29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0639 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007954  Sden_0639  FMN-binding  100 
 
 
176 aa  358  3e-98  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000261865  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0711  FMN-binding domain-containing protein  69.01 
 
 
173 aa  238  2.9999999999999997e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000470992  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3789  FMN-binding domain-containing protein  65.5 
 
 
175 aa  236  1e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000077872  decreased coverage  0.000000492054 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2015  FMN-binding domain-containing protein  73.2 
 
 
191 aa  235  3e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3121  FMN-binding domain-containing protein  66.28 
 
 
171 aa  228  4e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.132086  unclonable  0.00000402249 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3890  FMN-binding domain-containing protein  65.52 
 
 
189 aa  226  2e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00153293  normal  0.0179558 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4034  FMN-binding domain-containing protein  64.46 
 
 
176 aa  223  1e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0588  FMN-binding  64.9 
 
 
169 aa  204  5e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00870871  decreased coverage  0.000120733 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4601  hypothetical protein  50 
 
 
170 aa  182  3e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2436  hypothetical protein  42.24 
 
 
181 aa  132  3e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000527429  normal  0.0196691 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1316  FMN-binding  41.96 
 
 
182 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000101636  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2656  putative signal peptide protein  31.97 
 
 
183 aa  57.4  0.00000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000219967  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0921  FMN-binding domain-containing protein  40.54 
 
 
183 aa  55.5  0.0000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00888668  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0956  FMN-binding domain-containing protein  40.54 
 
 
183 aa  55.5  0.0000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0275776  normal  0.549187 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0920  FMN-binding domain-containing protein  40.54 
 
 
183 aa  55.5  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0051552  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1833  FMN-binding domain protein  34.41 
 
 
192 aa  54.7  0.0000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.653717  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0709  putative signal peptide protein  33.86 
 
 
181 aa  54.7  0.0000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.549423  normal  0.030053 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3458  FMN-binding domain-containing protein  40.51 
 
 
184 aa  54.3  0.0000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000627682  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0905  FMN-binding domain-containing protein  40.54 
 
 
184 aa  53.1  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000303402  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0610  putative signal peptide protein  33.82 
 
 
171 aa  52  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.739239 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1564  FMN-binding domain-containing protein  35.45 
 
 
180 aa  50.8  0.000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1847  FMN-binding domain protein  29.08 
 
 
173 aa  48.5  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000189195 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5380  FMN-binding domain protein  29.08 
 
 
173 aa  48.5  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.17391 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0417  FMN-binding  29.24 
 
 
179 aa  48.5  0.00005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000846474  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01729  signal peptide protein  40.3 
 
 
186 aa  47  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3432  FMN-binding domain-containing protein  30.77 
 
 
149 aa  46.6  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.953268  normal  0.193685 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1887  FMN-binding domain protein  37.62 
 
 
186 aa  45.8  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00905192  normal  0.670131 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1558  FMN-binding domain protein  37.62 
 
 
186 aa  45.8  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.335211 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1799  FMN-binding domain protein  34.57 
 
 
184 aa  44.3  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.0000508928  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>