49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS01729 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS01729  signal peptide protein  100 
 
 		 186 aa  374  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1887  FMN-binding domain protein  80 
 
 		 186 aa  311  3.9999999999999997e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00905192  normal  0.670131 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1558  FMN-binding domain protein  80 
 
 		 186 aa  309  2e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.335211 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0905  FMN-binding domain-containing protein  47.59 
 
 		 184 aa  159  3e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000303402  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3458  FMN-binding domain-containing protein  47.59 
 
 		 184 aa  159  3e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000627682  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0920  FMN-binding domain-containing protein  46.01 
 
 		 183 aa  157  6e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0051552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0921  FMN-binding domain-containing protein  46.01 
 
 		 183 aa  157  6e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00888668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0956  FMN-binding domain-containing protein  45.4 
 
 		 183 aa  157  8e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0275776  normal  0.549187 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0709  putative signal peptide protein  49.02 
 
 		 181 aa  146  1.0000000000000001e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.549423  normal  0.030053 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1564  FMN-binding domain-containing protein  39.89 
 
 		 180 aa  142  3e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1799  FMN-binding domain protein  40.76 
 
 		 184 aa  140  9.999999999999999e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.0000508928  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1179  FMN-binding  45.78 
 
 		 173 aa  139  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0610  putative signal peptide protein  43.83 
 
 		 171 aa  139  3e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.739239 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2656  putative signal peptide protein  39.61 
 
 		 183 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000219967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1847  FMN-binding domain protein  44.59 
 
 		 173 aa  132  3e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000189195 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5380  FMN-binding domain protein  44.59 
 
 		 173 aa  132  3e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.17391 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0361  FMN-binding domain protein  43.23 
 
 		 168 aa  131  5e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.221019 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0417  FMN-binding  36.41 
 
 		 179 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000846474  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2626  hypothetical protein  42.67 
 
 		 152 aa  114  6e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.240318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3432  FMN-binding domain-containing protein  37.14 
 
 		 149 aa  110  9e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.953268  normal  0.193685 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1833  FMN-binding domain protein  32.4 
 
 		 192 aa  82.4  0.000000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.653717  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0652  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  30.67 
 
 		 580 aa  50.1  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.200112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1083  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  33.78 
 
 		 368 aa  50.4  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0590058 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2246  hypothetical protein  27.91 
 
 		 187 aa  49.3  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.246047 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3890  FMN-binding domain-containing protein  37.04 
 
 		 189 aa  49.7  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00153293  normal  0.0179558 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0978  FMN-binding domain protein  25 
 
 		 185 aa  48.9  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.224949 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1316  FMN-binding  37.08 
 
 		 182 aa  48.5  0.00006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000101636  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2383  FMN-binding domain protein  25.93 
 
 		 184 aa  48.1  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.877175  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1568  hypothetical protein  32.26 
 
 		 184 aa  48.1  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0639  FMN-binding  40.3 
 
 		 176 aa  46.6  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000261865  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0344  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  28.83 
 
 		 185 aa  47  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0588  FMN-binding  39.73 
 
 		 169 aa  46.2  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00870871  decreased coverage  0.000120733 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0907  FMN-binding domain protein  27.56 
 
 		 176 aa  46.2  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3789  FMN-binding domain-containing protein  26.44 
 
 		 175 aa  46.2  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000077872  decreased coverage  0.000000492054 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0308  FMN-binding domain-containing protein  28.23 
 
 		 199 aa  45.8  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0470915  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4034  FMN-binding domain-containing protein  35.96 
 
 		 176 aa  45.1  0.0006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2295  hypothetical protein  24.44 
 
 		 184 aa  44.3  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.340312  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1903  hypothetical protein  26.92 
 
 		 164 aa  44.3  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0711  FMN-binding domain-containing protein  37.84 
 
 		 173 aa  44.3  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000470992  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0836  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase, C subunit  25.95 
 
 		 189 aa  44.3  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.294872  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0694  FMN-binding domain protein  28.7 
 
 		 391 aa  43.5  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2015  FMN-binding domain-containing protein  38.36 
 
 		 191 aa  43.1  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1479  membrane bound regulatory protein, VcrC-like protein  28.68 
 
 		 397 aa  42.4  0.004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00732489  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1185  hypothetical protein  23.74 
 
 		 166 aa  42  0.006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2108  electron transport complex protein RnfG  31.31 
 
 		 208 aa  41.6  0.007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.220327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2277  electron transport complex protein RnfG  31.31 
 
 		 212 aa  41.6  0.007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.050891  normal  0.93229 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3121  FMN-binding domain-containing protein  39.68 
 
 		 171 aa  41.6  0.007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.132086  unclonable  0.00000402249 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2263  electron transport complex protein RnfG  31.31 
 
 		 208 aa  41.6  0.007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00083065  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4549  electron transport complex protein RnfG  31.31 
 
 		 208 aa  41.6  0.007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>