58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0709 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_0709  putative signal peptide protein  100 
 
 		 181 aa  371  1e-102  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.549423  normal  0.030053 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0417  FMN-binding  46.29 
 
 		 179 aa  177  7e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000846474  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0956  FMN-binding domain-containing protein  46.95 
 
 		 183 aa  176  2e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0275776  normal  0.549187 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0610  putative signal peptide protein  51.43 
 
 		 171 aa  176  2e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.739239 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0905  FMN-binding domain-containing protein  46.67 
 
 		 184 aa  175  2e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000303402  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3458  FMN-binding domain-containing protein  46.67 
 
 		 184 aa  175  3e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000627682  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0921  FMN-binding domain-containing protein  46.95 
 
 		 183 aa  175  3e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00888668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0920  FMN-binding domain-containing protein  46.95 
 
 		 183 aa  175  3e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0051552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1799  FMN-binding domain protein  49.71 
 
 		 184 aa  175  4e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.0000508928  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2656  putative signal peptide protein  49.02 
 
 		 183 aa  171  5e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000219967  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1558  FMN-binding domain protein  47.98 
 
 		 186 aa  160  1e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.335211 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1887  FMN-binding domain protein  48.55 
 
 		 186 aa  157  8e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00905192  normal  0.670131 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5380  FMN-binding domain protein  50.64 
 
 		 173 aa  154  8e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.17391 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1847  FMN-binding domain protein  50.64 
 
 		 173 aa  154  8e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000189195 
 
 
-
 
NC_003296  RS01729  signal peptide protein  47.93 
 
 		 186 aa  153  1e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1179  FMN-binding  48.3 
 
 		 173 aa  151  4e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1564  FMN-binding domain-containing protein  44.58 
 
 		 180 aa  146  2.0000000000000003e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0361  FMN-binding domain protein  42.86 
 
 		 168 aa  140  8e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.221019 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2626  hypothetical protein  42.69 
 
 		 152 aa  124  7e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.240318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3432  FMN-binding domain-containing protein  37.71 
 
 		 149 aa  119  1.9999999999999998e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.953268  normal  0.193685 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1833  FMN-binding domain protein  32.53 
 
 		 192 aa  82.4  0.000000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.653717  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4034  FMN-binding domain-containing protein  29.12 
 
 		 176 aa  58.9  0.00000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1083  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  30.46 
 
 		 368 aa  59.3  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0590058 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0652  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  29.65 
 
 		 580 aa  58.5  0.00000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.200112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2246  hypothetical protein  30.77 
 
 		 187 aa  58.5  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.246047 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0639  FMN-binding  31.93 
 
 		 176 aa  57.4  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000261865  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0344  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  29.59 
 
 		 185 aa  56.6  0.0000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1316  FMN-binding  31.48 
 
 		 182 aa  56.6  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000101636  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0711  FMN-binding domain-containing protein  31.69 
 
 		 173 aa  55.8  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000470992  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0978  FMN-binding domain protein  38.16 
 
 		 185 aa  56.2  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.224949 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2015  FMN-binding domain-containing protein  29.63 
 
 		 191 aa  55.5  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1185  hypothetical protein  24.84 
 
 		 166 aa  54.7  0.0000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3890  FMN-binding domain-containing protein  34.13 
 
 		 189 aa  53.1  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00153293  normal  0.0179558 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0588  FMN-binding  30.29 
 
 		 169 aa  53.5  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00870871  decreased coverage  0.000120733 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3789  FMN-binding domain-containing protein  34.4 
 
 		 175 aa  52  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000077872  decreased coverage  0.000000492054 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1568  hypothetical protein  29.33 
 
 		 184 aa  52  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4601  hypothetical protein  31.13 
 
 		 170 aa  51.2  0.000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0694  FMN-binding domain protein  31.68 
 
 		 391 aa  51.6  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0496  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  38.16 
 
 		 177 aa  50.8  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00037002  hitchhiker  0.000327646 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2972  hypothetical protein  25.7 
 
 		 195 aa  49.7  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000219791  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0081  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  25.89 
 
 		 193 aa  49.7  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0628211  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2383  FMN-binding domain protein  29.33 
 
 		 184 aa  49.3  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.877175  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3121  FMN-binding domain-containing protein  28.65 
 
 		 171 aa  48.9  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.132086  unclonable  0.00000402249 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1903  hypothetical protein  30.07 
 
 		 164 aa  48.9  0.00004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2869  FMN-binding domain protein  26.72 
 
 		 382 aa  48.1  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00242086  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2295  hypothetical protein  28.67 
 
 		 184 aa  47.8  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.340312  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0308  FMN-binding domain-containing protein  29.77 
 
 		 199 aa  47  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0470915  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0717  FMN-binding domain protein  28.7 
 
 		 393 aa  46.2  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0836  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase, C subunit  25.66 
 
 		 189 aa  46.2  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.294872  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0934  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  32.48 
 
 		 233 aa  44.3  0.0009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2436  hypothetical protein  26.78 
 
 		 181 aa  44.3  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000527429  normal  0.0196691 
 
 
-
 
NC_002936  DET1596  transcriptional regulator, putative  28.72 
 
 		 397 aa  43.5  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000252282  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0738  FMN-binding domain protein  27.66 
 
 		 392 aa  42.7  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000701173  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1691  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  27.78 
 
 		 258 aa  41.6  0.006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.517966  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0697  FMN-binding domain protein  34.57 
 
 		 201 aa  41.6  0.006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.820437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3303  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  27.27 
 
 		 266 aa  41.2  0.007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1343  FMN-binding domain-containing protein  27.66 
 
 		 397 aa  41.2  0.009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.000000579258  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3164  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit C  27.27 
 
 		 266 aa  40.8  0.01  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.787617  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>