53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3432 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_3432  FMN-binding domain-containing protein  100 
 
 		 149 aa  308  2e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.953268  normal  0.193685 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0610  putative signal peptide protein  53.99 
 
 		 171 aa  179  1e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.739239 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1847  FMN-binding domain protein  46.98 
 
 		 173 aa  144  4.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000189195 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5380  FMN-binding domain protein  46.98 
 
 		 173 aa  144  4.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.17391 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1564  FMN-binding domain-containing protein  45.73 
 
 		 180 aa  144  6e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2626  hypothetical protein  48.09 
 
 		 152 aa  137  3.9999999999999997e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.240318  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1179  FMN-binding  43.67 
 
 		 173 aa  134  5e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0361  FMN-binding domain protein  43.75 
 
 		 168 aa  130  9e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.221019 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1887  FMN-binding domain protein  41.56 
 
 		 186 aa  120  8e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00905192  normal  0.670131 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1558  FMN-binding domain protein  41.56 
 
 		 186 aa  120  9e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.335211 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0709  putative signal peptide protein  37.71 
 
 		 181 aa  117  6e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.549423  normal  0.030053 
 
 
-
 
NC_003296  RS01729  signal peptide protein  37.14 
 
 		 186 aa  110  5e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2656  putative signal peptide protein  37.27 
 
 		 183 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000219967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1799  FMN-binding domain protein  39.47 
 
 		 184 aa  106  9.000000000000001e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.0000508928  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0417  FMN-binding  38.18 
 
 		 179 aa  104  5e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000846474  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3458  FMN-binding domain-containing protein  34.78 
 
 		 184 aa  104  5e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000627682  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0905  FMN-binding domain-containing protein  34.78 
 
 		 184 aa  104  5e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000303402  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0921  FMN-binding domain-containing protein  33.54 
 
 		 183 aa  103  8e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00888668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0920  FMN-binding domain-containing protein  33.54 
 
 		 183 aa  103  8e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0051552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0956  FMN-binding domain-containing protein  33.54 
 
 		 183 aa  102  1e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0275776  normal  0.549187 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1833  FMN-binding domain protein  34.09 
 
 		 192 aa  69.7  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.653717  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0652  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  37.18 
 
 		 580 aa  57.8  0.00000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.200112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1316  FMN-binding  31.11 
 
 		 182 aa  53.5  0.0000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000101636  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0694  FMN-binding domain protein  37.84 
 
 		 391 aa  53.1  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3890  FMN-binding domain-containing protein  35.16 
 
 		 189 aa  52  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00153293  normal  0.0179558 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0711  FMN-binding domain-containing protein  31.87 
 
 		 173 aa  52  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000470992  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0697  FMN-binding domain protein  34.41 
 
 		 201 aa  51.2  0.000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.820437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1083  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  28.21 
 
 		 368 aa  51.6  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0590058 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4601  hypothetical protein  31.13 
 
 		 170 aa  50.8  0.000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0978  FMN-binding domain protein  30.49 
 
 		 185 aa  50.4  0.000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.224949 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0496  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  30.77 
 
 		 177 aa  48.9  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00037002  hitchhiker  0.000327646 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2246  hypothetical protein  34.94 
 
 		 187 aa  48.9  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.246047 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0588  FMN-binding  31.87 
 
 		 169 aa  47.8  0.00005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00870871  decreased coverage  0.000120733 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0639  FMN-binding  30.77 
 
 		 176 aa  46.2  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000261865  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3121  FMN-binding domain-containing protein  30.77 
 
 		 171 aa  45.8  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.132086  unclonable  0.00000402249 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3789  FMN-binding domain-containing protein  30.77 
 
 		 175 aa  44.7  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000077872  decreased coverage  0.000000492054 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2015  FMN-binding domain-containing protein  30.77 
 
 		 191 aa  45.1  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4034  FMN-binding domain-containing protein  29.82 
 
 		 176 aa  45.1  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1343  FMN-binding domain-containing protein  30 
 
 		 397 aa  44.3  0.0006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.000000579258  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1479  membrane bound regulatory protein, VcrC-like protein  26.96 
 
 		 397 aa  44.3  0.0006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00732489  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1568  hypothetical protein  31.65 
 
 		 184 aa  43.9  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1596  transcriptional regulator, putative  30.86 
 
 		 397 aa  43.9  0.0008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000252282  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2295  hypothetical protein  31.25 
 
 		 184 aa  43.9  0.0008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.340312  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2383  FMN-binding domain protein  29.29 
 
 		 184 aa  43.5  0.0009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.877175  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0738  FMN-binding domain protein  30.12 
 
 		 392 aa  43.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000701173  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0344  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  29.63 
 
 		 185 aa  43.5  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2436  hypothetical protein  30.34 
 
 		 181 aa  42.4  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000527429  normal  0.0196691 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0261  NADH:ubiquinone oxidoreductase, RnfG subunit-like  28.92 
 
 		 201 aa  42.7  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0836  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase, C subunit  27.78 
 
 		 189 aa  42.7  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.294872  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1185  hypothetical protein  31.37 
 
 		 166 aa  41.2  0.005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2019  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  28.46 
 
 		 216 aa  40.4  0.007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0812  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  26.6 
 
 		 220 aa  40.4  0.009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.151893  normal  0.42525 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2342  FMN-binding domain protein  29.73 
 
 		 453 aa  40.4  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.607847  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>