31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_4034 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_4034  FMN-binding domain-containing protein  100 
 
 		 176 aa  362  1e-99  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2015  FMN-binding domain-containing protein  80.54 
 
 		 191 aa  253  9e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3890  FMN-binding domain-containing protein  67.07 
 
 		 189 aa  227  8e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00153293  normal  0.0179558 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0711  FMN-binding domain-containing protein  63.47 
 
 		 173 aa  224  3e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000470992  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3121  FMN-binding domain-containing protein  68.32 
 
 		 171 aa  224  4e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.132086  unclonable  0.00000402249 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3789  FMN-binding domain-containing protein  61.99 
 
 		 175 aa  224  7e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000077872  decreased coverage  0.000000492054 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0639  FMN-binding  68.15 
 
 		 176 aa  218  5e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000261865  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0588  FMN-binding  68.03 
 
 		 169 aa  202  2e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00870871  decreased coverage  0.000120733 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4601  hypothetical protein  46.34 
 
 		 170 aa  163  1.0000000000000001e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2436  hypothetical protein  43.15 
 
 		 181 aa  137  7e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000527429  normal  0.0196691 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1316  FMN-binding  44.85 
 
 		 182 aa  124  5e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000101636  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0921  FMN-binding domain-containing protein  31.18 
 
 		 183 aa  56.6  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00888668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0920  FMN-binding domain-containing protein  31.18 
 
 		 183 aa  56.6  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0051552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0417  FMN-binding  28.74 
 
 		 179 aa  55.8  0.0000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000846474  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0956  FMN-binding domain-containing protein  31.18 
 
 		 183 aa  55.8  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0275776  normal  0.549187 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3458  FMN-binding domain-containing protein  30.18 
 
 		 184 aa  55.5  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000627682  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1833  FMN-binding domain protein  37.18 
 
 		 192 aa  55.5  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.653717  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2656  putative signal peptide protein  40 
 
 		 183 aa  55.1  0.0000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000219967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0709  putative signal peptide protein  29.34 
 
 		 181 aa  54.7  0.0000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.549423  normal  0.030053 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0905  FMN-binding domain-containing protein  29.59 
 
 		 184 aa  54.3  0.0000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000303402  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1564  FMN-binding domain-containing protein  37.11 
 
 		 180 aa  51.2  0.000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0610  putative signal peptide protein  29.14 
 
 		 171 aa  48.1  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.739239 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1847  FMN-binding domain protein  28.39 
 
 		 173 aa  48.1  0.00006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000189195 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5380  FMN-binding domain protein  28.39 
 
 		 173 aa  48.1  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.17391 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3432  FMN-binding domain-containing protein  29.82 
 
 		 149 aa  45.1  0.0006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.953268  normal  0.193685 
 
 
-
 
NC_003296  RS01729  signal peptide protein  35.96 
 
 		 186 aa  45.1  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2626  hypothetical protein  33.66 
 
 		 152 aa  43.9  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.240318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1887  FMN-binding domain protein  33.03 
 
 		 186 aa  43.1  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00905192  normal  0.670131 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1558  FMN-binding domain protein  33.03 
 
 		 186 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.335211 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2869  FMN-binding domain protein  32.58 
 
 		 382 aa  42.7  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00242086  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1179  FMN-binding  27.22 
 
 		 173 aa  40.8  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>