29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_1568 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_1568  hypothetical protein  100 
 
 
184 aa  355  1.9999999999999998e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2383  FMN-binding domain protein  94.81 
 
 
184 aa  291  4e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.877175  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2295  hypothetical protein  94.81 
 
 
184 aa  290  1e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.340312  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2246  hypothetical protein  73.29 
 
 
187 aa  234  4e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.246047 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2972  hypothetical protein  41.42 
 
 
195 aa  120  9.999999999999999e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000219791  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1903  hypothetical protein  42.74 
 
 
164 aa  102  4e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0907  FMN-binding domain protein  31.17 
 
 
176 aa  99.8  2e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1185  hypothetical protein  27.13 
 
 
166 aa  76.6  0.0000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0610  putative signal peptide protein  30.66 
 
 
171 aa  60.1  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.739239 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3458  FMN-binding domain-containing protein  26.54 
 
 
184 aa  52.4  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000627682  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0905  FMN-binding domain-containing protein  26.54 
 
 
184 aa  52.4  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000303402  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0920  FMN-binding domain-containing protein  26.62 
 
 
183 aa  52  0.000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0051552  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0956  FMN-binding domain-containing protein  26.62 
 
 
183 aa  52  0.000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0275776  normal  0.549187 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1887  FMN-binding domain protein  28.05 
 
 
186 aa  52  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00905192  normal  0.670131 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0921  FMN-binding domain-containing protein  26.62 
 
 
183 aa  52  0.000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00888668  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0709  putative signal peptide protein  29.33 
 
 
181 aa  51.6  0.000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.549423  normal  0.030053 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1558  FMN-binding domain protein  28.05 
 
 
186 aa  51.2  0.000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.335211 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2626  hypothetical protein  32.26 
 
 
152 aa  48.9  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.240318  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01729  signal peptide protein  31.58 
 
 
186 aa  48.9  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1833  FMN-binding domain protein  32.94 
 
 
192 aa  46.2  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.653717  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0978  FMN-binding domain protein  28.04 
 
 
185 aa  45.1  0.0007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.224949 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0361  FMN-binding domain protein  31.34 
 
 
168 aa  44.7  0.0008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.221019 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1799  FMN-binding domain protein  25 
 
 
184 aa  44.7  0.0008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.0000508928  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3432  FMN-binding domain-containing protein  33.33 
 
 
149 aa  44.3  0.0009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.953268  normal  0.193685 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1564  FMN-binding domain-containing protein  26.87 
 
 
180 aa  43.9  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2656  putative signal peptide protein  24.62 
 
 
183 aa  43.5  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000219967  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1847  FMN-binding domain protein  29.27 
 
 
173 aa  42.7  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000189195 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5380  FMN-binding domain protein  29.27 
 
 
173 aa  42.7  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.17391 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1083  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  25.53 
 
 
368 aa  42.4  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0590058 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>