125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_2172 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_2172  electron transport complex protein RnfG  100 
 
 		 208 aa  427  1e-119  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.179108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2068  electron transport complex protein RnfG  99.52 
 
 		 208 aa  424  1e-118  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00132342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1907  electron transport complex protein RnfG  99.52 
 
 		 208 aa  424  1e-118  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2512  electron transport complex protein RnfG  93.27 
 
 		 212 aa  385  1e-106  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4549  electron transport complex protein RnfG  87.98 
 
 		 208 aa  385  1e-106  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2263  electron transport complex protein RnfG  87.98 
 
 		 208 aa  385  1e-106  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00083065  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2108  electron transport complex protein RnfG  87.98 
 
 		 208 aa  385  1e-106  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.220327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2277  electron transport complex protein RnfG  87.98 
 
 		 212 aa  385  1e-106  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.050891  normal  0.93229 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2061  electron transport complex protein RnfG  88.46 
 
 		 208 aa  383  1e-105  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000406522  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1846  electron transport complex protein RnfG  88.46 
 
 		 208 aa  367  1e-101  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000030729  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2040  electron transport complex protein RnfG  68.6 
 
 		 208 aa  308  4e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.8254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2560  electron transport complex protein RnfG  63.77 
 
 		 208 aa  293  9e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0486766 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2357  electron transport complex protein RnfG  72.06 
 
 		 207 aa  286  2e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2070  electron transport complex protein RnfG  62.98 
 
 		 212 aa  285  4e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1834  electron transport complex protein RnfG  60 
 
 		 215 aa  278  5e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.856968  normal  0.105681 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2176  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  63.94 
 
 		 215 aa  265  5e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.193841  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002945  electron transport complex protein RnfG  60.1 
 
 		 210 aa  253  1.0000000000000001e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.564885  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02968  electron transport complex protein RnfG  57.97 
 
 		 212 aa  250  1e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1868  electron transport complex protein RnfG  58.33 
 
 		 210 aa  238  4e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.803831  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2195  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  53.23 
 
 		 259 aa  228  7e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.648995  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1867  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  53.73 
 
 		 217 aa  218  6e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0534  electron transport complex protein RnfG  59.61 
 
 		 209 aa  209  2e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000007202  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02733  electron transport complex protein RnfG  44.78 
 
 		 257 aa  204  6e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0734  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  48.76 
 
 		 211 aa  204  9e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.35811  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1920  electron transport complex protein RnfG  50 
 
 		 211 aa  199  3e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2969  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  46.83 
 
 		 215 aa  198  6e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2249  electron transport complex protein RnfG  50.79 
 
 		 209 aa  194  9e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000657737  normal  0.472384 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2011  electron transport complex protein RnfG  50.79 
 
 		 209 aa  194  9e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000172244  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1899  electron transport complex protein RnfG  50.26 
 
 		 209 aa  192  3e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00381532  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1565  electron transport complex protein RnfG  53.23 
 
 		 206 aa  191  7e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.896563  normal  0.099042 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1719  electron transport complex protein RnfG  53.23 
 
 		 206 aa  191  7e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.275661  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1887  electron transport complex protein RnfG  53.23 
 
 		 206 aa  191  7e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.169724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2236  electron transport complex protein RnfG  48.5 
 
 		 209 aa  190  1e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000312896 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1625  electron transport complex protein RnfG  52.69 
 
 		 206 aa  190  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.469993 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1553  electron transport complex protein RnfG  53.23 
 
 		 206 aa  190  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.86084  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2010  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  50 
 
 		 206 aa  188  5e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00233582  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1839  electron transport complex protein RnfG  50 
 
 		 206 aa  188  5e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00239547  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1820  electron transport complex protein RnfG  50 
 
 		 206 aa  188  5e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.953623  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2021  electron transport complex protein RnfG  47.62 
 
 		 209 aa  187  8e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2158  electron transport complex protein RnfG  49.21 
 
 		 210 aa  187  8e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.915166  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01601  electron transport complex protein RnfG  52.15 
 
 		 206 aa  187  1e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00338935  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01591  hypothetical protein  52.15 
 
 		 206 aa  187  1e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00493917  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1998  electron transport complex protein RnfG  52.15 
 
 		 206 aa  187  1e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0210205  normal  0.220533 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2343  electron transport complex protein RnfG  50.75 
 
 		 206 aa  187  1e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0100314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2404  electron transport complex protein RnfG  46.46 
 
 		 215 aa  186  2e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.59015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1541  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  45.41 
 
 		 205 aa  186  2e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.174651 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1707  electron transport complex protein RnfG  49.5 
 
 		 206 aa  186  2e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.116117  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1568  electron transport complex protein RnfG  52.15 
 
 		 206 aa  186  2e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.172689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18900  hypothetical protein  47.74 
 
 		 214 aa  185  4e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0705821  normal  0.0432187 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0934  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  45.27 
 
 		 233 aa  183  1.0000000000000001e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1636  hypothetical protein  46.23 
 
 		 213 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2321  electron transport complex protein RnfG  47.62 
 
 		 209 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1171  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  43.22 
 
 		 210 aa  181  6e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19230  Electron transport complex, subunit G  44.44 
 
 		 208 aa  181  1e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1400  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  46.7 
 
 		 211 aa  179  2e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.50013 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2897  electron transport complex, G subunit  44.44 
 
 		 212 aa  179  4e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.432539  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1817  electron transport complex protein RnfG  46.15 
 
 		 206 aa  178  4.999999999999999e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0386367  decreased coverage  0.000324023 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0812  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  45.31 
 
 		 220 aa  176  2e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.151893  normal  0.42525 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2630  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  43.75 
 
 		 233 aa  176  2e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2019  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  41.38 
 
 		 216 aa  169  2e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1032  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  42.13 
 
 		 217 aa  168  5e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000480333  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1063  electron transport complex protein RnfG  48.91 
 
 		 207 aa  164  6.9999999999999995e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.137113  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3196  RnfA-Nqr electron transport subunit  41.29 
 
 		 220 aa  162  3e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.401599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1159  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  40.59 
 
 		 222 aa  161  7e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2820  electron transport complex, G subunit  45.56 
 
 		 230 aa  156  2e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2993  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  39.9 
 
 		 218 aa  152  2e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3935  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  39.04 
 
 		 219 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00699897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1489  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  41.84 
 
 		 229 aa  145  4.0000000000000006e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.753633 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3196  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  38.67 
 
 		 219 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.314001  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0686  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  38.69 
 
 		 211 aa  144  1e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.320236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0287  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  40.62 
 
 		 222 aa  138  4.999999999999999e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0817829  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0722  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  40.21 
 
 		 224 aa  135  3.0000000000000003e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.271576  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1794  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  43.04 
 
 		 222 aa  135  5e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.956584  hitchhiker  0.000880554 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3236  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  34.31 
 
 		 222 aa  134  8e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.556232  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50940  Electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  38.54 
 
 		 229 aa  129  2.0000000000000002e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0444757  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1783  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  37.96 
 
 		 256 aa  128  5.0000000000000004e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4511  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  34.38 
 
 		 201 aa  109  3e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000304258 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1123  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  31.96 
 
 		 200 aa  99.4  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1094  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  34.29 
 
 		 200 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1531  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  32.28 
 
 		 181 aa  93.6  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00374795  normal  0.943593 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1134  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  33.71 
 
 		 200 aa  92.8  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4318  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  33.16 
 
 		 200 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1312  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  32.61 
 
 		 181 aa  89  4e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.777604  normal  0.23386 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0261  NADH:ubiquinone oxidoreductase, RnfG subunit-like  31.47 
 
 		 201 aa  88.2  7e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0986  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  38.94 
 
 		 181 aa  78.2  0.00000000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.625397  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1157  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  31.07 
 
 		 181 aa  76.6  0.0000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.40861 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1083  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  27.46 
 
 		 368 aa  70.9  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0590058 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0652  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  27.4 
 
 		 580 aa  64.3  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.200112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1958  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  35.78 
 
 		 193 aa  63.5  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.537285  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0306  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  27.18 
 
 		 215 aa  62.8  0.000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1093  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  26.37 
 
 		 178 aa  61.6  0.000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.997884  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0081  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  28.35 
 
 		 193 aa  60.8  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0628211  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1318  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  29.91 
 
 		 344 aa  59.7  0.00000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0617616  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0496  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  31.3 
 
 		 177 aa  59.3  0.00000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00037002  hitchhiker  0.000327646 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1240  FMN-binding domain protein  36.97 
 
 		 192 aa  57.8  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0308  FMN-binding domain-containing protein  34.07 
 
 		 199 aa  56.6  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0470915  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0344  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  28.8 
 
 		 185 aa  55.8  0.0000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0520  FMN-binding domain-containing protein  31.03 
 
 		 191 aa  53.1  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.273649 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0530  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  22.4 
 
 		 196 aa  53.5  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2432  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  34.44 
 
 		 197 aa  51.6  0.000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000744665  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>