45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1833 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1833  FMN-binding domain protein  100 
 
 		 192 aa  397  9.999999999999999e-111  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.653717  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0905  FMN-binding domain-containing protein  35 
 
 		 184 aa  97.1  1e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000303402  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3458  FMN-binding domain-containing protein  35 
 
 		 184 aa  97.1  1e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000627682  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0920  FMN-binding domain-containing protein  35 
 
 		 183 aa  97.4  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0051552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0956  FMN-binding domain-containing protein  35 
 
 		 183 aa  97.4  1e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0275776  normal  0.549187 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0921  FMN-binding domain-containing protein  35 
 
 		 183 aa  97.4  1e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00888668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2656  putative signal peptide protein  37.63 
 
 		 183 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000219967  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01729  signal peptide protein  32.4 
 
 		 186 aa  82.4  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0610  putative signal peptide protein  42.05 
 
 		 171 aa  80.5  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.739239 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0709  putative signal peptide protein  32 
 
 		 181 aa  80.5  0.00000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.549423  normal  0.030053 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2626  hypothetical protein  38.68 
 
 		 152 aa  80.1  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.240318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1847  FMN-binding domain protein  31.76 
 
 		 173 aa  78.6  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000189195 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5380  FMN-binding domain protein  31.76 
 
 		 173 aa  78.6  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.17391 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1564  FMN-binding domain-containing protein  27.27 
 
 		 180 aa  76.6  0.0000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0417  FMN-binding  32.65 
 
 		 179 aa  75.5  0.0000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000846474  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0361  FMN-binding domain protein  29.8 
 
 		 168 aa  74.3  0.000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.221019 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1179  FMN-binding  32.5 
 
 		 173 aa  73.9  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1887  FMN-binding domain protein  29.44 
 
 		 186 aa  71.2  0.000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00905192  normal  0.670131 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3432  FMN-binding domain-containing protein  34.09 
 
 		 149 aa  69.7  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.953268  normal  0.193685 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1558  FMN-binding domain protein  29.44 
 
 		 186 aa  70.1  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.335211 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1799  FMN-binding domain protein  28.65 
 
 		 184 aa  68.2  0.00000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.0000508928  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3890  FMN-binding domain-containing protein  26.54 
 
 		 189 aa  58.9  0.00000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00153293  normal  0.0179558 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3121  FMN-binding domain-containing protein  38.37 
 
 		 171 aa  58.5  0.00000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.132086  unclonable  0.00000402249 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0588  FMN-binding  35.42 
 
 		 169 aa  58.5  0.00000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00870871  decreased coverage  0.000120733 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1316  FMN-binding  33.71 
 
 		 182 aa  57  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000101636  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2015  FMN-binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 191 aa  56.2  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3789  FMN-binding domain-containing protein  24.28 
 
 		 175 aa  55.8  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000077872  decreased coverage  0.000000492054 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4034  FMN-binding domain-containing protein  37.18 
 
 		 176 aa  55.5  0.0000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0639  FMN-binding  34.41 
 
 		 176 aa  54.3  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000261865  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0711  FMN-binding domain-containing protein  34.88 
 
 		 173 aa  53.9  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000470992  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2436  hypothetical protein  35.58 
 
 		 181 aa  53.5  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000527429  normal  0.0196691 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1531  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  27.74 
 
 		 181 aa  51.2  0.000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00374795  normal  0.943593 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1083  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  27.93 
 
 		 368 aa  49.7  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0590058 
 
 
-
 
NC_002936  DET1598  transcriptional regulator, putative  28.24 
 
 		 396 aa  46.6  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00672193  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4601  hypothetical protein  29.07 
 
 		 170 aa  46.6  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1344  hypothetical protein  30 
 
 		 383 aa  46.2  0.0003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.024992  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1480  membrane bound regulatory protein, VcrC-like protein  29 
 
 		 399 aa  45.4  0.0005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1157  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  26.63 
 
 		 181 aa  45.4  0.0005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.40861 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1568  hypothetical protein  32.94 
 
 		 184 aa  45.4  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2972  hypothetical protein  25.15 
 
 		 195 aa  43.1  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000219791  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1093  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  26.11 
 
 		 178 aa  42.4  0.004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.997884  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2383  FMN-binding domain protein  30.59 
 
 		 184 aa  42  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.877175  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0652  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  23.74 
 
 		 580 aa  42  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.200112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1318  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  26.26 
 
 		 344 aa  42  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0617616  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4220  FMN-binding domain protein  23.31 
 
 		 480 aa  41.2  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000416896  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>