain protein  30.92 
 
 		 192 aa  78.2  0.00000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.653717  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1083  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  40 
 
 		 368 aa  65.5  0.0000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0590058 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0652  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  40.54 
 
 		 580 aa  63.2  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.200112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0978  FMN-binding domain protein  27.27 
 
 		 185 aa  58.9  0.00000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.224949 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0738  FMN-binding domain protein  31.36 
 
 		 392 aa  55.1  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000701173  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0496  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  37.66 
 
 		 177 aa  54.7  0.0000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00037002  hitchhiker  0.000327646 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0717  FMN-binding domain protein  31.4 
 
 		 393 aa  53.9  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1316  FMN-binding  36.14 
 
 		 182 aa  51.6  0.000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000101636  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1596  transcriptional regulator, putative  35.44 
 
 		 397 aa  50.1  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000252282  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1093  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  31.96 
 
 		 178 aa  49.3  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.997884  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4034  FMN-binding domain-containing protein  29.45 
 
 		 176 aa  48.9  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1479  membrane bound regulatory protein, VcrC-like protein  33.75 
 
 		 397 aa  48.9  0.00004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00732489  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2246  hypothetical protein  32.53 
 
 		 187 aa  48.1  0.00006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.246047 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1343  FMN-binding domain-containing protein  33.75 
 
 		 397 aa  48.1  0.00006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.000000579258  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2015  FMN-binding domain-containing protein  28.48 
 
 		 191 aa  48.1  0.00006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0639  FMN-binding  28.57 
 
 		 176 aa  48.1  0.00006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000261865  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4601  hypothetical protein  35.23 
 
 		 170 aa  47.4  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3890  FMN-binding domain-containing protein  36.49 
 
 		 189 aa  45.8  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00153293  normal  0.0179558 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1846  electron transport complex protein RnfG  33.33 
 
 		 208 aa  43.1  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000030729  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0588  FMN-binding  30.68 
 
 		 169 aa  42.7  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00870871  decreased coverage  0.000120733 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0711  FMN-binding domain-containing protein  27.01 
 
 		 173 aa  42.7  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000470992  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1185  hypothetical protein  22.81 
 
 		 166 aa  43.5  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2195  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  29.79 
 
 		 259 aa  42.4  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.648995  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0344  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  28.28 
 
 		 185 aa  42.7  0.003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1568  hypothetical protein  29.27 
 
 		 184 aa  42.7  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2342  FMN-binding domain protein  37.14 
 
 		 453 aa  42.7  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.607847  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1318  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  26.45 
 
 		 344 aa  42  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0617616  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2512  electron transport complex protein RnfG  32.22 
 
 		 212 aa  41.6  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0907  FMN-binding domain protein  24.69 
 
 		 176 aa  41.6  0.006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2068  electron transport complex protein RnfG  32.22 
 
 		 208 aa  41.2  0.007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00132342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1907  electron transport complex protein RnfG  32.22 
 
 		 208 aa  41.2  0.007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2172  electron transport complex protein RnfG  32.22 
 
 		 208 aa  41.2  0.007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.179108  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>